seq1 = pF1KB6523.tfa, 1092 bp
seq2 = pF1KB6523/gi568815586r_57143815.tfa (gi568815586r:57143815_57349636), 205822 bp

>pF1KB6523 1092
>gi568815586r:57143815_57349636 (Chr12)

(complement)

1-66  (100001-100066)   100% ->
67-334  (100329-100596)   100% ->
335-432  (100834-100931)   100% ->
433-505  (101439-101511)   100% ->
506-603  (102736-102833)   100% ->
604-670  (104426-104492)   100% ->
671-720  (104672-104721)   100% ->
721-806  (105015-105100)   100% ->
807-858  (105271-105322)   100% ->
859-996  (105412-105549)   100% ->
997-1092  (105727-105822)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACAGAAAAGGAGGTGCTGGAGTCCCCTAAGCCCTCCTTCCCAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACAGAAAAGGAGGTGCTGGAGTCCCCTAAGCCCTCCTTCCCAGCAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACTCGGCAAAGTGGG         CTACAGCGGCTAAAGCAGTTACTCA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100051 GACTCGGCAAAGTGGGGTG...CAGCTACAGCGGCTAAAGCAGTTACTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGAAGGGTTCTACAGGGACAAAGGAGATGGAACTTCCCCCAGAGCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100354 GGAAGGGTTCTACAGGGACAAAGGAGATGGAACTTCCCCCAGAGCCCCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCCAATGGGGAGGCAGTGGGAGCTGGGGGTGGGCCCATCTACTACATCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100404 GCCAATGGGGAGGCAGTGGGAGCTGGGGGTGGGCCCATCTACTACATCTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAGCCACCCCCAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100454 TGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAGCCACCCCCAGAAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTCCTAAGCTGGTCAACGATAAGCCCCACAAATTCAAAGATCACTTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100504 CTCCTAAGCTGGTCAACGATAAGCCCCACAAATTCAAAGATCACTTCTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAGAAGCCAAAGTTCTGTGATGTCTGTGCCCGGATGATTGTTC       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100554 AAGAAGCCAAAGTTCTGTGATGTCTGTGCCCGGATGATTGTTCGTG...A

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    335   TCAACAACAAGTTTGGGCTTCGCTGTAAGAACTGCAAAACCAACATCC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100832 AGTCAACAACAAGTTTGGGCTTCGCTGTAAGAACTGCAAAACCAACATCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATGAACACTGTCAGTCCTATGTGGAAATGCAGAGATGCTTCGGCAAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100882 ATGAACACTGTCAGTCCTATGTGGAAATGCAGAGATGCTTCGGCAAGATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433          CCACCTGGTTTCCATCGGGCCTATAGTTCCCCACTCTACAG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100932 GTG...CAGCCACCTGGTTTCCATCGGGCCTATAGTTCCCCACTCTACAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CAACCAGCAGTACGCTTGTGTCAAAGATCTCT         CTGCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 101480 CAACCAGCAGTACGCTTGTGTCAAAGATCTCTGTA...TAGCTGCTGCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATCGCAATGATCCTGTGTTTGAAACCCTGCGCACTGGGGTGATCATGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102745 ATCGCAATGATCCTGTGTTTGAAACCCTGCGCACTGGGGTGATCATGGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AACAAGGAACGGAAGAAGGGACAGGCAGATAAGAAAAAT         CC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 102795 AACAAGGAACGGAAGAAGGGACAGGCAGATAAGAAAAATGTG...CAGCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGTAGCAGCCATGATGGAGGAGGAGCCAGAGTCGGCCAGACCAGAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104428 TGTAGCAGCCATGATGGAGGAGGAGCCAGAGTCGGCCAGACCAGAGGAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GCAAACCCCAGGATG         GAAACCCTGAAGGGGATAAGAAGGCT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 104478 GCAAACCCCAGGATGGTG...CAGGAAACCCTGAAGGGGATAAGAAGGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GAGAAGAAGACACCTGATGACAAG         CACAAGCAGCCTGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 104698 GAGAAGAAGACACCTGATGACAAGGTA...CAGCACAAGCAGCCTGGCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CCAGCAGTCTCATTACTTTGTGGCTCTCTATCGGTTCAAAGCCCTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105032 CCAGCAGTCTCATTACTTTGTGGCTCTCTATCGGTTCAAAGCCCTGGAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 AGGACGATCTGGATTTCCC         GCCAGGAGAGAAGATCACAGTC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 105082 AGGACGATCTGGATTTCCCGTG...CAGGCCAGGAGAGAAGATCACAGTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 ATTGATGACTCCAATGAAGAATGGTGGCGG         GGGAAAATCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 105293 ATTGATGACTCCAATGAAGAATGGTGGCGGGTG...TAGGGGAAAATCGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 GGAGAAGGTCGGATTTTTCCCTCCAAACTTCATCATTCGGGTCCGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105423 GGAGAAGGTCGGATTTTTCCCTCCAAACTTCATCATTCGGGTCCGGGCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 GAGAACGTGTGCACCGCGTGACGAGATCCTTCGTGGGGAACCGCGAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105473 GAGAACGTGTGCACCGCGTGACGAGATCCTTCGTGGGGAACCGCGAGATA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GGGCAGATCACTCTCAAGAAGGACCAG         ATCGTGGTGCAGAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 105523 GGGCAGATCACTCTCAAGAAGGACCAGGTA...TAGATCGTGGTGCAGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 AGGAGACGAAGCGGGCGGCTACGTCAAGGTCTACACCGGCCGCAAGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105741 AGGAGACGAAGCGGGCGGCTACGTCAAGGTCTACACCGGCCGCAAGGTGG

   1150     .    :    .    :    .    :
   1061 GGCTGTTTCCCACCGACTTTCTAGAGGAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 105791 GGCTGTTTCCCACCGACTTTCTAGAGGAAATT