seq1 = pF1KB6519.tfa, 1086 bp
seq2 = pF1KB6519/gi568815592r_24550791.tfa (gi568815592r:24550791_24766862), 216072 bp

>pF1KB6519 1086
>gi568815592r:24550791_24766862 (Chr6)

(complement)

1-165  (100001-100165)   100% ->
166-251  (100252-100337)   100% ->
252-425  (108129-108302)   100% ->
426-517  (108960-109051)   100% ->
518-636  (112333-112451)   100% ->
637-807  (113710-113880)   99% ->
808-1086  (115794-116072)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGTTGGGGAGTTGCCTGGAGGGCGGGAGGGAGGCGGCGGAGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGTTGGGGAGTTGCCTGGAGGGCGGGAGGGAGGCGGCGGAGGAAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCGAGCCTGAGGTGAAAAAGCGGCGACTTCTGTGTGTGGAGTTTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGCGAGCCTGAGGTGAAAAAGCGGCGACTTCTGTGTGTGGAGTTTGCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGTCGCAAGCTGCGATGCCGCAGTGGCTCAGTGCTTCCTGGCCGAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGTCGCAAGCTGCGATGCCGCAGTGGCTCAGTGCTTCCTGGCCGAGAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACTGGGAGATGGAA         AGGGCTCTGAACTCCTACTTCGAGCC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACTGGGAGATGGAAGTA...CAGAGGGCTCTGAACTCCTACTTCGAGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCCGGTGGAGGAGAGCGCCTTGGAACGCCGACCTGAAACCATCTCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100278 TCCGGTGGAGGAGAGCGCCTTGGAACGCCGACCTGAAACCATCTCTGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCAAGACCTA         TGTTGACCTAACCAATGAAGAAACAACTGAT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100328 CCAAGACCTAGTA...CAGTGTTGACCTAACCAATGAAGAAACAACTGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TCCACCACTTCTAAAATCAGCCCATCTGAAGATACTCAGCAAGAAAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108160 TCCACCACTTCTAAAATCAGCCCATCTGAAGATACTCAGCAAGAAAATGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAGCATGTTCTCTCTCATTACCTGGAATATTGATGGATTAGATCTAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108210 CAGCATGTTCTCTCTCATTACCTGGAATATTGATGGATTAGATCTAAACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATCTGTCAGAGAGGGCTCGAGGGGTGTGTTCCTACTTAGCTTT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 108260 ATCTGTCAGAGAGGGCTCGAGGGGTGTGTTCCTACTTAGCTTTGTA...T

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    426   GTACAGCCCAGATGTGATATTTCTACAGGAAGTTATTCCCCCATATTA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108958 AGGTACAGCCCAGATGTGATATTTCTACAGGAAGTTATTCCCCCATATTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TAGCTACCTAAAGAAGAGATCAAGTAATTATGAGATTATTACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 109008 TAGCTACCTAAAGAAGAGATCAAGTAATTATGAGATTATTACAGGTA...

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    518    GTCATGAAGAAGGATATTTCACAGCTATAATGTTGAAGAAATCAAGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112330 TAGGTCATGAAGAAGGATATTTCACAGCTATAATGTTGAAGAAATCAAGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GTGAAATTAAAAAGCCAAGAGATTATTCCTTTTCCAAGTACCAAAATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112380 GTGAAATTAAAAAGCCAAGAGATTATTCCTTTTCCAAGTACCAAAATGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GAGAAACCTTTTATGTGTGCAT         GTGAATGTGTCAGGAAATG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||| |||||||||||||
 112430 GAGAAACCTTTTATGTGTGCATGTG...CAGGTGAACGTGTCAGGAAATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGCTTTGCCTTATGACATCCCATTTGGAGAGCACCAGAGGGCATGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113729 AGCTTTGCCTTATGACATCCCATTTGGAGAGCACCAGAGGGCATGCTGCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GAACGAATGAATCAGTTAAAAATGGTTTTAAAGAAAATGCAAGAGGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113779 GAACGAATGAATCAGTTAAAAATGGTTTTAAAGAAAATGCAAGAGGCTCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AGAGTCAGCTACAGTTATATTTGCAGGAGATACAAATCTAAGGGATCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113829 AGAGTCAGCTACAGTTATATTTGCAGGAGATACAAATCTAAGGGATCGAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AG         GTTACCAGATGTGGTGGTTTACCCAACAACATTGTGGAT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113879 AGGTG...CAGGTTACCAGATGTGGTGGTTTACCCAACAACATTGTGGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GTCTGGGAGTTTTTGGGCAAACCTAAACATTGCCAGTATACATGGGATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115833 GTCTGGGAGTTTTTGGGCAAACCTAAACATTGCCAGTATACATGGGATAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 ACAAATGAACTCTAATCTTGGAATAACTGCTGCTTGTAAACTTCGTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115883 ACAAATGAACTCTAATCTTGGAATAACTGCTGCTTGTAAACTTCGTTTTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ATCGAATATTTTTCAGAGCAGCAGCAGAAGAGGGACACATTATTCCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115933 ATCGAATATTTTTCAGAGCAGCAGCAGAAGAGGGACACATTATTCCCCGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 AGTTTGGACCTTCTTGGATTAGAAAAACTGGACTGTGGTAGATTTCCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115983 AGTTTGGACCTTCTTGGATTAGAAAAACTGGACTGTGGTAGATTTCCTAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 TGATCACTGGGGTCTTCTGTGCAACTTAGATATAATATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116033 TGATCACTGGGGTCTTCTGTGCAACTTAGATATAATATTG