seq1 = pF1KB6628.tfa, 1218 bp
seq2 = pF1KB6628/gi568815584r_22801813.tfa (gi568815584r:22801813_23011393), 209581 bp

>pF1KB6628 1218
>gi568815584r:22801813_23011393 (Chr14)

(complement)

1-66  (100001-100066)   100% ->
67-179  (101799-101911)   100% ->
180-353  (105026-105199)   100% ->
354-471  (105941-106058)   100% ->
472-624  (106148-106300)   99% ->
625-762  (106382-106519)   100% ->
763-828  (107068-107133)   100% ->
829-1024  (109012-109207)   100% ->
1025-1147  (109295-109414)   97% ->
1148-1218  (109511-109581)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCATCTGATGACTTTGACATAGTGATTGAGGCCATGCTGGAAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCATCTGATGACTTTGACATAGTGATTGAGGCCATGCTGGAAGCTCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTATAAAAAAGAAGAG         GATGAGCAACAAAGGAAAGAAGTTA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100051 CTATAAAAAAGAAGAGGTA...CAGGATGAGCAACAAAGGAAAGAAGTTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAAAGGATTATCCTAGCAATACCACCAGCAGCACCAGCAACAGTGGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101824 AAAAGGATTATCCTAGCAATACCACCAGCAGCACCAGCAACAGTGGCAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGACCAGTGGAAGCAGCACCATCGGGGAGACAAGCAA         TCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 101874 GAGACCAGTGGAAGCAGCACCATCGGGGAGACAAGCAAGTG...TAGTCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TAGTCGAGATCGGGATCGGTATAGACGGAGAAATAGTCGGAGCCGAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105029 TAGTCGAGATCGGGATCGGTATAGACGGAGAAATAGTCGGAGCCGAAGTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CAGGTCGGCAGTGTCGTCACCGTAGCCGTAGCTGGGATCGTCGACATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105079 CAGGTCGGCAGTGTCGTCACCGTAGCCGTAGCTGGGATCGTCGACATGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGTGAGTCGCGAAGTCGGGACCATCGTCGTGAGGATCGTGTGCATTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105129 AGTGAGTCGCGAAGTCGGGACCATCGTCGTGAGGATCGTGTGCATTACAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAGTCCTCCACTTGCCACTGG         GGAGCCAGTTGATAATCTGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 105179 GAGTCCTCCACTTGCCACTGGGTA...CAGGGAGCCAGTTGATAATCTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GTCCTGAGGAGCGTGATGCCCGCACAGTTTTCTGTATGCAGTTAGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105961 GTCCTGAGGAGCGTGATGCCCGCACAGTTTTCTGTATGCAGTTAGCTGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CGAATTCGGCCTCGAGATCTGGAGGACTTTTTCTCTGCTGTAGGCAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 106011 CGAATTCGGCCTCGAGATCTGGAGGACTTTTTCTCTGCTGTAGGCAAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    472        GTTCGCGATGTACGTATCATTTCAGATCGGAACTCACGTCGTT
        >...>>>|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 106061 A...TAGGTTCGCGATGTACGTATCATCTCAGATCGGAACTCACGTCGTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CTAAGGGCATTGCCTACGTGGAATTCTGTGAAATCCAGTCTGTGCCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106191 CTAAGGGCATTGCCTACGTGGAATTCTGTGAAATCCAGTCTGTGCCACTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GCCATTGGGCTGACTGGGCAGCGGTTGCTGGGAGTGCCTATCATTGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106241 GCCATTGGGCTGACTGGGCAGCGGTTGCTGGGAGTGCCTATCATTGTACA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GGCTTCACAG         GCAGAGAAAAACCGACTGGCAGCCATGGCCA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 106291 GGCTTCACAGGTG...CAGGCAGAGAAAAACCGACTGGCAGCCATGGCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ACAACCTGCAAAAGGGCAATGGTGGACCAATGCGCCTCTATGTGGGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106413 ACAACCTGCAAAAGGGCAATGGTGGACCAATGCGCCTCTATGTGGGTTCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CTGCACTTCAATATCACTGAAGACATGCTCCGGGGCATCTTTGAGCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106463 CTGCACTTCAATATCACTGAAGACATGCTCCGGGGCATCTTTGAGCCCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGGTAAA         ATTGATAATATTGTCCTGATGAAGGACTCAGATA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106513 TGGTAAAGTG...CAGATTGATAATATTGTCCTGATGAAGGACTCAGATA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CAGGCCGCTCTAAAGGTTATGGTTTCATCACG         TTCTCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 107102 CAGGCCGCTCTAAAGGTTATGGTTTCATCACGGTG...TAGTTCTCTGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 TCTGAGTGTGCCCGGCGGGCCCTGGAACAGTTGAATGGGTTTGAGCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109021 TCTGAGTGTGCCCGGCGGGCCCTGGAACAGTTGAATGGGTTTGAGCTTGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TGGTCGACCTATGAGGGTTGGCCATGTGACTGAGCGACTGGATGGTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109071 TGGTCGACCTATGAGGGTTGGCCATGTGACTGAGCGACTGGATGGTGGCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CAGACATCACTTTTCCTGATGGGGACCAGGAGCTGGATCTGGGATCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109121 CAGACATCACTTTTCCTGATGGGGACCAGGAGCTGGATCTGGGATCAGCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GGTGGACGTTTTCAGCTCATGGCAAAACTGGCAGAAG         GCGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 109171 GGTGGACGTTTTCAGCTCATGGCAAAACTGGCAGAAGGTA...TAGGCGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TGGAATCCAACTGCCAAGCACTGCTGCTGCTGCTGCTGCCGCCGCCGCCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||---||||||||||
 109299 TGGAATCCAACTGCCAAGCACTGCTGCTGCTGCTGCT   GCCGCCGCCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 CCCAGGCTGCTGCCTTGCAACTGAATGGAGCAGTTCCCTTGGGGGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109346 CCCAGGCTGCTGCCTTGCAACTGAATGGAGCAGTTCCCTTGGGGGCCCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 AATCCAGCAGCTCTGACTG         CTCTGAGTCCAGCCCTGAACCT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 109396 AATCCAGCAGCTCTGACTGGTA...TAGCTCTGAGTCCAGCCCTGAACCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1170 TGCCTCCCAGTGTTTGCAGCTCTCCAGCCTCTTTACCCCCCAGACCATG
        ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 109533 TGCCTCCCAGTGTTTCCAGCTCTCCAGCCTCTTTACCCCCCAGACCATG