seq1 = pF1KB6579.tfa, 1131 bp
seq2 = pF1KB6579/gi568815597r_229331502.tfa (gi568815597r:229331502_229533115), 201614 bp

>pF1KB6579 1131
>gi568815597r:229331502_229533115 (Chr1)

(complement)

1-129  (100001-100129)   100% ->
130-454  (100236-100560)   100% ->
455-616  (100685-100846)   100% ->
617-808  (100931-101122)   100% ->
809-990  (101214-101395)   100% ->
991-1131  (101474-101614)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGCGACGAAGACGAGACCACCGCCCTCGTGTGCGACAATGGCTCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGCGACGAAGACGAGACCACCGCCCTCGTGTGCGACAATGGCTCCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGGTGAAAGCCGGCTTCGCCGGGGATGACGCCCCTAGGGCCGTGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGGTGAAAGCCGGCTTCGCCGGGGATGACGCCCCTAGGGCCGTGTTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGTCCATCGTGGGCCGCCCCCGACACCAG         GGCGTCATGGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100101 CGTCCATCGTGGGCCGCCCCCGACACCAGGTC...CAGGGCGTCATGGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGTATGGGTCAGAAAGATTCCTACGTGGGCGACGAGGCTCAGAGCAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100248 GGTATGGGTCAGAAAGATTCCTACGTGGGCGACGAGGCTCAGAGCAAGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGGTATCCTGACCCTGAAGTACCCTATCGAGCACGGCATCATCACCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100298 AGGTATCCTGACCCTGAAGTACCCTATCGAGCACGGCATCATCACCAACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGGATGACATGGAGAAGATCTGGCACCACACCTTCTACAACGAGCTTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100348 GGGATGACATGGAGAAGATCTGGCACCACACCTTCTACAACGAGCTTCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GTGGCTCCCGAGGAGCACCCCACCCTGCTCACCGAGGCCCCCCTCAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100398 GTGGCTCCCGAGGAGCACCCCACCCTGCTCACCGAGGCCCCCCTCAATCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAAGGCCAACCGCGAGAAGATGACCCAGATCATGTTTGAGACCTTCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100448 CAAGGCCAACCGCGAGAAGATGACCCAGATCATGTTTGAGACCTTCAACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGCCCGCCATGTACGTGGCCATCCAGGCCGTGCTGTCCCTCTACGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100498 TGCCCGCCATGTACGTGGCCATCCAGGCCGTGCTGTCCCTCTACGCCTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GGCAGGACCACCG         GCATCGTGCTGGACTCCGGCGACGGCGT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100548 GGCAGGACCACCGGTG...CAGGCATCGTGCTGGACTCCGGCGACGGCGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CACCCACAACGTGCCCATTTATGAGGGCTACGCGCTGCCGCACGCCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100713 CACCCACAACGTGCCCATTTATGAGGGCTACGCGCTGCCGCACGCCATCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGCGCCTGGACCTGGCGGGCCGCGATCTCACCGACTACCTGATGAAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100763 TGCGCCTGGACCTGGCGGGCCGCGATCTCACCGACTACCTGATGAAGATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTCACTGAGCGTGGCTACTCCTTCGTGACCACAG         CTGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100813 CTCACTGAGCGTGGCTACTCCTTCGTGACCACAGGTG...CAGCTGAGCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CGAGATCGTGCGCGACATCAAGGAGAAGCTGTGCTACGTGGCCCTGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100938 CGAGATCGTGCGCGACATCAAGGAGAAGCTGTGCTACGTGGCCCTGGACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TCGAGAACGAGATGGCGACGGCCGCCTCCTCCTCCTCCCTGGAAAAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100988 TCGAGAACGAGATGGCGACGGCCGCCTCCTCCTCCTCCCTGGAAAAGAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TACGAGCTGCCAGACGGGCAGGTCATCACCATCGGCAACGAGCGCTTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101038 TACGAGCTGCCAGACGGGCAGGTCATCACCATCGGCAACGAGCGCTTCCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CTGCCCGGAGACGCTCTTCCAGCCCTCCTTCATCG         GTATGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 101088 CTGCCCGGAGACGCTCTTCCAGCCCTCCTTCATCGGTG...CAGGTATGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AGTCGGCGGGCATTCACGAGACCACCTACAACAGCATCATGAAGTGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101220 AGTCGGCGGGCATTCACGAGACCACCTACAACAGCATCATGAAGTGTGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 ATCGACATCAGGAAGGACCTGTATGCCAACAACGTCATGTCGGGGGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101270 ATCGACATCAGGAAGGACCTGTATGCCAACAACGTCATGTCGGGGGGCAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CACGATGTACCCTGGGATCGCTGACCGCATGCAGAAAGAGATCACCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101320 CACGATGTACCCTGGGATCGCTGACCGCATGCAGAAAGAGATCACCGCGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TGGCACCCAGCACCATGAAGATCAAG         ATCATCGCCCCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 101370 TGGCACCCAGCACCATGAAGATCAAGGTG...CAGATCATCGCCCCGCCG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GAGCGCAAATACTCGGTGTGGATCGGCGGCTCCATCCTGGCCTCGCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101489 GAGCGCAAATACTCGGTGTGGATCGGCGGCTCCATCCTGGCCTCGCTGTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CACCTTCCAGCAGATGTGGATCACCAAGCAGGAGTACGACGAGGCCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101539 CACCTTCCAGCAGATGTGGATCACCAAGCAGGAGTACGACGAGGCCGGCC

   1150     .    :    .    :    .
   1106 CTTCCATCGTCCACCGCAAATGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||
 101589 CTTCCATCGTCCACCGCAAATGCTTC