seq1 = pF1KB6574.tfa, 1203 bp
seq2 = pF1KB6574/gi568815590r_118824377.tfa (gi568815590r:118824377_119033301), 208925 bp

>pF1KB6574 1203
>gi568815590r:118824377_119033301 (Chr8)

(complement)

1-30  (81481-81510)   100% ->
31-400  (100002-100371)   100% ->
401-592  (104373-104564)   100% ->
593-817  (106584-106808)   100% ->
818-1203  (108540-108925)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACAACTTGCTGTGCTGCGCGCTCGTG         TTTCTGGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
  81481 ATGAACAACTTGCTGTGCTGCGCGCTCGTGGTA...TAGTTTCTGGACAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CTCCATTAAGTGGACCACCCAGGAAACGTTTCCTCCAAAGTACCTTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100013 CTCCATTAAGTGGACCACCCAGGAAACGTTTCCTCCAAAGTACCTTCATT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGACGAAGAAACCTCTCATCAGCTGTTGTGTGACAAATGTCCTCCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100063 ATGACGAAGAAACCTCTCATCAGCTGTTGTGTGACAAATGTCCTCCTGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCTACCTAAAACAACACTGTACAGCAAAGTGGAAGACCGTGTGCGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100113 ACCTACCTAAAACAACACTGTACAGCAAAGTGGAAGACCGTGTGCGCCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTGCCCTGACCACTACTACACAGACAGCTGGCACACCAGTGACGAGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100163 TTGCCCTGACCACTACTACACAGACAGCTGGCACACCAGTGACGAGTGTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TATACTGCAGCCCCGTGTGCAAGGAGCTGCAGTACGTCAAGCAGGAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100213 TATACTGCAGCCCCGTGTGCAAGGAGCTGCAGTACGTCAAGCAGGAGTGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AATCGCACCCACAACCGCGTGTGCGAATGCAAGGAAGGGCGCTACCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100263 AATCGCACCCACAACCGCGTGTGCGAATGCAAGGAAGGGCGCTACCTTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GATAGAGTTCTGCTTGAAACATAGGAGCTGCCCTCCTGGATTTGGAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100313 GATAGAGTTCTGCTTGAAACATAGGAGCTGCCCTCCTGGATTTGGAGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGCAAGCTG         GAACCCCAGAGCGAAATACAGTTTGCAAAAGA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100363 TGCAAGCTGGTA...TAGGAACCCCAGAGCGAAATACAGTTTGCAAAAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TGTCCAGATGGGTTCTTCTCAAATGAGACGTCATCTAAAGCACCCTGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104405 TGTCCAGATGGGTTCTTCTCAAATGAGACGTCATCTAAAGCACCCTGTAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AAAACACACAAATTGCAGTGTCTTTGGTCTCCTGCTAACTCAGAAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104455 AAAACACACAAATTGCAGTGTCTTTGGTCTCCTGCTAACTCAGAAAGGAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ATGCAACACACGACAACATATGTTCCGGAAACAGTGAATCAACTCAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104505 ATGCAACACACGACAACATATGTTCCGGAAACAGTGAATCAACTCAAAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TGTGGAATAG         ATGTTACCCTGTGTGAGGAGGCATTCTTCAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 104555 TGTGGAATAGGTA...TAGATGTTACCCTGTGTGAGGAGGCATTCTTCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GTTTGCTGTTCCTACAAAGTTTACGCCTAACTGGCTTAGTGTCTTGGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106615 GTTTGCTGTTCCTACAAAGTTTACGCCTAACTGGCTTAGTGTCTTGGTAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ACAATTTGCCTGGCACCAAAGTAAACGCAGAGAGTGTAGAGAGGATAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106665 ACAATTTGCCTGGCACCAAAGTAAACGCAGAGAGTGTAGAGAGGATAAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CGGCAACACAGCTCACAAGAACAGACTTTCCAGCTGCTGAAGTTATGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106715 CGGCAACACAGCTCACAAGAACAGACTTTCCAGCTGCTGAAGTTATGGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 ACATCAAAACAAAGACCAAGATATAGTCAAGAAGATCATCCAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 106765 ACATCAAAACAAAGACCAAGATATAGTCAAGAAGATCATCCAAGGTA...

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    818    ATATTGACCTCTGTGAAAACAGCGTGCAGCGGCACATTGGACATGCT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108537 CAGATATTGACCTCTGTGAAAACAGCGTGCAGCGGCACATTGGACATGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AACCTCACCTTCGAGCAGCTTCGTAGCTTGATGGAAAGCTTACCGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108587 AACCTCACCTTCGAGCAGCTTCGTAGCTTGATGGAAAGCTTACCGGGAAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GAAAGTGGGAGCAGAAGACATTGAAAAAACAATAAAGGCATGCAAACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108637 GAAAGTGGGAGCAGAAGACATTGAAAAAACAATAAAGGCATGCAAACCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 GTGACCAGATCCTGAAGCTGCTCAGTTTGTGGCGAATAAAAAATGGCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108687 GTGACCAGATCCTGAAGCTGCTCAGTTTGTGGCGAATAAAAAATGGCGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 CAAGACACCTTGAAGGGCCTAATGCACGCACTAAAGCACTCAAAGACGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108737 CAAGACACCTTGAAGGGCCTAATGCACGCACTAAAGCACTCAAAGACGTA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 CCACTTTCCCAAAACTGTCACTCAGAGTCTAAAGAAGACCATCAGGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108787 CCACTTTCCCAAAACTGTCACTCAGAGTCTAAAGAAGACCATCAGGTTCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 TTCACAGCTTCACAATGTACAAATTGTATCAGAAGTTATTTTTAGAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108837 TTCACAGCTTCACAATGTACAAATTGTATCAGAAGTTATTTTTAGAAATG

   1200     .    :    .    :    .    :    .
   1165 ATAGGTAACCAGGTCCAATCAGTAAAAATAAGCTGCTTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108887 ATAGGTAACCAGGTCCAATCAGTAAAAATAAGCTGCTTA