seq1 = pF1KB6570.tfa, 1200 bp
seq2 = pF1KB6570/gi568815582r_88552528.tfa (gi568815582r:88552528_88763080), 210553 bp

>pF1KB6570 1200
>gi568815582r:88552528_88763080 (Chr16)

(complement)

1-70  (100001-100070)   100% ->
71-141  (104361-104431)   100% ->
142-256  (105052-105166)   100% ->
257-403  (105499-105645)   100% ->
404-603  (106777-106976)   100% ->
604-678  (107351-107425)   100% ->
679-897  (107664-107882)   100% ->
898-1013  (108274-108389)   100% ->
1014-1122  (109673-109781)   100% ->
1123-1200  (110476-110553)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTCGGAGAAGCCGCTGGCGGCAGTCACTTGTACAGCGCCGGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTCGGAGAAGCCGCTGGCGGCAGTCACTTGTACAGCGCCGGTCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATCGCGGTCATCAAGTACT         GGGGCAAGCGCGATGAAGAGC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100051 CATCGCGGTCATCAAGTACTGTG...CAGGGGGCAAGCGCGATGAAGAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGGTTCTGCCCATCAACTCCTCCCTGAGCGTCACTCTGCACCAGGACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104382 TGGTTCTGCCCATCAACTCCTCCCTGAGCGTCACTCTGCACCAGGACCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142          TTAAAAACCACCACAACAGCCGTCATCAGCAAGGACTTCAC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104432 GTA...CAGTTAAAAACCACCACAACAGCCGTCATCAGCAAGGACTTCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CGAGGACCGGATTTGGCTGAATGGCCGGGAGGAGGATGTGGGGCAGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105093 CGAGGACCGGATTTGGCTGAATGGCCGGGAGGAGGATGTGGGGCAGCCGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGCTGCAGGCCTGCCTGCGGGAGA         TCCGCTGCCTGGCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 105143 GGCTGCAGGCCTGCCTGCGGGAGAGTG...CAGTCCGCTGCCTGGCCCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AAGCGGAGGAACTCACGGGATGGGGACCCGCTGCCCTCCAGCCTCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105516 AAGCGGAGGAACTCACGGGATGGGGACCCGCTGCCCTCCAGCCTCAGCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CAAGGTGCACGTGGCATCGGTGAACAACTTCCCCACGGCTGCGGGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105566 CAAGGTGCACGTGGCATCGGTGAACAACTTCCCCACGGCTGCGGGCCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCTCCTCAGCGGCGGGCTATGCCTGCCTAG         CCTACACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 105616 CCTCCTCAGCGGCGGGCTATGCCTGCCTAGGTG...CAGCCTACACCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GCCCGTGTCTACGGCGTGGAGAGTGACCTCTCAGAAGTGGCTCGCCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106788 GCCCGTGTCTACGGCGTGGAGAGTGACCTCTCAGAAGTGGCTCGCCGGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CTCAGGCAGCGCCTGCCGGAGCCTGTATGGGGGCTTTGTGGAGTGGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106838 CTCAGGCAGCGCCTGCCGGAGCCTGTATGGGGGCTTTGTGGAGTGGCAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGGGAGAGCAGGCCGACGGGAAGGACAGCATCGCTCGGCAAGTGGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106888 TGGGAGAGCAGGCCGACGGGAAGGACAGCATCGCTCGGCAAGTGGCCCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GAGTCACACTGGCCTGAACTCCGCGTGCTCATCCTTGTG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 106938 GAGTCACACTGGCCTGAACTCCGCGTGCTCATCCTTGTGGTG...CAGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GAGCGCTGAGAAGAAGCTGACAGGCAGTACCGTGGGCATGCGGGCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107353 GAGCGCTGAGAAGAAGCTGACAGGCAGTACCGTGGGCATGCGGGCCAGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGGAGACCAGCCCCCTGCTTCGG         TTCCGGGCCGAGTCCGTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 107403 TGGAGACCAGCCCCCTGCTTCGGGTA...CAGTTCCGGGCCGAGTCCGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GTGCCCGCGCGCATGGCGGAGATGGCCCGCTGCATCCGGGAGCGAGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107682 GTGCCCGCGCGCATGGCGGAGATGGCCCGCTGCATCCGGGAGCGAGACTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CCCCAGCTTCGCCCAGCTGACCATGAAGGACAGCAACCAGTTCCACGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107732 CCCCAGCTTCGCCCAGCTGACCATGAAGGACAGCAACCAGTTCCACGCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CCTGCCTCGACACCTTCCCGCCCATCTCTTACCTCAATGCCATCTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107782 CCTGCCTCGACACCTTCCCGCCCATCTCTTACCTCAATGCCATCTCCTGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CGCATCATCCACCTGGTGCACCGCTTCAACGCCCACCACGGGGACACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107832 CGCATCATCCACCTGGTGCACCGCTTCAACGCCCACCACGGGGACACCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 G         GTGGCGTACACCTTTGACGCGGGCCCCAATGCCGTGATCT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107882 GGTG...CAGGTGGCGTACACCTTTGACGCGGGCCCCAATGCCGTGATCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TCACCCTGGACGACACTGTGGCTGAGTTTGTGGCTGCTGTGTGGCACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108314 TCACCCTGGACGACACTGTGGCTGAGTTTGTGGCTGCTGTGTGGCACGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TTTCCCCCAGGCTCGAATGGAGACAC         GTTTCTGAAGGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 108364 TTTCCCCCAGGCTCGAATGGAGACACGTG...CAGGTTTCTGAAGGGGCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GCAGGTGAGGCCGGCCCCTCTCTCAGCTGAGCTTCAGGCTGCGCTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109688 GCAGGTGAGGCCGGCCCCTCTCTCAGCTGAGCTTCAGGCTGCGCTGGCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TGGAGCCGACCCCCGGTGGGGTCAAATACATCATTGTCACTCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 109738 TGGAGCCGACCCCCGGTGGGGTCAAATACATCATTGTCACTCAGGTG...

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1123    GTGGGGCCAGGGCCTCAAATCCTGGATGACCCCTGCGCCCACCTCCT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110473 CAGGTGGGGCCAGGGCCTCAAATCCTGGATGACCCCTGCGCCCACCTCCT

   1250     .    :    .    :    .    :
   1170 GGGTCCTGACGGCCTGCCGAAGCCAGCTGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 110523 GGGTCCTGACGGCCTGCCGAAGCCAGCTGCC