seq1 = pF1KB6633.tfa, 1251 bp
seq2 = pF1KB6633/gi568815593r_121970050.tfa (gi568815593r:121970050_122177985), 207936 bp

>pF1KB6633 1251
>gi568815593r:121970050_122177985 (Chr5)

(complement)

1-631  (100001-100631)   100% ->
632-740  (100985-101093)   100% ->
741-878  (102445-102582)   100% ->
879-1035  (103817-103973)   100% ->
1036-1131  (107397-107492)   100% ->
1132-1251  (107818-107936)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGCTTCGCCTGGACCGTGCTCCTGCTCGGGCCTTTGCAGCTCTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCGCTTCGCCTGGACCGTGCTCCTGCTCGGGCCTTTGCAGCTCTGCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTAGTGCACTGCGCCCCTCCCGCCGCCGGCCAACAGCAGCCCCCGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTAGTGCACTGCGCCCCTCCCGCCGCCGGCCAACAGCAGCCCCCGCGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCCGCCGGCGGCTCCGGGCGCCTGGCGCCAGCAGATCCAATGGGAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCCGCCGGCGGCTCCGGGCGCCTGGCGCCAGCAGATCCAATGGGAGAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AACGGGCAGGTGTTCAGCTTGCTGAGCCTGGGCTCACAGTACCAGCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AACGGGCAGGTGTTCAGCTTGCTGAGCCTGGGCTCACAGTACCAGCCTCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCGCCGCCGGGACCCGGGCGCCGCCGTCCCTGGTGCAGCCAACGCCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCGCCGCCGGGACCCGGGCGCCGCCGTCCCTGGTGCAGCCAACGCCTCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCCAGCAGCCCCGCACTCCGATCCTGCTGATCCGCGACAACCGCACCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCCAGCAGCCCCGCACTCCGATCCTGCTGATCCGCGACAACCGCACCGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCGGCGCGAACGCGGACGGCCGGCTCATCTGGAGTCACCGCTGGCCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCGGCGCGAACGCGGACGGCCGGCTCATCTGGAGTCACCGCTGGCCGCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAGGCCCACCGCCCGTCACTGGTTCCAAGCTGGCTACTCGACATCTAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAGGCCCACCGCCCGTCACTGGTTCCAAGCTGGCTACTCGACATCTAGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCCGCGAAGCTGGCGCCTCGCGCGCGGAGAACCAGACAGCGCCGGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCCGCGAAGCTGGCGCCTCGCGCGCGGAGAACCAGACAGCGCCGGGAGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTTCCTGCGCTCAGTAACCTGCGGCCGCCCAGCCGCGTGGACGGCATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTTCCTGCGCTCAGTAACCTGCGGCCGCCCAGCCGCGTGGACGGCATGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGGCGACGACCCTTACAACCCCTACAAGTACTCTGACGACAACCCTTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGGCGACGACCCTTACAACCCCTACAAGTACTCTGACGACAACCCTTATT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACAACTACTACGATACTTATGAAAGGCCCAGACCTGGGGGCAGGTACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACAACTACTACGATACTTATGAAAGGCCCAGACCTGGGGGCAGGTACCGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCCGGATACGGCACTGGCTACTTCCAGTACG         GTCTCCCAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100601 CCCGGATACGGCACTGGCTACTTCCAGTACGGTA...TAGGTCTCCCAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CCTGGTGGCCGACCCCTACTACATCCAGGCGTCCACGTACGTGCAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100995 CCTGGTGGCCGACCCCTACTACATCCAGGCGTCCACGTACGTGCAGAAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGTCCATGTACAACCTGAGATGCGCGGCGGAGGAAAACTGTCTGGCCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 101045 TGTCCATGTACAACCTGAGATGCGCGGCGGAGGAAAACTGTCTGGCCAGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    741         TACAGCATACAGGGCAGATGTCAGAGATTATGATCACAGGGT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101095 TA...CAGTACAGCATACAGGGCAGATGTCAGAGATTATGATCACAGGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 GCTGCTCAGATTTCCCCAAAGAGTGAAAAACCAAGGGACATCAGATTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102487 GCTGCTCAGATTTCCCCAAAGAGTGAAAAACCAAGGGACATCAGATTTCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 TACCCAGCCGACCAAGATATTCCTGGGAATGGCACAGTTGTCATCA    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 102537 TACCCAGCCGACCAAGATATTCCTGGGAATGGCACAGTTGTCATCAGTA.

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879      ACATTACCACAGTATGGATGAGTTTAGCCACTATGACCTGCTTGA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102587 ..CAGACATTACCACAGTATGGATGAGTTTAGCCACTATGACCTGCTTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 TGCCAACACCCAGAGGAGAGTGGCTGAAGGCCACAAAGCAAGTTTCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103862 TGCCAACACCCAGAGGAGAGTGGCTGAAGGCCACAAAGCAAGTTTCTGTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 TTGAAGACACATCCTGTGACTATGGCTACCACAGGCGATTTGCATGTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103912 TTGAAGACACATCCTGTGACTATGGCTACCACAGGCGATTTGCATGTACT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 GCACACACACAG         GGATTGAGTCCTGGCTGTTATGATACCTA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 103962 GCACACACACAGGTA...TAGGGATTGAGTCCTGGCTGTTATGATACCTA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 TGGTGCAGACATAGACTGCCAGTGGATTGATATTACAGATGTAAAACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107426 TGGTGCAGACATAGACTGCCAGTGGATTGATATTACAGATGTAAAACCTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 GAAACTATATCCTAAAG         GTCAGTGTAAACCCCAGCTACCTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 107476 GAAACTATATCCTAAAGGTA...CAGGTCAGTGTAAACCCCAGCTACCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 GTTCCTGAATCTGACTATACCAACAATGTTGTGCGCTGTGACATTCGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107842 GTTCCTGAATCTGACTATACCAACAATGTTGTGCGCTGTGACATTCGCTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1206 CACAGGACATCATGCGTATGCCTCAGGCTGCACAATTTCACCGTAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-
 107892 CACAGGACATCATGCGTATGCCTCAGGCTGCACAATTTCACCGTA