seq1 = pF1KB6571.tfa, 1125 bp
seq2 = pF1KB6571/gi568815596r_189957261.tfa (gi568815596r:189957261_190162596), 205336 bp

>pF1KB6571 1125
>gi568815596r:189957261_190162596 (Chr2)

(complement)

1-373  (100001-100373)   100% ->
374-747  (102162-102535)   100% ->
748-1125  (104959-105336)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAAAAACTGCAACTCTGTGTTTATATTTACCTGTTTATGCTGATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAAAAACTGCAACTCTGTGTTTATATTTACCTGTTTATGCTGATTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCTGGTCCAGTGGATCTAAATGAGAACAGTGAGCAAAAAGAAAATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCTGGTCCAGTGGATCTAAATGAGAACAGTGAGCAAAAAGAAAATGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAAAAGAGGGGCTGTGTAATGCATGTACTTGGAGACAAAACACTAAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAAAAGAGGGGCTGTGTAATGCATGTACTTGGAGACAAAACACTAAATCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCAAGAATAGAAGCCATTAAGATACAAATCCTCAGTAAACTTCGTCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCAAGAATAGAAGCCATTAAGATACAAATCCTCAGTAAACTTCGTCTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AACAGCTCCTAACATCAGCAAAGATGTTATAAGACAACTTTTACCCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AACAGCTCCTAACATCAGCAAAGATGTTATAAGACAACTTTTACCCAAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTCCTCCACTCCGGGAACTGATTGATCAGTATGATGTCCAGAGGGATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTCCTCCACTCCGGGAACTGATTGATCAGTATGATGTCCAGAGGGATGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGCAGCGATGGCTCTTTGGAAGATGACGATTATCACGCTACAACGGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGCAGCGATGGCTCTTTGGAAGATGACGATTATCACGCTACAACGGAAAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AATCATTACCATGCCTACAGAGT         CTGATTTTCTAATGCAAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100351 AATCATTACCATGCCTACAGAGTGTA...TAGCTGATTTTCTAATGCAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGGATGGAAAACCCAAATGTTGCTTCTTTAAATTTAGCTCTAAAATACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102180 TGGATGGAAAACCCAAATGTTGCTTCTTTAAATTTAGCTCTAAAATACAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TACAATAAAGTAGTAAAGGCCCAACTATGGATATATTTGAGACCCGTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102230 TACAATAAAGTAGTAAAGGCCCAACTATGGATATATTTGAGACCCGTCGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GACTCCTACAACAGTGTTTGTGCAAATCCTGAGACTCATCAAACCTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102280 GACTCCTACAACAGTGTTTGTGCAAATCCTGAGACTCATCAAACCTATGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AAGACGGTACAAGGTATACTGGAATCCGATCTCTGAAACTTGACATGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102330 AAGACGGTACAAGGTATACTGGAATCCGATCTCTGAAACTTGACATGAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CCAGGCACTGGTATTTGGCAGAGCATTGATGTGAAGACAGTGTTGCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102380 CCAGGCACTGGTATTTGGCAGAGCATTGATGTGAAGACAGTGTTGCAAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TTGGCTCAAACAACCTGAATCCAACTTAGGCATTGAAATAAAAGCTTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102430 TTGGCTCAAACAACCTGAATCCAACTTAGGCATTGAAATAAAAGCTTTAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 ATGAGAATGGTCATGATCTTGCTGTAACCTTCCCAGGACCAGGAGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102480 ATGAGAATGGTCATGATCTTGCTGTAACCTTCCCAGGACCAGGAGAAGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GGGCTG         AATCCGTTTTTAGAGGTCAAGGTAACAGACACACC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102530 GGGCTGGTA...CAGAATCCGTTTTTAGAGGTCAAGGTAACAGACACACC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 AAAAAGATCCAGAAGGGATTTTGGTCTTGACTGTGATGAGCACTCAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104994 AAAAAGATCCAGAAGGGATTTTGGTCTTGACTGTGATGAGCACTCAACAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 AATCACGATGCTGTCGTTACCCTCTAACTGTGGATTTTGAAGCTTTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105044 AATCACGATGCTGTCGTTACCCTCTAACTGTGGATTTTGAAGCTTTTGGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 TGGGATTGGATTATCGCTCCTAAAAGATATAAGGCCAATTACTGCTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105094 TGGGATTGGATTATCGCTCCTAAAAGATATAAGGCCAATTACTGCTCTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 AGAGTGTGAATTTGTATTTTTACAAAAATATCCTCATACTCATCTGGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105144 AGAGTGTGAATTTGTATTTTTACAAAAATATCCTCATACTCATCTGGTAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 ACCAAGCAAACCCCAGAGGTTCAGCAGGCCCTTGCTGTACTCCCACAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105194 ACCAAGCAAACCCCAGAGGTTCAGCAGGCCCTTGCTGTACTCCCACAAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 ATGTCTCCAATTAATATGCTATATTTTAATGGCAAAGAACAAATAATATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105244 ATGTCTCCAATTAATATGCTATATTTTAATGGCAAAGAACAAATAATATA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 TGGGAAAATTCCAGCGATGGTAGTAGACCGCTGTGGGTGCTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105294 TGGGAAAATTCCAGCGATGGTAGTAGACCGCTGTGGGTGCTCA