seq1 = pF1KB6551.tfa, 1113 bp
seq2 = pF1KB6551/gi568815582r_89201.tfa (gi568815582r:89201_329339), 240139 bp

>pF1KB6551 1113
>gi568815582r:89201_329339 (Chr16)

(complement)

1-61  (100001-100061)   100% ->
62-156  (102004-102098)   100% ->
157-255  (108593-108691)   100% ->
256-366  (121152-121262)   100% ->
367-510  (123193-123336)   100% ->
511-687  (130102-130278)   100% ->
688-776  (136325-136413)   100% ->
777-806  (138770-138799)   100% ->
807-974  (139205-139372)   100% ->
975-1113  (140001-140139)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCGCCCAGGCGCAGATGCGGGCCCTGCTGGACCAGCTCATGGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCGCCCAGGCGCAGATGCGGGCCCTGCTGGACCAGCTCATGGGCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCTCGGGACG         GAGACGAAACCAGACAGAGGGTCAAGTTTA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCTCGGGACGGTG...CAGGAGACGAAACCAGACAGAGGGTCAAGTTTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CAGATGACCGTGTCTGCAAGAGTCACCTTCTGGACTGCTGCCCCCATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102034 CAGATGACCGTGTCTGCAAGAGTCACCTTCTGGACTGCTGCCCCCATGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATCCTGGCTGGGACG         CGCATGGATTTAGGAGAATGTACCAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 102084 ATCCTGGCTGGGACGGTA...CAGCGCATGGATTTAGGAGAATGTACCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AATCCACGACTTGGCCCTCCGAGCAGATTATGAGATTGCAAGTAAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108619 AATCCACGACTTGGCCCTCCGAGCAGATTATGAGATTGCAAGTAAAGAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GAGACCTGTTTTTTGAATTAGAT         GCAATGGATCACTTGGAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 108669 GAGACCTGTTTTTTGAATTAGATGTA...TAGGCAATGGATCACTTGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TCCTTTATTGCTGAATGTGATCGGAGAACTGAGCTCGCCAAGAAGCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121170 TCCTTTATTGCTGAATGTGATCGGAGAACTGAGCTCGCCAAGAAGCGGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGCAGAAACACAGGAGGAAATCAGTGCGGAAGTTTCTGCAAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 121220 GGCAGAAACACAGGAGGAAATCAGTGCGGAAGTTTCTGCAAAGGTA...C

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    367   GCAGAAAAAGTACATGAGTTAAATGAAGAAATAGGAAAACTCCTTGCT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123191 AGGCAGAAAAAGTACATGAGTTAAATGAAGAAATAGGAAAACTCCTTGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AAAGCCGAACAGCTAGGGGCTGAAGGTAATGTGGATGAATCCCAGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123241 AAAGCCGAACAGCTAGGGGCTGAAGGTAATGTGGATGAATCCCAGAAGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TCTTATGGAAGTGGAAAAAGTTCGTGCGAAGAAAAAAGAAGCTGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 123291 TCTTATGGAAGTGGAAAAAGTTCGTGCGAAGAAAAAAGAAGCTGAGGTT.

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    511      GAAGAATACAGAAATTCCATGCCTGCATCCAGTTTTCAGCAGCAA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123341 ..CAGGAAGAATACAGAAATTCCATGCCTGCATCCAGTTTTCAGCAGCAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AAGCTGCGTGTCTGCGAGGTCTGTTCAGCCTACCTTGGTCTCCATGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130147 AAGCTGCGTGTCTGCGAGGTCTGTTCAGCCTACCTTGGTCTCCATGACAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGACCGTCGCCTGGCAGACCACTTCGGTGGCAAGTTACACTTGGGGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130197 TGACCGTCGCCTGGCAGACCACTTCGGTGGCAAGTTACACTTGGGGTTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TTCAGATCCGAGAGAAGCTTGATCAGTTGAGG         AAAACTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 130247 TTCAGATCCGAGAGAAGCTTGATCAGTTGAGGGTA...TAGAAAACTGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GCTGAAAAGCAGGAGAAGAGAAATCAGGATCGCTTGAGGAGGAGAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136334 GCTGAAAAGCAGGAGAAGAGAAATCAGGATCGCTTGAGGAGGAGAGAGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GAGGGAACGGGAGGAGCGTCTGAGCAGGAG         GTCGGGATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 136384 GAGGGAACGGGAGGAGCGTCTGAGCAGGAGGTG...TAGGTCGGGATCAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 GAACCAGAGATCGCAGGAG         GTCACGCTCCCGGGATCGGCGT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 138781 GAACCAGAGATCGCAGGAGGTA...CAGGTCACGCTCCCGGGATCGGCGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 CGGAGGCGGTCAAGATCTACCTCCCGAGAGCGACGGAAATTGTCCCGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139227 CGGAGGCGGTCAAGATCTACCTCCCGAGAGCGACGGAAATTGTCCCGGTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CCGGTCCCGAGATAGACATCGGCGCCACCGCAGCCGTTCCCGGAGCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139277 CCGGTCCCGAGATAGACATCGGCGCCACCGCAGCCGTTCCCGGAGCCACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 GCCGGGGACATCGTCGGGCTTCCCGGGACCGAAGTGCGAAATACAA    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 139327 GCCGGGGACATCGTCGGGCTTCCCGGGACCGAAGTGCGAAATACAAGTA.

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    975      GTTCTCCAGAGAGCGGGCATCCAGAGAGGAGTCCTGGGAGAGCGG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139377 ..CAGGTTCTCCAGAGAGCGGGCATCCAGAGAGGAGTCCTGGGAGAGCGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 GCGGAGCGAGCGAGGGCCCCCGGACTGGAGGCTTGAGAGCTCCAACGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140046 GCGGAGCGAGCGAGGGCCCCCGGACTGGAGGCTTGAGAGCTCCAACGGGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 AGATGGCTTCACGGAGGTCAGAAGAGAAGGAGGCCGGCGAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140096 AGATGGCTTCACGGAGGTCAGAAGAGAAGGAGGCCGGCGAGATC