seq1 = pF1KB6567.tfa, 1122 bp
seq2 = pF1KB6567/gi568815580f_63878309.tfa (gi568815580f:63878309_64087275), 208967 bp

>pF1KB6567 1122
>gi568815580f:63878309_64087275 (Chr18)

1-168  (100001-100168)   100% ->
169-306  (101493-101630)   100% ->
307-424  (103413-103530)   100% ->
425-567  (105271-105413)   99% ->
568-720  (106785-106937)   100% ->
721-1122  (108566-108967)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGACCTCTGTGAAGCAAATGGCACTTTTGCCATCAGCTTATTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATGACCTCTGTGAAGCAAATGGCACTTTTGCCATCAGCTTATTTAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AATATTGGGGGAAGAGGACAACTCAAGAAACGTATTCTTCTCTCCCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AATATTGGGGGAAGAGGACAACTCAAGAAACGTATTCTTCTCTCCCATGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCATCTCCTCTGCCCTGGCCATGGTCTTCATGGGGGCAAAGGGAAGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCATCTCCTCTGCCCTGGCCATGGTCTTCATGGGGGCAAAGGGAAGCACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCAGCCCAGATGTCCCAG         GCACTTTGTTTATACAAAGACGG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100151 GCAGCCCAGATGTCCCAGGTA...CAGGCACTTTGTTTATACAAAGACGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGATATTCACCGAGGTTTCCAGTCACTTCTCAGTGAAGTTAACAGAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101516 AGATATTCACCGAGGTTTCCAGTCACTTCTCAGTGAAGTTAACAGAACTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCACTCAGTACTTGCTTAGAACTGCCAACAGACTCTTTGGAGAAAAGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101566 GCACTCAGTACTTGCTTAGAACTGCCAACAGACTCTTTGGAGAAAAGACG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TGTGATTTCCTTCCA         GACTTTAAAGAATACTGTCAGAAGTT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 101616 TGTGATTTCCTTCCAGTA...CAGGACTTTAAAGAATACTGTCAGAAGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CTATCAGGCAGAGCTGGAGGAGTTGTCCTTTGCTGAAGACACTGAAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103439 CTATCAGGCAGAGCTGGAGGAGTTGTCCTTTGCTGAAGACACTGAAGAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCAGGAAGCATATAAATGACTGGGTGGCAGAGAAGACTGAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 103489 GCAGGAAGCATATAAATGACTGGGTGGCAGAGAAGACTGAAGGTG...TA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    425  GTAAGATTTCAGAGGTACTGGATGCTGGGACAGTCGATCCCCTGACAAA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105270 GGTAAGATTTCAGAGGTACTGGATGCTGGGACAGTCGATCCCCTGACAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCTAGTCCTTGTGAATGCCATTTATTTCAAGGGAAAGTGGAATGAGCAAT
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105320 GCTGGTCCTTGTGAATGCCATTTATTTCAAGGGAAAGTGGAATGAGCAAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TTGACAGAAAGTACACAAGGGGAATGCTCTTTAAAACCAACGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 105370 TTGACAGAAAGTACACAAGGGGAATGCTCTTTAAAACCAACGAGGTA...

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    568    GAAAAAAAGACAGTGCAGATGATGTTTAAGGAAGCTAAGTTTAAAAT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106782 TAGGAAAAAAAGACAGTGCAGATGATGTTTAAGGAAGCTAAGTTTAAAAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GGGGTATGCGGATGAGGTACACACCCAGGTCCTGGAGCTGCCCTATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106832 GGGGTATGCGGATGAGGTACACACCCAGGTCCTGGAGCTGCCCTATGTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AAGAGGAGCTGAGCATGGTCATTCTGCTTCCCGATGACAACACGGACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106882 AAGAGGAGCTGAGCATGGTCATTCTGCTTCCCGATGACAACACGGACCTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GCCGTG         GTGGAAAAAGCACTTACATATGAGAAATTCAAAGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106932 GCCGTGGTA...TAGGTGGAAAAAGCACTTACATATGAGAAATTCAAAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CTGGACAAATTCAGAAAAGTTGACAAAAAGTAAGGTTCAAGTTTTCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108601 CTGGACAAATTCAGAAAAGTTGACAAAAAGTAAGGTTCAAGTTTTCCTTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CCAGATTAAAGCTGGAGGAGAGTTATGACTTGGAGCCTTTCCTTCGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108651 CCAGATTAAAGCTGGAGGAGAGTTATGACTTGGAGCCTTTCCTTCGAAGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TTAGGAATGATCGATGCTTTTGACGAAGCCAAGGCAGACTTTTCTGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108701 TTAGGAATGATCGATGCTTTTGACGAAGCCAAGGCAGACTTTTCTGGAAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GTCAACTGAGAAGAATGTGCCTCTGTCCAAGGTTGCCCACAAGTGCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108751 GTCAACTGAGAAGAATGTGCCTCTGTCCAAGGTTGCCCACAAGTGCTTCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TGGAGGTCAATGAGGAAGGCACAGAGGCTGCCGCAGCCACTGCTGTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108801 TGGAGGTCAATGAGGAAGGCACAGAGGCTGCCGCAGCCACTGCTGTGGTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 AGGAATTCCCGGTGCAGCAGAATGGAGCCAAGATTCTGTGCAGACCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108851 AGGAATTCCCGGTGCAGCAGAATGGAGCCAAGATTCTGTGCAGACCACCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 TTTTCTTTTCTTCATCAGGCACCACAAAACCAACTGCATCTTGTTCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108901 TTTTCTTTTCTTCATCAGGCACCACAAAACCAACTGCATCTTGTTCTGTG

   1150     .    :    .
   1106 GCAGGTTCTCTTCTCCG
        |||||||||||||||||
 108951 GCAGGTTCTCTTCTCCG