seq1 = pF1KB6497.tfa, 1053 bp
seq2 = pF1KB6497/gi568815589r_68913040.tfa (gi568815589r:68913040_69114092), 201053 bp

>pF1KB6497 1053
>gi568815589r:68913040_69114092 (Chr9)

(complement)

1-1053  (100001-101053)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCAACGCCCCCGCCAAGAAGGACACCGAGCAGGAGGAGAGCGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCAACGCCCCCGCCAAGAAGGACACCGAGCAGGAGGAGAGCGTGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAGTTCCTAGCCAAAGCCAGAGGAGATTTCCTCTACAGATGGGGAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGAGTTCCTAGCCAAAGCCAGAGGAGATTTCCTCTACAGATGGGGAAACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGCTCAAAACACCGCCAGCTCGGATCAGTTCGAACGGCTCAGGACGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCGCTCAAAACACCGCCAGCTCGGATCAGTTCGAACGGCTCAGGACGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCATGGGCTCCTTCGGGCGGGTGATGCTGGTGAGGCACCAGGAGACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCATGGGCTCCTTCGGGCGGGTGATGCTGGTGAGGCACCAGGAGACCGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGGCCACTACGCCATGAAGATCCTCAACAAGCAGAAGGTGGTGAAGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGGCCACTACGCCATGAAGATCCTCAACAAGCAGAAGGTGGTGAAGATGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCAGGTCGAGCACATACTGAACGAGAAGCGCATCCTGCAGGCGATCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGCAGGTCGAGCACATACTGAACGAGAAGCGCATCCTGCAGGCGATCGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTTCCGTTCCTCGTCAAGCTCCAGTTCTCCTTTAAGGACAACTCCTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTTCCGTTCCTCGTCAAGCTCCAGTTCTCCTTTAAGGACAACTCCTACCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTACCTGGTGATGGAGTACGTGCCGGGTGGGGAGATGTTCTCCCGCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTACCTGGTGATGGAGTACGTGCCGGGTGGGGAGATGTTCTCCCGCCTAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGCGCGTCGGAAGGTTTAGCGAGCCCCATGCCTGTTTCTATGCCGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGCGCGTCGGAAGGTTTAGCGAGCCCCATGCCTGTTTCTATGCCGCCCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTCGTCCTGGCCGTCCAGTACCTACACTCGCTCGACCTCATCCACCGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTCGTCCTGGCCGTCCAGTACCTACACTCGCTCGACCTCATCCACCGCGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCTGAAGCCCGAGAATCTCCTCATCGACCAGCAGGGCTACCTGCAGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCTGAAGCCCGAGAATCTCCTCATCGACCAGCAGGGCTACCTGCAGGTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CGGACTTCGGTTTCGCCAAGCGCGTGAAGGGCCGCACTTGGACCTTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CGGACTTCGGTTTCGCCAAGCGCGTGAAGGGCCGCACTTGGACCTTGTGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGGACCCCAGAGTACCTGGCCCCCGAGATCATCCTGAGCAAAGGCTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGGACCCCAGAGTACCTGGCCCCCGAGATCATCCTGAGCAAAGGCTACAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CAAGGCCGTGGACTGGTGGGCCCTAGGGGTGCTCATCTATGAGATGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CAAGGCCGTGGACTGGTGGGCCCTAGGGGTGCTCATCTATGAGATGGCCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGGGCTTCCCACCCTTCTACGCCGACCAGCCCATCCAGATCTACGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGGGCTTCCCACCCTTCTACGCCGACCAGCCCATCCAGATCTACGAGAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATCGTCTCTGGGAGGGTGCGGTTTCCCTCCAAACTCAGCTCTGACCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATCGTCTCTGGGAGGGTGCGGTTTCCCTCCAAACTCAGCTCTGACCTCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GCATCTGCTGCGGAGCCTGCTGCAGGTGGACCTCACCAAGCGCTTCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GCATCTGCTGCGGAGCCTGCTGCAGGTGGACCTCACCAAGCGCTTCGGAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ACCTCAGGAACGGGGTTGGCGACATCAAGAACCACAAGTGGTTCGCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ACCTCAGGAACGGGGTTGGCGACATCAAGAACCACAAGTGGTTCGCCACA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ACCAGCTGGATCGCCATCTATGAGAAGAAGGTGGAAGCTCCCTTCATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ACCAGCTGGATCGCCATCTATGAGAAGAAGGTGGAAGCTCCCTTCATCCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GAAGTACACAGGCCCTGGGGATGCCAGTAACTTTGACGACTACGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GAAGTACACAGGCCCTGGGGATGCCAGTAACTTTGACGACTACGAGGAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AAGAGCTCCGGATCTCCATCAATGAGAAGTGTGCCAAGGAGTTTTCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AAGAGCTCCGGATCTCCATCAATGAGAAGTGTGCCAAGGAGTTTTCTGAG

   1050 
   1051 TTT
        |||
 101051 TTT