seq1 = pF1KB6615.tfa, 1236 bp
seq2 = pF1KB6615/gi568815590f_144409334.tfa (gi568815590f:144409334_144611161), 201828 bp

>pF1KB6615 1236
>gi568815590f:144409334_144611161 (Chr8)

1-682  (100001-100682)   100% ->
683-830  (101027-101174)   100% ->
831-955  (101265-101389)   100% ->
956-1065  (101461-101570)   100% ->
1066-1236  (101658-101828)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGCGGGAAGTTGCTGCCGCTGGCCGGCCTCTACCTGGTGCAGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCGCGGGAAGTTGCTGCCGCTGGCCGGCCTCTACCTGGTGCAGGGCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCCTACGGGCTCCAGTCCGGCCTCCTGCCAGTGCTGCTGCGTGCCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCCTACGGGCTCCAGTCCGGCCTCCTGCCAGTGCTGCTGCGTGCCGGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCTCTCGCTGACGCGCGTGGGGCTGGCCAAGGTTCTGTACGCTCCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCTCTCGCTGACGCGCGTGGGGCTGGCCAAGGTTCTGTACGCTCCGTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGCTCAAGCTGGCTTGGGCCCCGCTGGTGGACGCGCAGGGCTCGGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGCTCAAGCTGGCTTGGGCCCCGCTGGTGGACGCGCAGGGCTCGGCGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGCCTGGGTGACGCGCAGCACGGCGGGCCTGGGCCTGGTGTGTGGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGCCTGGGTGACGCGCAGCACGGCGGGCCTGGGCCTGGTGTGTGGGCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTGCCGGGCTGCCCCCTCCTGGAGCTGGCCAGGCCGGGCTGCCCGCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTGCCGGGCTGCCCCCTCCTGGAGCTGGCCAGGCCGGGCTGCCCGCCGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTGGCGGGGTTGCTGCTGTTGTTGAACCTGGGTGCCGCCATGCAGGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTGGCGGGGTTGCTGCTGTTGTTGAACCTGGGTGCCGCCATGCAGGATGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCCCTGGACGCGCTGGCTGTGCAGCTGCTGGAGCCGGCCGAACTGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCCCTGGACGCGCTGGCTGTGCAGCTGCTGGAGCCGGCCGAACTGGGGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CGGGCAATACCGTGCAGGTGGTCGCGTACAAGCTGGGGGCCGCGCTAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CGGGCAATACCGTGCAGGTGGTCGCGTACAAGCTGGGGGCCGCGCTAGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGGGGCGCGCTGCTGGCGCTGCTGCCCACCTTCTCGTGGCCGCAACTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGGGGCGCGCTGCTGGCGCTGCTGCCCACCTTCTCGTGGCCGCAACTCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TCTGCTCCTGGCTGCCACCTACTGGCTGGCCGCGGCCCTGGCCTGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TCTGCTCCTGGCTGCCACCTACTGGCTGGCCGCGGCCCTGGCCTGGGCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CACCAGCCCTGCGGCGGCTCCCACAGCAGCCCCCTTCCGAGCAGCGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CACCAGCCCTGCGGCGGCTCCCACAGCAGCCCCCTTCCGAGCAGCGTCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CACACCGCGCACCTTCTGCGGGACGTGCTAGCCGTGCCGGGGACCGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CACACCGCGCACCTTCTGCGGGACGTGCTAGCCGTGCCGGGGACCGTGTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GACGGCAGGCTTTGTGCTCACCTACAAGCTGG         GTGAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100651 GACGGCAGGCTTTGTGCTCACCTACAAGCTGGGTG...AAGGTGAGCAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GTGCCAGCAGCCTGTTTCCTCTTCTCCTGCTGGACCACGGCGTTTCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101036 GTGCCAGCAGCCTGTTTCCTCTTCTCCTGCTGGACCACGGCGTTTCTGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CCCGAGTTGGGACTGTGGAATGGTGTGGGTGCTGTGGTCTGCTCCATCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101086 CCCGAGTTGGGACTGTGGAATGGTGTGGGTGCTGTGGTCTGCTCCATCGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TGGCTCCTCCCTGGGTGGGACCTTGCTGGCCAAGCACTG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 101136 TGGCTCCTCCCTGGGTGGGACCTTGCTGGCCAAGCACTGGTG...CAGGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 AACTGCTGCCTCTGTTGAGGTCGGTGCTGCGCTTCCGCCTCGGGGGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101267 AACTGCTGCCTCTGTTGAGGTCGGTGCTGCGCTTCCGCCTCGGGGGCCTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 GCCTGTCAGACTGCCTTGGTCTTCCACCTGGACACCCTGGGGGCCAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101317 GCCTGTCAGACTGCCTTGGTCTTCCACCTGGACACCCTGGGGGCCAGCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 GGACGCTGGCACAATCTTGAGAG         GGTCAGCCTTGCTGAGCC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 101367 GGACGCTGGCACAATCTTGAGAGGTG...CAGGGTCAGCCTTGCTGAGCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 TATGTCTGCAGCACTTCTTGGGAGGCCTGGTCACCACAGTCACCTTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101479 TATGTCTGCAGCACTTCTTGGGAGGCCTGGTCACCACAGTCACCTTCACT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 GGGATGATGCGCTGCAGCCAGCTGGCCCCCAGGGCCCTGCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 101529 GGGATGATGCGCTGCAGCCAGCTGGCCCCCAGGGCCCTGCAGGTG...CA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1066  GCCACACACTACAGCCTTCTGGCCACGCTGGAGCTGCTGGGGAAGCTGC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101657 GGCCACACACTACAGCCTTCTGGCCACGCTGGAGCTGCTGGGGAAGCTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 TGCTGGGCACTCTGGCCGGAGGCCTGGCTGATGGGTTGGGGCCACATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101707 TGCTGGGCACTCTGGCCGGAGGCCTGGCTGATGGGTTGGGGCCACATCCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 TGCTTCTTGCTCCTGCTCATCCTCTCTGCCTTTCCCGTTCTGTACCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101757 TGCTTCTTGCTCCTGCTCATCCTCTCTGCCTTTCCCGTTCTGTACCTGGA

   1250     .    :    .    :
   1215 CCTAGCACCCAGCACCTTTCTC
        ||||||||||||||||||||||
 101807 CCTAGCACCCAGCACCTTTCTC