seq1 = pF1KB6604.tfa, 1293 bp
seq2 = pF1KB6604/gi568815578r_57070962.tfa (gi568815578r:57070962_57366122), 295161 bp

>pF1KB6604 1293
>gi568815578r:57070962_57366122 (Chr20)

(complement)

1-418  (100001-100418)   100% ->
419-611  (137702-137894)   100% ->
612-760  (163500-163648)   100% ->
761-958  (182204-182401)   100% ->
959-1035  (191116-191192)   100% ->
1036-1146  (192813-192923)   100% ->
1147-1293  (195015-195161)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCACGTGCGCTCACTGCGAGCTGCGGCGCCGCACAGCTTCGTGGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCACGTGCGCTCACTGCGAGCTGCGGCGCCGCACAGCTTCGTGGCGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGGGCACCCCTGTTCCTGCTGCGCTCCGCCCTGGCCGACTTCAGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGGGCACCCCTGTTCCTGCTGCGCTCCGCCCTGGCCGACTTCAGCCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACAACGAGGTGCACTCGAGCTTCATCCACCGGCGCCTCCGCAGCCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACAACGAGGTGCACTCGAGCTTCATCCACCGGCGCCTCCGCAGCCAGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGGCGGGAGATGCAGCGCGAGATCCTCTCCATTTTGGGCTTGCCCCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGGCGGGAGATGCAGCGCGAGATCCTCTCCATTTTGGGCTTGCCCCACCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCGCGCCCGCACCTCCAGGGCAAGCACAACTCGGCACCCATGTTCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCCGCGCCCGCACCTCCAGGGCAAGCACAACTCGGCACCCATGTTCATGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGACCTGTACAACGCCATGGCGGTGGAGGAGGGCGGCGGGCCCGGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGACCTGTACAACGCCATGGCGGTGGAGGAGGGCGGCGGGCCCGGCGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGGGCTTCTCCTACCCCTACAAGGCCGTCTTCAGTACCCAGGGCCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAGGGCTTCTCCTACCCCTACAAGGCCGTCTTCAGTACCCAGGGCCCCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TCTGGCCAGCCTGCAAGATAGCCATTTCCTCACCGACGCCGACATGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TCTGGCCAGCCTGCAAGATAGCCATTTCCTCACCGACGCCGACATGGTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGAGCTTCGTCAACCTCG         TGGAACATGACAAGGAATTCTTC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100401 TGAGCTTCGTCAACCTCGGTG...CAGTGGAACATGACAAGGAATTCTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CACCCACGCTACCACCATCGAGAGTTCCGGTTTGATCTTTCCAAGATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137725 CACCCACGCTACCACCATCGAGAGTTCCGGTTTGATCTTTCCAAGATCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 AGAAGGGGAAGCTGTCACGGCAGCCGAATTCCGGATCTACAAGGACTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137775 AGAAGGGGAAGCTGTCACGGCAGCCGAATTCCGGATCTACAAGGACTACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TCCGGGAACGCTTCGACAATGAGACGTTCCGGATCAGCGTTTATCAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137825 TCCGGGAACGCTTCGACAATGAGACGTTCCGGATCAGCGTTTATCAGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CTCCAGGAGCACTTGGGCAG         GGAATCGGATCTCTTCCTGCT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 137875 CTCCAGGAGCACTTGGGCAGGTG...CAGGGAATCGGATCTCTTCCTGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CGACAGCCGTACCCTCTGGGCCTCGGAGGAGGGCTGGCTGGTGTTTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163521 CGACAGCCGTACCCTCTGGGCCTCGGAGGAGGGCTGGCTGGTGTTTGACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TCACAGCCACCAGCAACCACTGGGTGGTCAATCCGCGGCACAACCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163571 TCACAGCCACCAGCAACCACTGGGTGGTCAATCCGCGGCACAACCTGGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CTGCAGCTCTCGGTGGAGACGCTGGATG         GGCAGAGCATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 163621 CTGCAGCTCTCGGTGGAGACGCTGGATGGTG...CAGGGCAGAGCATCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CCCCAAGTTGGCGGGCCTGATTGGGCGGCACGGGCCCCAGAACAAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182217 CCCCAAGTTGGCGGGCCTGATTGGGCGGCACGGGCCCCAGAACAAGCAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CCTTCATGGTGGCTTTCTTCAAGGCCACGGAGGTCCACTTCCGCAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182267 CCTTCATGGTGGCTTTCTTCAAGGCCACGGAGGTCCACTTCCGCAGCATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CGGTCCACGGGGAGCAAACAGCGCAGCCAGAACCGCTCCAAGACGCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182317 CGGTCCACGGGGAGCAAACAGCGCAGCCAGAACCGCTCCAAGACGCCCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 GAACCAGGAAGCCCTGCGGATGGCCAACGTGGCAG         AGAACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 182367 GAACCAGGAAGCCCTGCGGATGGCCAACGTGGCAGGTA...CAGAGAACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 GCAGCAGCGACCAGAGGCAGGCCTGTAAGAAGCACGAGCTGTATGTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191122 GCAGCAGCGACCAGAGGCAGGCCTGTAAGAAGCACGAGCTGTATGTCAGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 TTCCGAGACCTGGGCTGGCAG         GACTGGATCATCGCGCCTGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 191172 TTCCGAGACCTGGGCTGGCAGGTA...CAGGACTGGATCATCGCGCCTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 AGGCTACGCCGCCTACTACTGTGAGGGGGAGTGTGCCTTCCCTCTGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192833 AGGCTACGCCGCCTACTACTGTGAGGGGGAGTGTGCCTTCCCTCTGAACT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 CCTACATGAACGCCACCAACCACGCCATCGTGCAGACGCTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 192883 CCTACATGAACGCCACCAACCACGCCATCGTGCAGACGCTGGTG...CAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GTCCACTTCATCAACCCGGAAACGGTGCCCAAGCCCTGCTGTGCGCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195015 GTCCACTTCATCAACCCGGAAACGGTGCCCAAGCCCTGCTGTGCGCCCAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 GCAGCTCAATGCCATCTCCGTCCTCTACTTCGATGACAGCTCCAACGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195065 GCAGCTCAATGCCATCTCCGTCCTCTACTTCGATGACAGCTCCAACGTCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1247 TCCTGAAGAAATACAGAAACATGGTGGTCCGGGCCTGTGGCTGCCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195115 TCCTGAAGAAATACAGAAACATGGTGGTCCGGGCCTGTGGCTGCCAC