seq1 = pF1KB6612.tfa, 1296 bp
seq2 = pF1KB6612/gi568815590r_80876547.tfa (gi568815590r:80876547_81093227), 216681 bp

>pF1KB6612 1296
>gi568815590r:80876547_81093227 (Chr8)

(complement)

1-125  (100001-100125)   100% ->
126-177  (101698-101749)   100% ->
178-274  (105762-105858)   100% ->
275-876  (107851-108452)   100% ->
877-936  (112734-112793)   100% ->
937-1296  (116322-116681)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGCCCGCGGGGAGCCTGCTGGGCAGCGGACAGATGCAGATCACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGCCCGCGGGGAGCCTGCTGGGCAGCGGACAGATGCAGATCACCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTGGGGAAGTCTGGCTGCTGTCGCCATTTTCTTCGTCATCACCTTCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTGGGGAAGTCTGGCTGCTGTCGCCATTTTCTTCGTCATCACCTTCCTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTTCCTGTGCTCTAGTTGTGACAG         GGAAAAGAAGCCGCGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100101 TCTTCCTGTGCTCTAGTTGTGACAGGTG...CAGGGAAAAGAAGCCGCGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAGCATAGTGGGGACCATGAGAACCTGATGAACGTG         CCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 101714 CAGCATAGTGGGGACCATGAGAACCTGATGAACGTGGTG...CAGCCTTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGACAAGGAGATGTTCAGCCGTTCAGTTACTAGCCTGGCAACAGATGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105767 AGACAAGGAGATGTTCAGCCGTTCAGTTACTAGCCTGGCAACAGATGCTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTGCCAGCAGTGAGCAGAATGGGGCACTCACCAATGGGGACA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 105817 CTGCCAGCAGTGAGCAGAATGGGGCACTCACCAATGGGGACAGTA...TA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    275  TTCTTTCAGAGGACAGTACTCTGACCTGCATGCAGCATTACGAGGAAGT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107850 GTTCTTTCAGAGGACAGTACTCTGACCTGCATGCAGCATTACGAGGAAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCAGACATCGGCCTCGGATCTGCTGGATTCCCAGGACAGCACAGGGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107900 CCAGACATCGGCCTCGGATCTGCTGGATTCCCAGGACAGCACAGGGAAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CAAAATGTCATCAGAGTCGGGAGCTGCCCAGAATCCCTCCCGAGAGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107950 CAAAATGTCATCAGAGTCGGGAGCTGCCCAGAATCCCTCCCGAGAGCGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTGGATACCATGCTCACGGCGAGAAGTGTGGACGGGGACCAGGGGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108000 GTGGATACCATGCTCACGGCGAGAAGTGTGGACGGGGACCAGGGGCTGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GATGGAAGGGCCCTATGAAGTGCTCAAGGACAGCTCCTCCCAAGAAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108050 GATGGAAGGGCCCTATGAAGTGCTCAAGGACAGCTCCTCCCAAGAAAACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGGTGGAGGACTGCTTGTATGAAACTGTGAAAGAGATCAAGGAGGTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108100 TGGTGGAGGACTGCTTGTATGAAACTGTGAAAGAGATCAAGGAGGTGGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCAGCTGCACACCTGGAGAAAGGCCACAGTGGCAAGGCAAAATCTACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108150 GCAGCTGCACACCTGGAGAAAGGCCACAGTGGCAAGGCAAAATCTACTTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TGCCTCGAAAGAGCTCCCAGGGCCCCAGACTGAAGGCAAAGCTGAGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108200 TGCCTCGAAAGAGCTCCCAGGGCCCCAGACTGAAGGCAAAGCTGAGTTTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CTGAATATGCCTCGGTGGACAGAAACAAAAAATGTCGTCAAAGTGTTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108250 CTGAATATGCCTCGGTGGACAGAAACAAAAAATGTCGTCAAAGTGTTAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GTAGAGAGTATCCTTGGAAATTCATGTGATCCAGAAGAGGAGGCCCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108300 GTAGAGAGTATCCTTGGAAATTCATGTGATCCAGAAGAGGAGGCCCCACC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 ACCTGTCCCTGTTAAGCTTCTGGACGAGAATGAAAACCTTCAGGAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108350 ACCTGTCCCTGTTAAGCTTCTGGACGAGAATGAAAACCTTCAGGAGAAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 AAGGGGGAGAGGCGGAAGAGAGTGCCACAGACACGACCAGTGAAACTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108400 AAGGGGGAGAGGCGGAAGAGAGTGCCACAGACACGACCAGTGAAACTAAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 AAG         AGATTTAGCTCATTGTCATACAAGTCTCGGGAAGAAGA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108450 AAGGTG...CAGAGATTTAGCTCATTGTCATACAAGTCTCGGGAAGAAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CCCCACTCTCACAGAAGAAGAG         ATCTCAGCTATGTACTCAT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 112772 CCCCACTCTCACAGAAGAAGAGGTA...TAGATCTCAGCTATGTACTCAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CAGTAAATAAACCTGGACAGTTAGTGAATAAATCGGGGCAGTCGCTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116341 CAGTAAATAAACCTGGACAGTTAGTGAATAAATCGGGGCAGTCGCTTACA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GTTCCGGAGTCCACCTACACCTCCATTCAAGGGGACCCACAGAGGTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116391 GTTCCGGAGTCCACCTACACCTCCATTCAAGGGGACCCACAGAGGTCACC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CTCCTCCTGTAATGATCTCTATGCTACTGTTAAAGACTTCGAAAAAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116441 CTCCTCCTGTAATGATCTCTATGCTACTGTTAAAGACTTCGAAAAAACTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 CAAACAGCACACTTCCACCAGCAGGGAGGCCCAGCGAGGAGCCAGAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116491 CAAACAGCACACTTCCACCAGCAGGGAGGCCCAGCGAGGAGCCAGAGCCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 GATTATGAAGCGATACAGACTCTCAACAGAGAGGAAGAAAAGGCCACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116541 GATTATGAAGCGATACAGACTCTCAACAGAGAGGAAGAAAAGGCCACCCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 GGGGACCAATGGCCACCACGGTCTCGTCCCAAAGGAGAACGACTACGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116591 GGGGACCAATGGCCACCACGGTCTCGTCCCAAAGGAGAACGACTACGAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 GCATAAGTGACTTGCAGCAAGGCAGAGATATTACCAGGCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116641 GCATAAGTGACTTGCAGCAAGGCAGAGATATTACCAGGCTC