seq1 = pF1KB6520.tfa, 1158 bp
seq2 = pF1KB6520/gi568815577r_44146400.tfa (gi568815577r:44146400_44361259), 214860 bp

>pF1KB6520 1158
>gi568815577r:44146400_44361259 (Chr21)

(complement)

1-106  (100001-100106)   100% ->
107-151  (100421-100465)   100% ->
152-231  (101549-101628)   100% ->
232-344  (101711-101823)   100% ->
345-516  (102566-102737)   100% ->
517-604  (105106-105193)   100% ->
605-693  (106555-106643)   100% ->
694-769  (109562-109637)   100% ->
770-909  (110311-110450)   99% ->
910-995  (112149-112234)   100% ->
996-1158  (114698-114860)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCCATCCCAGCCCTGGACCCAGAGGCCGAGCCCAGCATGGACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCCATCCCAGCCCTGGACCCAGAGGCCGAGCCCAGCATGGACGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATTTTGGTGGGATCCAGTGAGCTCTCAAGCTCCGTTTCACCCGGGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GATTTTGGTGGGATCCAGTGAGCTCTCAAGCTCCGTTTCACCCGGGACAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAGAG         ATCTTATTGCATATGAAGTCAAGGCTAACCAGCGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCAGAGGTG...CAGATCTTATTGCATATGAAGTCAAGGCTAACCAGCGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AATATAGAAG         ACATCTGCATCTGCTGCGGAAGTCTCCAGGT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100456 AATATAGAAGGTG...TAGACATCTGCATCTGCTGCGGAAGTCTCCAGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TCACACACAGCACCCTCTGTTTGAGGGAGGGATCTGCGCCCCATGTAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 101580 TCACACACAGCACCCTCTGTTTGAGGGAGGGATCTGCGCCCCATGTAAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    232         GACAAGTTCCTGGATGCCCTCTTCCTGTACGACGATGACGGG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101630 TA...AAGGACAAGTTCCTGGATGCCCTCTTCCTGTACGACGATGACGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TACCAATCCTACTGCTCCATCTGCTGCTCCGGAGAGACGCTGCTCATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101753 TACCAATCCTACTGCTCCATCTGCTGCTCCGGAGAGACGCTGCTCATCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CGGAAACCCTGATTGCACCCG         ATGCTACTGCTTCGAGTGTG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 101803 CGGAAACCCTGATTGCACCCGGTG...TAGATGCTACTGCTTCGAGTGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TGGATAGCCTGGTCGGCCCCGGGACCTCGGGGAAGGTGCACGCCATGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102586 TGGATAGCCTGGTCGGCCCCGGGACCTCGGGGAAGGTGCACGCCATGAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AACTGGGTGTGCTACCTGTGCCTGCCGTCCTCCCGAAGCGGGCTGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102636 AACTGGGTGTGCTACCTGTGCCTGCCGTCCTCCCGAAGCGGGCTGCTGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GCGTCGGAGGAAGTGGCGCAGCCAGCTCAAGGCCTTCTACGACCGAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102686 GCGTCGGAGGAAGTGGCGCAGCCAGCTCAAGGCCTTCTACGACCGAGAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CG         GAGAATCCCCTTGAGATGTTCGAAACCGTGCCTGTGTGG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102736 CGGTA...TAGGAGAATCCCCTTGAGATGTTCGAAACCGTGCCTGTGTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AGGAGACAGCCAGTCCGGGTGCTGTCCCTTTTTGAAGACATCAAGAAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 105145 AGGAGACAGCCAGTCCGGGTGCTGTCCCTTTTTGAAGACATCAAGAAAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    605         AGCTGACGAGTTTGGGCTTTTTGGAAAGTGGTTCTGACCCGG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105195 TG...CAGAGCTGACGAGTTTGGGCTTTTTGGAAAGTGGTTCTGACCCGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GACAACTGAAGCATGTGGTTGATGTCACAGACACAGTGAGGAAGGAT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 106597 GACAACTGAAGCATGTGGTTGATGTCACAGACACAGTGAGGAAGGATGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    694       GTGGAGGAGTGGGGACCCTTCGATCTTGTGTACGGCGCCACACC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106647 ...CAGGTGGAGGAGTGGGGACCCTTCGATCTTGTGTACGGCGCCACACC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 TCCCCTGGGCCACACCTGTGACCGTCCTCCCA         GCTGGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 109606 TCCCCTGGGCCACACCTGTGACCGTCCTCCCAGTG...CAGGCTGGTACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 TGTTCCAGTTCCACCGGCTCCTGCAGTACGCACGGCCCAAGCCAGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110320 TGTTCCAGTTCCACCGGCTCCTGCAGTACGCACGGCCCAAGCCAGGCAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 CCCGGGCCCTTCTTCTGGATGTTCGTGGACAATCTGGTGCTGAACAAGGA
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110370 CCCAGGCCCTTCTTCTGGATGTTCGTGGACAATCTGGTGCTGAACAAGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 AGACCTGGACGTCGCATCTCGCTTCCTGGAG         ATGGAGCCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 110420 AGACCTGGACGTCGCATCTCGCTTCCTGGAGGTG...CAGATGGAGCCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TCACCATCCCAGATGTCCACGGCGGATCCTTGCAGAATGCTGTCCGCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112159 TCACCATCCCAGATGTCCACGGCGGATCCTTGCAGAATGCTGTCCGCGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 TGGAGCAACATCCCAGCCATAAGGAG         CAGGCACTGGGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 112209 TGGAGCAACATCCCAGCCATAAGGAGGTA...CAGCAGGCACTGGGCTCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 GGTTTCGGAAGAAGAATTGTCCCTGCTGGCCCAGAACAAGCAGAGCTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114713 GGTTTCGGAAGAAGAATTGTCCCTGCTGGCCCAGAACAAGCAGAGCTCGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 AGCTCGCGGCCAAGTGGCCCACCAAGCTGGTGAAGAACTGCTTTCTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114763 AGCTCGCGGCCAAGTGGCCCACCAAGCTGGTGAAGAACTGCTTTCTCCCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1111 CTAAGAGAATATTTCAAGTATTTTTCAACAGAACTCACTTCCTCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114813 CTAAGAGAATATTTCAAGTATTTTTCAACAGAACTCACTTCCTCTTTA