seq1 = pF1KB6569.tfa, 1125 bp
seq2 = pF1KB6569/gi568815588r_79837855.tfa (gi568815588r:79837855_80046659), 208805 bp

>pF1KB6569 1125
>gi568815588r:79837855_80046659 (Chr10)

(complement)

1-199  (100001-100199)   100% ->
200-316  (103781-103897)   100% ->
317-433  (104156-104272)   100% ->
434-550  (104590-104706)   100% ->
551-667  (105146-105262)   100% ->
668-751  (105872-105955)   100% ->
752-1125  (108432-108805)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGCTCTTCCTCCTCTCTGCACTGGTCCTGCTCACACAGCCCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGCTCTTCCTCCTCTCTGCACTGGTCCTGCTCACACAGCCCCTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTACCTGGAAGCAGAAATGAAGACCTACTCCCACAGAACAATGCCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTACCTGGAAGCAGAAATGAAGACCTACTCCCACAGAACAATGCCCAGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTTGCACCCTGGTCATGTGTAGCTCAGTGGAGAGTGGCCTGCCTGGTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTTGCACCCTGGTCATGTGTAGCTCAGTGGAGAGTGGCCTGCCTGGTCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GATGGACGGGATGGGAGAGAGGGCCCTCGGGGCGAGAAGGGGGACCCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100151 GATGGACGGGATGGGAGAGAGGGCCCTCGGGGCGAGAAGGGGGACCCAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    200         GTTTGCCAGGAGCTGCAGGGCAAGCAGGGATGCCTGGACAAG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TA...CAGGTTTGCCAGGAGCTGCAGGGCAAGCAGGGATGCCTGGACAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTGGCCCAGTTGGGCCCAAAGGGGACAATGGCTCTGTTGGAGAACCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103823 CTGGCCCAGTTGGGCCCAAAGGGGACAATGGCTCTGTTGGAGAACCTGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCAAAGGGAGACACTGGGCCAAGTG         GACCTCCAGGACCTCC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 103873 CCAAAGGGAGACACTGGGCCAAGTGGTG...CAGGACCTCCAGGACCTCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CGGTGTGCCTGGTCCAGCTGGAAGAGAAGGTCCCCTGGGGAAGCAGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104172 CGGTGTGCCTGGTCCAGCTGGAAGAGAAGGTCCCCTGGGGAAGCAGGGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACATAGGACCTCAGGGCAAGCCAGGCCCAAAAGGAGAAGCTGGGCCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104222 ACATAGGACCTCAGGGCAAGCCAGGCCCAAAAGGAGAAGCTGGGCCCAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 G         GAGAAGTAGGTGCCCCAGGCATGCAGGGCTCGGCAGGGGC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104272 GGTA...CAGGAGAAGTAGGTGCCCCAGGCATGCAGGGCTCGGCAGGGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AAGAGGCCTCGCAGGCCCTAAGGGAGAGCGAGGTGTCCCTGGTGAGCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104630 AAGAGGCCTCGCAGGCCCTAAGGGAGAGCGAGGTGTCCCTGGTGAGCGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GAGTCCCTGGAAACACAGGGGCAGCAG         GGTCTGCTGGAGCC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 104680 GAGTCCCTGGAAACACAGGGGCAGCAGGTG...CAGGGTCTGCTGGAGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATGGGTCCCCAGGGAAGTCCAGGTGCCAGGGGACCCCCGGGATTGAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105160 ATGGGTCCCCAGGGAAGTCCAGGTGCCAGGGGACCCCCGGGATTGAAGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GGACAAAGGCATTCCTGGAGACAAAGGAGCAAAGGGAGAAAGTGGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105210 GGACAAAGGCATTCCTGGAGACAAAGGAGCAAAGGGAGAAAGTGGGCTTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CAG         ATGTTGCTTCTCTGAGGCAGCAGGTTGAGGCCTTACAG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105260 CAGGTA...CAGATGTTGCTTCTCTGAGGCAGCAGGTTGAGGCCTTACAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GGACAAGTACAGCACCTCCAGGCTGCTTTCTCTCAGTATAAGAAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 105910 GGACAAGTACAGCACCTCCAGGCTGCTTTCTCTCAGTATAAGAAAGGTG.

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    752      TTGAGCTCTTCCCAAATGGCCAAAGTGTCGGGGAGAAGATTTTCA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105960 ..TAGTTGAGCTCTTCCCAAATGGCCAAAGTGTCGGGGAGAAGATTTTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGACAGCAGGCTTTGTAAAACCATTTACGGAGGCACAGCTGCTGTGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108477 AGACAGCAGGCTTTGTAAAACCATTTACGGAGGCACAGCTGCTGTGCACA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CAGGCTGGTGGACAGTTGGCCTCTCCACGCTCTGCCGCTGAGAATGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108527 CAGGCTGGTGGACAGTTGGCCTCTCCACGCTCTGCCGCTGAGAATGCCGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CTTGCAACAGCTGGTCGTAGCTAAGAACGAGGCTGCTTTCCTGAGCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108577 CTTGCAACAGCTGGTCGTAGCTAAGAACGAGGCTGCTTTCCTGAGCATGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CTGATTCCAAGACAGAGGGCAAGTTCACCTACCCCACAGGAGAGTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108627 CTGATTCCAAGACAGAGGGCAAGTTCACCTACCCCACAGGAGAGTCCCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GTCTATTCCAACTGGGCCCCAGGGGAGCCCAACGATGATGGCGGGTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108677 GTCTATTCCAACTGGGCCCCAGGGGAGCCCAACGATGATGGCGGGTCAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GGACTGTGTGGAGATCTTCACCAATGGCAAGTGGAATGACAGGGCTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108727 GGACTGTGTGGAGATCTTCACCAATGGCAAGTGGAATGACAGGGCTTGTG

   1150     .    :    .    :    .
   1097 GAGAAAAGCGTCTTGTGGTCTGCGAGTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||
 108777 GAGAAAAGCGTCTTGTGGTCTGCGAGTTC