seq1 = pF1KB6627.tfa, 1245 bp
seq2 = pF1KB6627/gi568815580f_63791445.tfa (gi568815580f:63791445_64003302), 211858 bp

>pF1KB6627 1245
>gi568815580f:63791445_64003302 (Chr18)

1-168  (100001-100168)   100% ->
169-288  (103820-103939)   100% ->
289-417  (105647-105775)   100% ->
418-535  (106283-106400)   100% ->
536-678  (110296-110438)   100% ->
679-843  (110960-111124)   100% ->
844-1245  (111457-111858)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGATCTTTGTGTGGCAAACACACTCTTTGCCCTCAATTTATTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGATCTTTGTGTGGCAAACACACTCTTTGCCCTCAATTTATTCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCATCTGGCAAAAGCAAGCCCCACCCAGAACCTCTTCCTCTCCCCATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCATCTGGCAAAAGCAAGCCCCACCCAGAACCTCTTCCTCTCCCCATGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCATCTCGTCCACCATGGCCATGGTCTACATGGGCTCCAGGGGCAGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCATCTCGTCCACCATGGCCATGGTCTACATGGGCTCCAGGGGCAGCACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAAGACCAGATGGCCAAG         GTGCTTCAGTTTAATGAAGTGGG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100151 GAAGACCAGATGGCCAAGGTG...CAGGTGCTTCAGTTTAATGAAGTGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGCCAATGCAGTTACCCCCATGACTCCAGAGAACTTTACCAGCTGTGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103843 AGCCAATGCAGTTACCCCCATGACTCCAGAGAACTTTACCAGCTGTGGGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCATGCAGCAGATCCAGAAGGGTAGTTATCCTGATGCGATTTTGCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 103893 TCATGCAGCAGATCCAGAAGGGTAGTTATCCTGATGCGATTTTGCAGGTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    289       GCACAAGCTGCAGATAAAATCCATTCATCCTTCCGCTCTCTCAG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103943 ...AAGGCACAAGCTGCAGATAAAATCCATTCATCCTTCCGCTCTCTCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CTCTGCAATCAATGCATCCACAGGGAATTATTTACTGGAAAGTGTCAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105691 CTCTGCAATCAATGCATCCACAGGGAATTATTTACTGGAAAGTGTCAATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGCTGTTTGGTGAGAAGTCTGCGAGCTTCCGGGAA         GAATAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 105741 AGCTGTTTGGTGAGAAGTCTGCGAGCTTCCGGGAAGTA...AAGGAATAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATTCGACTCTGTCAGAAATATTACTCCTCAGAACCCCAGGCAGTAGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106289 ATTCGACTCTGTCAGAAATATTACTCCTCAGAACCCCAGGCAGTAGACTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCTAGAATGTGCAGAAGAAGCTAGAAAAAAGATTAATTCCTGGGTCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106339 CCTAGAATGTGCAGAAGAAGCTAGAAAAAAGATTAATTCCTGGGTCAAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTCAAACCAAAG         GCAAAATCCCAAACTTGTTACCTGAAGGT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 106389 CTCAAACCAAAGGTA...TAGGCAAAATCCCAAACTTGTTACCTGAAGGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TCTGTAGATGGGGATACCAGGATGGTCCTGGTGAATGCTGTCTACTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110325 TCTGTAGATGGGGATACCAGGATGGTCCTGGTGAATGCTGTCTACTTCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AGGAAAGTGGAAAACTCCATTTGAGAAGAAACTAAATGGGCTTTATCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110375 AGGAAAGTGGAAAACTCCATTTGAGAAGAAACTAAATGGGCTTTATCCTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TCCGTGTAAACTCG         GCTCAGCGCACACCTGTACAGATGATG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 110425 TCCGTGTAAACTCGGTA...TAGGCTCAGCGCACACCTGTACAGATGATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TACTTGCGTGAAAAGCTAAACATTGGATACATAGAAGACCTAAAGGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110987 TACTTGCGTGAAAAGCTAAACATTGGATACATAGAAGACCTAAAGGCTCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GATTCTAGAACTCCCATATGCTGGAGATGTTAGCATGTTCTTGTTGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111037 GATTCTAGAACTCCCATATGCTGGAGATGTTAGCATGTTCTTGTTGCTTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CAGATGAAATTGCCGATGTGTCCACTGGCTTGGAGCTG         CTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 111087 CAGATGAAATTGCCGATGTGTCCACTGGCTTGGAGCTGGTA...CAGCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GAAAGTGAAATAACCTATGACAAACTCAACAAGTGGACCAGCAAAGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111460 GAAAGTGAAATAACCTATGACAAACTCAACAAGTGGACCAGCAAAGACAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AATGGCTGAAGATGAAGTTGAGGTATACATACCCCAGTTCAAATTAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111510 AATGGCTGAAGATGAAGTTGAGGTATACATACCCCAGTTCAAATTAGAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 AGCATTATGAACTCAGATCCATTCTGAGAAGCATGGGCATGGAGGACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111560 AGCATTATGAACTCAGATCCATTCTGAGAAGCATGGGCATGGAGGACGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 TTCAACAAGGGACGGGCCAATTTCTCAGGGATGTCGGAGAGGAATGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111610 TTCAACAAGGGACGGGCCAATTTCTCAGGGATGTCGGAGAGGAATGACCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GTTTCTTTCTGAAGTGTTCCACCAAGCCATGGTGGATGTGAATGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111660 GTTTCTTTCTGAAGTGTTCCACCAAGCCATGGTGGATGTGAATGAGGAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 GCACTGAAGCAGCCGCTGGCACAGGAGGTGTTATGACAGGGAGAACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111710 GCACTGAAGCAGCCGCTGGCACAGGAGGTGTTATGACAGGGAGAACTGGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 CATGGAGGCCCACAGTTTGTGGCAGATCATCCTTTTCTTTTTCTTATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111760 CATGGAGGCCCACAGTTTGTGGCAGATCATCCTTTTCTTTTTCTTATTAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1197 GCATAAGATAACCAACTGCATTTTATTTTTCGGCAGATTTTCCTCACCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111810 GCATAAGATAACCAACTGCATTTTATTTTTCGGCAGATTTTCCTCACCC