seq1 = pF1KB6637.tfa, 1254 bp
seq2 = pF1KB6637/gi568815584r_94278452.tfa (gi568815584r:94278452_94483237), 204786 bp

>pF1KB6637 1254
>gi568815584r:94278452_94483237 (Chr14)

(complement)

1-646  (100001-100646)   100% ->
647-917  (102097-102367)   100% ->
918-1065  (103627-103774)   100% ->
1066-1254  (104598-104786)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGTCTTCTGTCTCGTGGGGCATCCTCCTGCTGGCAGGCCTGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGTCTTCTGTCTCGTGGGGCATCCTCCTGCTGGCAGGCCTGTGCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGGTCCCTGTCTCCCTGGCTGAGGATCCCCAGGGAGATGCTGCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGGTCCCTGTCTCCCTGGCTGAGGATCCCCAGGGAGATGCTGCCCAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGACAGATACATCCCACCATGATCAGGATCACCCAACCTTCAACAAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGACAGATACATCCCACCATGATCAGGATCACCCAACCTTCAACAAGATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACCCCCAACCTGGCTGAGTTCGCCTTCAGCCTATACCGCCAGCTGGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACCCCCAACCTGGCTGAGTTCGCCTTCAGCCTATACCGCCAGCTGGCACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCAGTCCAACAGCACCAATATCTTCTTCTCCCCAGTGAGCATCGCTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCAGTCCAACAGCACCAATATCTTCTTCTCCCCAGTGAGCATCGCTACAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCTTTGCAATGCTCTCCCTGGGGACCAAGGCTGACACTCACGATGAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCTTTGCAATGCTCTCCCTGGGGACCAAGGCTGACACTCACGATGAAATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGGAGGGCCTGAATTTCAACCTCACGGAGATTCCGGAGGCTCAGATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGGAGGGCCTGAATTTCAACCTCACGGAGATTCCGGAGGCTCAGATCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGAAGGCTTCCAGGAACTCCTCCGTACCCTCAACCAGCCAGACAGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGAAGGCTTCCAGGAACTCCTCCGTACCCTCAACCAGCCAGACAGCCAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCCAGCTGACCACCGGCAATGGCCTGTTCCTCAGCGAGGGCCTGAAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCCAGCTGACCACCGGCAATGGCCTGTTCCTCAGCGAGGGCCTGAAGCTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTGGATAAGTTTTTGGAGGATGTTAAAAAGTTGTACCACTCAGAAGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTGGATAAGTTTTTGGAGGATGTTAAAAAGTTGTACCACTCAGAAGCCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CACTGTCAACTTCGGGGACACCGAAGAGGCCAAGAAACAGATCAACGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CACTGTCAACTTCGGGGACACCGAAGAGGCCAAGAAACAGATCAACGATT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACGTGGAGAAGGGTACTCAAGGGAAAATTGTGGATTTGGTCAAGGAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACGTGGAGAAGGGTACTCAAGGGAAAATTGTGGATTTGGTCAAGGAGCTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GACAGAGACACAGTTTTTGCTCTGGTGAATTACATCTTCTTTAAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100601 GACAGAGACACAGTTTTTGCTCTGGTGAATTACATCTTCTTTAAAGGTA.

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647      GCAAATGGGAGAGACCCTTTGAAGTCAAGGACACCGAGGAAGAGG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 ..CAGGCAAATGGGAGAGACCCTTTGAAGTCAAGGACACCGAGGAAGAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 ACTTCCACGTGGACCAGGTGACCACCGTGAAGGTGCCTATGATGAAGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102142 ACTTCCACGTGGACCAGGTGACCACCGTGAAGGTGCCTATGATGAAGCGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 TTAGGCATGTTTAACATCCAGCACTGTAAGAAGCTGTCCAGCTGGGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102192 TTAGGCATGTTTAACATCCAGCACTGTAAGAAGCTGTCCAGCTGGGTGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GCTGATGAAATACCTGGGCAATGCCACCGCCATCTTCTTCCTGCCTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102242 GCTGATGAAATACCTGGGCAATGCCACCGCCATCTTCTTCCTGCCTGATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 AGGGGAAACTACAGCACCTGGAAAATGAACTCACCCACGATATCATCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102292 AGGGGAAACTACAGCACCTGGAAAATGAACTCACCCACGATATCATCACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 AAGTTCCTGGAAAATGAAGACAGAAG         GTCTGCCAGCTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 102342 AAGTTCCTGGAAAATGAAGACAGAAGGTG...CAGGTCTGCCAGCTTACA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 TTTACCCAAACTGTCCATTACTGGAACCTATGATCTGAAGAGCGTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103642 TTTACCCAAACTGTCCATTACTGGAACCTATGATCTGAAGAGCGTCCTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 GTCAACTGGGCATCACTAAGGTCTTCAGCAATGGGGCTGACCTCTCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103692 GTCAACTGGGCATCACTAAGGTCTTCAGCAATGGGGCTGACCTCTCCGGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 GTCACAGAGGAGGCACCCCTGAAGCTCTCCAAG         GCCGTGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 103742 GTCACAGAGGAGGCACCCCTGAAGCTCTCCAAGGTG...CAGGCCGTGCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 TAAGGCTGTGCTGACCATCGACGAGAAAGGGACTGAAGCTGCTGGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104606 TAAGGCTGTGCTGACCATCGACGAGAAAGGGACTGAAGCTGCTGGGGCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 TGTTTTTAGAGGCCATACCCATGTCTATCCCCCCCGAGGTCAAGTTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104656 TGTTTTTAGAGGCCATACCCATGTCTATCCCCCCCGAGGTCAAGTTCAAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 AAACCCTTTGTCTTCTTAATGATTGAACAAAATACCAAGTCTCCCCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104706 AAACCCTTTGTCTTCTTAATGATTGAACAAAATACCAAGTCTCCCCTCTT

   1250     .    :    .    :    .    :
   1224 CATGGGAAAAGTGGTGAATCCCACCCAAAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 104756 CATGGGAAAAGTGGTGAATCCCACCCAAAAA