seq1 = pF1KB6564.tfa, 1200 bp
seq2 = pF1KB6564/gi568815579r_3990601.tfa (gi568815579r:3990601_4223875), 233275 bp

>pF1KB6564 1200
>gi568815579r:3990601_4223875 (Chr19)

(complement)

1-92  (100001-100092)   100% ->
93-303  (106247-106457)   100% ->
304-450  (113221-113367)   100% ->
451-528  (121423-121500)   100% ->
529-580  (122596-122647)   100% ->
581-705  (122733-122857)   99% ->
706-919  (124462-124675)   100% ->
920-984  (126533-126597)   100% ->
985-1046  (128427-128488)   100% ->
1047-1092  (129378-129423)   100% ->
1093-1200  (133168-133275)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGGCCCGGAGGAAGCCGGTGCTGCCGGCGCTCACCATCAACCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGGCCCGGAGGAAGCCGGTGCTGCCGGCGCTCACCATCAACCCTAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATCGCCGAGGGCCCATCCCCTACCAGCGAGGGCGCCTCCGA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100051 CATCGCCGAGGGCCCATCCCCTACCAGCGAGGGCGCCTCCGAGTG...CA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     93  GGCAAACCTGGTGGACCTGCAGAAGAAGCTGGAGGAGCTGGAACTTGAC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106246 GGGCAAACCTGGTGGACCTGCAGAAGAAGCTGGAGGAGCTGGAACTTGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGCAGCAGAAGAAGCGGCTGGAAGCCTTTCTCACCCAGAAAGCCAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106296 GAGCAGCAGAAGAAGCGGCTGGAAGCCTTTCTCACCCAGAAAGCCAAGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGGCGAACTCAAAGACGATGACTTCGAAAGGATCTCAGAGCTGGGCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106346 CGGCGAACTCAAAGACGATGACTTCGAAAGGATCTCAGAGCTGGGCGCGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCAACGGCGGGGTGGTCACCAAAGTCCAGCACAGACCCTCGGGCCTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106396 GCAACGGCGGGGTGGTCACCAAAGTCCAGCACAGACCCTCGGGCCTCATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATGGCCAGGAAG         CTGATCCACCTTGAGATCAAGCCGGCCAT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 106446 ATGGCCAGGAAGGTG...CAGCTGATCCACCTTGAGATCAAGCCGGCCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCGGAACCAGATCATCCGCGAGCTGCAGGTCCTGCACGAATGCAACTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113250 CCGGAACCAGATCATCCGCGAGCTGCAGGTCCTGCACGAATGCAACTCGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CGTACATCGTGGGCTTCTACGGGGCCTTCTACAGTGACGGGGAGATCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113300 CGTACATCGTGGGCTTCTACGGGGCCTTCTACAGTGACGGGGAGATCAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ATTTGCATGGAACACATG         GACGGCGGCTCCCTGGACCAGGT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 113350 ATTTGCATGGAACACATGGTG...TAGGACGGCGGCTCCCTGGACCAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCTGAAAGAGGCCAAGAGGATTCCCGAGGAGATCCTGGGGAAAGTCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121446 GCTGAAAGAGGCCAAGAGGATTCCCGAGGAGATCCTGGGGAAAGTCAGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCGCG         GTTCTCCGGGGCTTGGCGTACCTCCGAGAGAAGCAC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121496 TCGCGGTG...CAGGTTCTCCGGGGCTTGGCGTACCTCCGAGAGAAGCAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CAGATCATGCACCGAG         ATGTGAAGCCCTCCAACATCCTCGT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 122632 CAGATCATGCACCGAGGTA...CAGATGTGAAGCCCTCCAACATCCTCGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GAACTCTAGAGGGGAGATCAAGCTGTGTGACTTCGGGGTGAGCGGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122758 GAACTCTAGAGGGGAGATCAAGCTGTGTGACTTCGGGGTGAGCGGCCAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TCATAGACTCCATGGCCAACTCCTTCGTGGGCACGCGCTCCTACATGGCT
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122808 TCATCGACTCCATGGCCAACTCCTTCGTGGGCACGCGCTCCTACATGGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706          CCGGAGCGGTTGCAGGGCACACATTACTCGGTGCAGTCGGA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122858 GTG...CAGCCGGAGCGGTTGCAGGGCACACATTACTCGGTGCAGTCGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CATCTGGAGCATGGGCCTGTCCCTGGTGGAGCTGGCCGTCGGAAGGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124503 CATCTGGAGCATGGGCCTGTCCCTGGTGGAGCTGGCCGTCGGAAGGTACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CCATCCCCCCGCCCGACGCCAAAGAGCTGGAGGCCATCTTTGGCCGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124553 CCATCCCCCCGCCCGACGCCAAAGAGCTGGAGGCCATCTTTGGCCGGCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GTGGTCGACGGGGAAGAAGGAGAGCCTCACAGCATCTCGCCTCGGCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124603 GTGGTCGACGGGGAAGAAGGAGAGCCTCACAGCATCTCGCCTCGGCCGAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GCCCCCCGGGCGCCCCGTCAGCG         GTCACGGGATGGATAGCC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 124653 GCCCCCCGGGCGCCCCGTCAGCGGTA...CAGGTCACGGGATGGATAGCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GGCCTGCCATGGCCATCTTTGAACTCCTGGACTATATTGTGAACGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 126551 GGCCTGCCATGGCCATCTTTGAACTCCTGGACTATATTGTGAACGAGGTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    985       CCACCTCCTAAGCTGCCCAACGGTGTGTTCACCCCCGACTTCCA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126601 ...CAGCCACCTCCTAAGCTGCCCAACGGTGTGTTCACCCCCGACTTCCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GGAGTTTGTCAATAAATG         CCTCATCAAGAACCCAGCGGAGC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 128471 GGAGTTTGTCAATAAATGGTA...CAGCCTCATCAAGAACCCAGCGGAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 GGGCGGACCTGAAGATGCTCACA         AACCACACCTTCATCAAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 129401 GGGCGGACCTGAAGATGCTCACAGTG...CAGAACCACACCTTCATCAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 CGGTCCGAGGTGGAAGAAGTGGATTTTGCCGGCTGGTTGTGTAAAACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133186 CGGTCCGAGGTGGAAGAAGTGGATTTTGCCGGCTGGTTGTGTAAAACCCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 GCGGCTGAACCAGCCCGGCACACCCACGCGCACCGCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133236 GCGGCTGAACCAGCCCGGCACACCCACGCGCACCGCCGTG