seq1 = pF1KB6581.tfa, 1131 bp
seq2 = pF1KB6581/gi568815581r_64914260.tfa (gi568815581r:64914260_65156593), 242334 bp

>pF1KB6581 1131
>gi568815581r:64914260_65156593 (Chr17)

(complement)

1-283  (100001-100283)   100% ->
284-510  (102866-103092)   100% ->
511-561  (138291-138341)   100% ->
562-1131  (141765-142334)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGACTTCCTGCCGTCGCGGTCCGTGCTGTCCGTGTGCTTCCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGACTTCCTGCCGTCGCGGTCCGTGCTGTCCGTGTGCTTCCCCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGCCTGCTGACGAGTGGCGAGGCCGAGCAGCAACGCAAGTCCAAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGCCTGCTGACGAGTGGCGAGGCCGAGCAGCAACGCAAGTCCAAGGAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCGACAAATGCCTGTCTCGGGAAAAGACCTATGTGAAGCGGCTGGTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCGACAAATGCCTGTCTCGGGAAAAGACCTATGTGAAGCGGCTGGTGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCCTGCTGCTGGGCGCGGGCGAGAGCGGCAAGTCCACCTTCCTGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATCCTGCTGCTGGGCGCGGGCGAGAGCGGCAAGTCCACCTTCCTGAAGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GATGCGGATCATCCACGGGCAGGACTTCGACCAGCGCGCGCGCGAGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GATGCGGATCATCCACGGGCAGGACTTCGACCAGCGCGCGCGCGAGGAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCCGCCCCACCATCTACAGCAACGTGATCAAAG         GTATGAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100251 TCCGCCCCACCATCTACAGCAACGTGATCAAAGGTG...AAGGTATGAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GTGCTGGTTGATGCTCGAGAGAAGCTTCATATTCCCTGGGGAGACAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102874 GTGCTGGTTGATGCTCGAGAGAAGCTTCATATTCCCTGGGGAGACAACTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AAACCAACAACATGGAGATAAGATGATGTCGTTTGATACCCGGGCCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102924 AAACCAACAACATGGAGATAAGATGATGTCGTTTGATACCCGGGCCCCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGGCAGCCCAAGGAATGGTGGAAACAAGGGTTTTCTTACAATATCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102974 TGGCAGCCCAAGGAATGGTGGAAACAAGGGTTTTCTTACAATATCTTCCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GCTATAAGAGCATTATGGGCAGACAGCGGCATACAGAATGCCTATGACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103024 GCTATAAGAGCATTATGGGCAGACAGCGGCATACAGAATGCCTATGACCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCGTCGAGAATTTCAACTG         GGTGAATCTGTAAAATATTTCC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 103074 GCGTCGAGAATTTCAACTGGTA...TAGGGTGAATCTGTAAAATATTTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGGATAACTTGGATAAACTTGGAGAACCA         GATTATATTCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 138313 TGGATAACTTGGATAAACTTGGAGAACCAGTA...CAGGATTATATTCCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TCACAACAAGATATTCTGCTTGCCAGAAGACCCACCAAAGGCATCCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141777 TCACAACAAGATATTCTGCTTGCCAGAAGACCCACCAAAGGCATCCATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 ATACGACTTTGAAATAAAAAATGTTCCTTTCAAAATGGTTGATGTAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141827 ATACGACTTTGAAATAAAAAATGTTCCTTTCAAAATGGTTGATGTAGGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GTCAGAGATCAGAAAGGAAACGTTGGTTTGAATGTTTCGACAGTGTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141877 GTCAGAGATCAGAAAGGAAACGTTGGTTTGAATGTTTCGACAGTGTGACA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TCAATACTTTTCCTTGTTTCCTCAAGTGAATTTGACCAGGTGCTTATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141927 TCAATACTTTTCCTTGTTTCCTCAAGTGAATTTGACCAGGTGCTTATGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 AGATCGACTGACCAATCGCCTTACAGAGTCTCTGAACATTTTTGAAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141977 AGATCGACTGACCAATCGCCTTACAGAGTCTCTGAACATTTTTGAAACAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TCGTCAATAACCGGGTTTTCAGCAATGTCTCCATAATTCTGTTCTTAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142027 TCGTCAATAACCGGGTTTTCAGCAATGTCTCCATAATTCTGTTCTTAAAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 AAGACAGACTTGCTTGAGGAGAAGGTGCAAATTGTGAGCATCAAAGACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142077 AAGACAGACTTGCTTGAGGAGAAGGTGCAAATTGTGAGCATCAAAGACTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 TTTCCTAGAATTTGAAGGGGATCCCCACTGCTTAAGAGACGTCCAAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142127 TTTCCTAGAATTTGAAGGGGATCCCCACTGCTTAAGAGACGTCCAAAAAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 TCCTGGTGGAATGTTTCCGGAACAAACGCCGGGACCAGCAACAGAAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142177 TCCTGGTGGAATGTTTCCGGAACAAACGCCGGGACCAGCAACAGAAGCCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 TTATACCACCACTTCACCACTGCTATCAACACGGAGAACATCCGCCTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142227 TTATACCACCACTTCACCACTGCTATCAACACGGAGAACATCCGCCTTGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 TTTCCGTGACGTGAAGGATACTATTCTGCATGACAACCTCAAGCAGCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142277 TTTCCGTGACGTGAAGGATACTATTCTGCATGACAACCTCAAGCAGCTTA

   1150     .
   1124 TGCTACAG
        ||||||||
 142327 TGCTACAG