seq1 = pF1KB6572.tfa, 1200 bp
seq2 = pF1KB6572/gi568815595r_114028719.tfa (gi568815595r:114028719_114271992), 243274 bp

>pF1KB6572 1200
>gi568815595r:114028719_114271992 (Chr3)

(complement)

1-270  (100001-100270)   100% ->
271-383  (112126-112238)   100% ->
384-526  (124436-124578)   100% ->
527-723  (132297-132493)   99% ->
724-1006  (140593-140875)   100% ->
1007-1200  (143081-143274)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCATCTCTGAGCCAGCTGAGTGGCCACCTGAACTACACCTGTGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCATCTCTGAGCCAGCTGAGTGGCCACCTGAACTACACCTGTGGGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAGAACTCCACAGGTGCCAGCCAGGCCCGCCCACATGCCTACTATGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGAGAACTCCACAGGTGCCAGCCAGGCCCGCCCACATGCCTACTATGCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTCCTACTGCGCGCTCATCCTGGCCATCGTCTTCGGCAATGGCCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTCCTACTGCGCGCTCATCCTGGCCATCGTCTTCGGCAATGGCCTGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGCATGGCTGTGCTGAAGGAGCGGGCCCTGCAGACTACCACCAACTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGCATGGCTGTGCTGAAGGAGCGGGCCCTGCAGACTACCACCAACTACTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGTAGTGAGCCTGGCTGTGGCAGACTTGCTGGTGGCCACCTTGGTGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGTAGTGAGCCTGGCTGTGGCAGACTTGCTGGTGGCCACCTTGGTGATGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCTGGGTGGTATACCTGGAG         GTGACAGGTGGAGTCTGGAAT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100251 CCTGGGTGGTATACCTGGAGGTG...CAGGTGACAGGTGGAGTCTGGAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTCAGCCGCATTTGCTGTGATGTTTTTGTCACCCTGGATGTCATGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112147 TTCAGCCGCATTTGCTGTGATGTTTTTGTCACCCTGGATGTCATGATGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TACAGCCAGCATCCTTAATCTCTGTGCCATCAGCATAGACAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 112197 TACAGCCAGCATCCTTAATCTCTGTGCCATCAGCATAGACAGGTA...CA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    384  GTACACTGCAGTGGTCATGCCCGTTCACTACCAGCATGGCACGGGACAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124435 GGTACACTGCAGTGGTCATGCCCGTTCACTACCAGCATGGCACGGGACAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AGCTCCTGTCGGCGCGTGGCCCTCATGATCACGGCCGTCTGGGTACTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124485 AGCTCCTGTCGGCGCGTGGCCCTCATGATCACGGCCGTCTGGGTACTGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTTTGCTGTGTCCTGCCCTCTTCTGTTTGGCTTTAATACCACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 124535 CTTTGCTGTGTCCTGCCCTCTTCTGTTTGGCTTTAATACCACAGGTA...

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    527    GGGACCCCACTGTCTGCTCCATCTCCAACCCTGATTTTGTCATCTAC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132294 CAGGGGACCCCACTGTCTGCTCCATCTCCAACCCTGATTTTGTCATCTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TCTTCAGTGGTGTCCTTCTACCTGCCCTTTGGAGTGACTGTCCTTGTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132344 TCTTCAGTGGTGTCCTTCTACCTGCCCTTTGGAGTGACTGTCCTTGTCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TGCCAGAATCTATGTGGTGCTGAAACAAAGGAGACGGAAAAGGATCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132394 TGCCAGAATCTATGTGGTGCTGAAACAAAGGAGACGGAAAAGGATCCTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CTCGACAGAACAGTCAGTGCAACAGTGTCAGGCCTGGCTTCCCCCAACAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 132444 CTCGACAGAACAGTCAGTGCAACAGTGTCAGGCCTGGCTTCCCCCAGCAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724          ACCCTCTCTCCTGACCCGGCACATCTGGAGCTGAAGCGTTA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132494 GTA...CAGACCCTCTCTCCTGACCCGGCACATCTGGAGCTGAAGCGTTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CTACAGCATCTGCCAGGACACTGCCTTGGGTGGACCAGGCTTCCAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140634 CTACAGCATCTGCCAGGACACTGCCTTGGGTGGACCAGGCTTCCAAGAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 GAGGAGGAGAGTTGAAAAGAGAGGAGAAGACTCGGAATTCCCTGAGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140684 GAGGAGGAGAGTTGAAAAGAGAGGAGAAGACTCGGAATTCCCTGAGTCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 ACCATAGCGCCCAAGCTCAGCTTAGAAGTTCGAAAACTCAGCAATGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140734 ACCATAGCGCCCAAGCTCAGCTTAGAAGTTCGAAAACTCAGCAATGGCAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 ATTATCGACATCTTTGAAGCTGGGGCCCCTGCAACCTCGGGGAGTGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140784 ATTATCGACATCTTTGAAGCTGGGGCCCCTGCAACCTCGGGGAGTGCCAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TTCGGGAGAAGAAGGCAACCCAAATGGTGGCCATTGTGCTTG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 140834 TTCGGGAGAAGAAGGCAACCCAAATGGTGGCCATTGTGCTTGGTA...TA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1007  GGGCCTTCATTGTCTGCTGGCTGCCCTTCTTCTTGACCCATGTTCTCAA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143080 GGGGCCTTCATTGTCTGCTGGCTGCCCTTCTTCTTGACCCATGTTCTCAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 TACCCACTGCCAGACATGCCACGTGTCCCCAGAGCTTTACAGTGCCACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143130 TACCCACTGCCAGACATGCCACGTGTCCCCAGAGCTTTACAGTGCCACGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 CATGGCTGGGCTACGTGAATAGCGCCCTCAACCCTGTGATCTATACCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143180 CATGGCTGGGCTACGTGAATAGCGCCCTCAACCCTGTGATCTATACCACC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1156 TTCAATATCGAGTTCCGGAAAGCCTTCCTCAAGATCCTGTCTTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143230 TTCAATATCGAGTTCCGGAAAGCCTTCCTCAAGATCCTGTCTTGC