seq1 = pF1KB6525.tfa, 1095 bp
seq2 = pF1KB6525/gi568815579f_49413401.tfa (gi568815579f:49413401_49626116), 212716 bp

>pF1KB6525 1095
>gi568815579f:49413401_49626116 (Chr19)

1-73  (100001-100073)   100% ->
74-325  (100482-100733)   100% ->
326-601  (100811-101086)   100% ->
602-871  (111107-111376)   100% ->
872-988  (112057-112173)   100% ->
989-1095  (112610-112716)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGGTCCCGCGGCCTCAGCCCTGGGCGCTGGGGCTCCTGCTCTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGGTCCCGCGGCCTCAGCCCTGGGCGCTGGGGCTCCTGCTCTTTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTTCCTGGGAGCCTGGGCGCAG         AAAGCCACCTCTCCCTCC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100051 CCTTCCTGGGAGCCTGGGCGCAGGTG...CAGAAAGCCACCTCTCCCTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGTACCACCTTACCGCGGTGTCCTCGCCTGCCCCGGGGACTCCTGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100500 TGTACCACCTTACCGCGGTGTCCTCGCCTGCCCCGGGGACTCCTGCCTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGGGTGTCCGGCTGGCTGGGCCCGCAGCAGTACCTGAGCTACAATAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100550 TGGGTGTCCGGCTGGCTGGGCCCGCAGCAGTACCTGAGCTACAATAGCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCGGGGCGAGGCGGAGCCCTGTGGAGCTTGGGTCTGGGAAAACCAGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100600 GCGGGGCGAGGCGGAGCCCTGTGGAGCTTGGGTCTGGGAAAACCAGGTGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCTGGTATTGGGAGAAAGAGACCACAGATCTGAGGATCAAGGAGAAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100650 CCTGGTATTGGGAGAAAGAGACCACAGATCTGAGGATCAAGGAGAAGCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTTCTGGAAGCTTTCAAAGCTTTGGGGGGAAAAG         GTCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100700 TTTCTGGAAGCTTTCAAAGCTTTGGGGGGAAAAGGTG...CAGGTCCCTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CACTCTGCAGGGCCTGCTGGGCTGTGAACTGGGCCCTGACAACACCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100818 CACTCTGCAGGGCCTGCTGGGCTGTGAACTGGGCCCTGACAACACCTCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGCCCACCGCCAAGTTCGCCCTGAACGGCGAGGAGTTCATGAATTTCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100868 TGCCCACCGCCAAGTTCGCCCTGAACGGCGAGGAGTTCATGAATTTCGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTCAAGCAGGGCACCTGGGGTGGGGACTGGCCCGAGGCCCTGGCTATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100918 CTCAAGCAGGGCACCTGGGGTGGGGACTGGCCCGAGGCCCTGGCTATCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TCAGCGGTGGCAGCAGCAGGACAAGGCGGCCAACAAGGAGCTCACCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100968 TCAGCGGTGGCAGCAGCAGGACAAGGCGGCCAACAAGGAGCTCACCTTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGCTATTCTCCTGCCCGCACCGCCTGCGGGAGCACCTGGAGAGGGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101018 TGCTATTCTCCTGCCCGCACCGCCTGCGGGAGCACCTGGAGAGGGGCCGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GGAAACCTGGAGTGGAAGG         AGCCCCCCTCCATGCGCCTGAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 101068 GGAAACCTGGAGTGGAAGGGTG...CAGAGCCCCCCTCCATGCGCCTGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GGCCCGACCCAGCAGCCCTGGCTTTTCCGTGCTTACCTGCAGCGCCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111129 GGCCCGACCCAGCAGCCCTGGCTTTTCCGTGCTTACCTGCAGCGCCTTCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CCTTCTACCCTCCGGAGCTGCAACTTCGGTTCCTGCGGAATGGGCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111179 CCTTCTACCCTCCGGAGCTGCAACTTCGGTTCCTGCGGAATGGGCTGGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GCTGGCACCGGCCAGGGTGACTTCGGCCCCAACAGTGACGGATCCTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111229 GCTGGCACCGGCCAGGGTGACTTCGGCCCCAACAGTGACGGATCCTTCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CGCCTCGTCGTCACTAACAGTCAAAAGTGGCGATGAGCACCACTACTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111279 CGCCTCGTCGTCACTAACAGTCAAAAGTGGCGATGAGCACCACTACTGCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GCATTGTGCAGCACGCGGGGCTGGCGCAGCCCCTCAGGGTGGAGCTGG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 111329 GCATTGTGCAGCACGCGGGGCTGGCGCAGCCCCTCAGGGTGGAGCTGGGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    872        AATCTCCAGCCAAGTCCTCCGTGCTCGTGGTGGGAATCGTCAT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111379 G...CAGAATCTCCAGCCAAGTCCTCCGTGCTCGTGGTGGGAATCGTCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CGGTGTCTTGCTACTCACGGCAGCGGCTGTAGGAGGAGCTCTGTTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112100 CGGTGTCTTGCTACTCACGGCAGCGGCTGTAGGAGGAGCTCTGTTGTGGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 GAAGGATGAGGAGTGGGCTGCCAG         CCCCTTGGATCTCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 112150 GAAGGATGAGGAGTGGGCTGCCAGGTG...CAGCCCCTTGGATCTCCCTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CGTGGAGACGACACCGGGGTCCTCCTGCCCACCCCAGGGGAGGCCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112627 CGTGGAGACGACACCGGGGTCCTCCTGCCCACCCCAGGGGAGGCCCAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 TGCTGATTTGAAGGATGTAAATGTGATTCCAGCCACCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112677 TGCTGATTTGAAGGATGTAAATGTGATTCCAGCCACCGCC