seq1 = pF1KB6543.tfa, 1107 bp
seq2 = pF1KB6543/gi568815575r_71007739.tfa (gi568815575r:71007739_71211539), 203801 bp

>pF1KB6543 1107
>gi568815575r:71007739_71211539 (ChrX)

(complement)

1-115  (100001-100115)   100% ->
116-269  (100490-100643)   100% ->
270-454  (100852-101036)   100% ->
455-594  (101245-101384)   100% ->
595-757  (102150-102312)   100% ->
758-854  (102845-102941)   100% ->
855-924  (103194-103263)   100% ->
925-1107  (103619-103801)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTGAAGCCATCATTACCATTCACATCCCTCTTATTCCTGCAGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTGAAGCCATCATTACCATTCACATCCCTCTTATTCCTGCAGCTGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGCTGGGAGTGGGGCTGAACACGACAATTCTGACGCCCAATGGGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGCTGGGAGTGGGGCTGAACACGACAATTCTGACGCCCAATGGGAATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGACACCACAGCTG         ATTTCTTCCTGACCACTATGCCCACT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGACACCACAGCTGGTG...TAGATTTCTTCCTGACCACTATGCCCACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GACTCCCTCAGTGTTTCCACTCTGCCCCTCCCAGAGGTTCAGTGTTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100516 GACTCCCTCAGTGTTTCCACTCTGCCCCTCCCAGAGGTTCAGTGTTTTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GTTCAATGTCGAGTACATGAATTGCACTTGGAACAGCAGCTCTGAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100566 GTTCAATGTCGAGTACATGAATTGCACTTGGAACAGCAGCTCTGAGCCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGCCTACCAACCTCACTCTGCATTATTG         GTACAAGAACTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100616 AGCCTACCAACCTCACTCTGCATTATTGGTA...TAGGTACAAGAACTCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GATAATGATAAAGTCCAGAAGTGCAGCCACTATCTATTCTCTGAAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100865 GATAATGATAAAGTCCAGAAGTGCAGCCACTATCTATTCTCTGAAGAAAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CACTTCTGGCTGTCAGTTGCAAAAAAAGGAGATCCACCTCTACCAAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100915 CACTTCTGGCTGTCAGTTGCAAAAAAAGGAGATCCACCTCTACCAAACAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTGTTGTTCAGCTCCAGGACCCACGGGAACCCAGGAGACAGGCCACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100965 TTGTTGTTCAGCTCCAGGACCCACGGGAACCCAGGAGACAGGCCACACAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ATGCTAAAACTGCAGAATCTGG         TGATCCCCTGGGCTCCAGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 101015 ATGCTAAAACTGCAGAATCTGGGTA...CAGTGATCCCCTGGGCTCCAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GAACCTAACACTTCACAAACTGAGTGAATCCCAGCTAGAACTGAACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101264 GAACCTAACACTTCACAAACTGAGTGAATCCCAGCTAGAACTGAACTGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACAACAGATTCTTGAACCACTGTTTGGAGCACTTGGTGCAGTACCGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101314 ACAACAGATTCTTGAACCACTGTTTGGAGCACTTGGTGCAGTACCGGACT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GACTGGGACCACAGCTGGACT         GAACAATCAGTGGATTATAG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 101364 GACTGGGACCACAGCTGGACTGTG...AAGGAACAATCAGTGGATTATAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 ACATAAGTTCTCCTTGCCTAGTGTGGATGGGCAGAAACGCTACACGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102170 ACATAAGTTCTCCTTGCCTAGTGTGGATGGGCAGAAACGCTACACGTTTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GTGTTCGGAGCCGCTTTAACCCACTCTGTGGAAGTGCTCAGCATTGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102220 GTGTTCGGAGCCGCTTTAACCCACTCTGTGGAAGTGCTCAGCATTGGAGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GAATGGAGCCACCCAATCCACTGGGGGAGCAATACTTCAAAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 102270 GAATGGAGCCACCCAATCCACTGGGGGAGCAATACTTCAAAAGGTA...T

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    758   AGAATCCTTTCCTGTTTGCATTGGAAGCCGTGGTTATCTCTGTTGGCT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102843 AGAGAATCCTTTCCTGTTTGCATTGGAAGCCGTGGTTATCTCTGTTGGCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CCATGGGATTGATTATCAGCCTTCTCTGTGTGTATTTCTGGCTGGAACG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 102893 CCATGGGATTGATTATCAGCCTTCTCTGTGTGTATTTCTGGCTGGAACGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    855         GACGATGCCCCGAATTCCCACCCTGAAGAACCTAGAGGATCT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102943 TG...CAGGACGATGCCCCGAATTCCCACCCTGAAGAACCTAGAGGATCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TGTTACTGAATACCACGGGAACTTTTCG         GCCTGGAGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 103236 TGTTACTGAATACCACGGGAACTTTTCGGTG...TAGGCCTGGAGTGGTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TGTCTAAGGGACTGGCTGAGAGTCTGCAGCCAGACTACAGTGAACGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103632 TGTCTAAGGGACTGGCTGAGAGTCTGCAGCCAGACTACAGTGAACGACTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TGCCTCGTCAGTGAGATTCCCCCAAAAGGAGGGGCCCTTGGGGAGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103682 TGCCTCGTCAGTGAGATTCCCCCAAAAGGAGGGGCCCTTGGGGAGGGGCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TGGGGCCTCCCCATGCAACCAGCATAGCCCCTACTGGGCCCCCCCATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103732 TGGGGCCTCCCCATGCAACCAGCATAGCCCCTACTGGGCCCCCCCATGTT

   1150     .    :    .    :
   1088 ACACCCTAAAGCCTGAAACC
        ||||||||||||||||||||
 103782 ACACCCTAAAGCCTGAAACC