seq1 = pF1KB6534.tfa, 1170 bp
seq2 = pF1KB6534/gi568815580r_63555660.tfa (gi568815580r:63555660_63761216), 205557 bp

>pF1KB6534 1170
>gi568815580r:63555660_63761216 (Chr18)

(complement)

1-165  (100001-100165)   100% ->
166-222  (100361-100417)   100% ->
223-351  (101690-101818)   100% ->
352-469  (102587-102704)   100% ->
470-612  (103805-103947)   100% ->
613-768  (104231-104386)   100% ->
769-1170  (105156-105557)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATTCACTCAGTGAAGCCAACACCAAGTTCATGTTCGACCTGTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAATTCACTCAGTGAAGCCAACACCAAGTTCATGTTCGACCTGTTCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACAGTTCAGAAAATCAAAAGAGAACAACATCTTCTATTCCCCTATCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACAGTTCAGAAAATCAAAAGAGAACAACATCTTCTATTCCCCTATCAGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCACATCAGCATTAGGGATGGTCCTCTTAGGAGCCAAAGACAACACTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCACATCAGCATTAGGGATGGTCCTCTTAGGAGCCAAAGACAACACTGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAACAGATTAAGAAG         GTTCTTCACTTTGATCAAGTCACAGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAACAGATTAAGAAGGTA...CAGGTTCTTCACTTTGATCAAGTCACAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAACACCACAGGAAAAGCTGCAACATATCAT         GTTGATAGGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100387 GAACACCACAGGAAAAGCTGCAACATATCATGTG...AAGGTTGATAGGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CAGGAAATGTTCATCACCAGTTTCAAAAGCTTCTGACTGAATTCAACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101700 CAGGAAATGTTCATCACCAGTTTCAAAAGCTTCTGACTGAATTCAACAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TCCACTGATGCATATGAGCTGAAGATCGCCAACAAGCTCTTCGGAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101750 TCCACTGATGCATATGAGCTGAAGATCGCCAACAAGCTCTTCGGAGAAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AACGTATCTATTTTTACAG         GAATATTTAGATGCCATCAAGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 101800 AACGTATCTATTTTTACAGGTA...AAGGAATATTTAGATGCCATCAAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AATTTTACCAGACCAGTGTGGAATCTGTTGATTTTGCAAATGCTCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102609 AATTTTACCAGACCAGTGTGGAATCTGTTGATTTTGCAAATGCTCCAGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAAAGTCGAAAGAAGATTAACTCCTGGGTGGAAAGTCAAACGAATG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 102659 GAAAGTCGAAAGAAGATTAACTCCTGGGTGGAAAGTCAAACGAATGGTA.

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    470      AAAAAATTAAAAACCTAATTCCTGAAGGTAATATTGGCAGCAATA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102709 ..CAGAAAAAATTAAAAACCTAATTCCTGAAGGTAATATTGGCAGCAATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CCACATTGGTTCTTGTGAACGCAATCTATTTCAAAGGGCAGTGGGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103850 CCACATTGGTTCTTGTGAACGCAATCTATTTCAAAGGGCAGTGGGAGAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AAATTTAATAAAGAAGATACTAAAGAGGAAAAATTTTGGCCAAACAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 103900 AAATTTAATAAAGAAGATACTAAAGAGGAAAAATTTTGGCCAAACAAGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    613        AATACATACAAGTCCATACAGATGATGAGGCAATACACATCTT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103950 A...TAGAATACATACAAGTCCATACAGATGATGAGGCAATACACATCTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TTCATTTTGCCTCGCTGGAGGATGTACAGGCCAAGGTCCTGGAAATACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104274 TTCATTTTGCCTCGCTGGAGGATGTACAGGCCAAGGTCCTGGAAATACCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TACAAAGGCAAAGATCTAAGCATGATTGTGTTGCTGCCAAATGAAATCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104324 TACAAAGGCAAAGATCTAAGCATGATTGTGTTGCTGCCAAATGAAATCGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGGTCTCCAGAAG         CTTGAAGAGAAACTCACTGCTGAGAAAT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 104374 TGGTCTCCAGAAGGTA...TAGCTTGAAGAGAAACTCACTGCTGAGAAAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TGATGGAATGGACAAGTTTGCAGAATATGAGAGAGACACGTGTCGATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105184 TGATGGAATGGACAAGTTTGCAGAATATGAGAGAGACACGTGTCGATTTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CACTTACCTCGGTTCAAAGTGGAAGAGAGCTATGACCTCAAGGACACGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105234 CACTTACCTCGGTTCAAAGTGGAAGAGAGCTATGACCTCAAGGACACGTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GAGAACCATGGGAATGGTGGATATCTTCAATGGGGATGCAGACCTCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105284 GAGAACCATGGGAATGGTGGATATCTTCAATGGGGATGCAGACCTCTCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GCATGACCGGGAGCCGCGGTCTCGTGCTATCTGGAGTCCTACACAAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105334 GCATGACCGGGAGCCGCGGTCTCGTGCTATCTGGAGTCCTACACAAGGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 TTTGTGGAGGTTACAGAGGAGGGAGCAGAAGCTGCAGCTGCCACCGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105384 TTTGTGGAGGTTACAGAGGAGGGAGCAGAAGCTGCAGCTGCCACCGCTGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 AGTAGGATTCGGATCATCACCTACTTCAACTAATGAAGAGTTCCATTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105434 AGTAGGATTCGGATCATCACCTACTTCAACTAATGAAGAGTTCCATTGTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 ATCACCCTTTCCTATTCTTCATAAGGCAAAATAAGACCAACAGCATCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105484 ATCACCCTTTCCTATTCTTCATAAGGCAAAATAAGACCAACAGCATCCTC

   1200     .    :    .    :
   1147 TTCTATGGCAGATTCTCATCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||
 105534 TTCTATGGCAGATTCTCATCCCCG