seq1 = pF1KB6498.tfa, 183 bp
seq2 = pF1KB6498/gi568815582f_56508991.tfa (gi568815582f:56508991_56683176), 174186 bp

>pF1KB6498 183
>gi568815582f:56508991_56683176 (Chr16)

1-28  (99666-99693)   100% ->
29-94  (100002-100067)   100% ->
95-183  (100273-100361)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATCCCAACTGCTCCTGCGCCGCCG         GTGACTCCTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
  99666 ATGGATCCCAACTGCTCCTGCGCCGCCGGTA...CAGGTGACTCCTGCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CTGCGCCGGCTCCTGCAAATGCAAAGAGTGCAAATGCACCTCCTGCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100015 CTGCGCCGGCTCCTGCAAATGCAAAGAGTGCAAATGCACCTCCTGCAAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAA         GCTGCTGCTCCTGCTGCCCTGTGGGCTGTGCCAAGTGT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100065 AAAGTA...CAGGCTGCTGCTCCTGCTGCCCTGTGGGCTGTGCCAAGTGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GCCCAGGGCTGCATCTGCAAAGGGGCGTCGGACAAGTGCAGCTGCTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100311 GCCCAGGGCTGCATCTGCAAAGGGGCGTCGGACAAGTGCAGCTGCTGCGC

    200 
    183 C
        |
 100361 C