seq1 = pF1KB6487.tfa, 987 bp
seq2 = pF1KB6487/gi568815582r_29806875.tfa (gi568815582r:29806875_30026033), 219159 bp

>pF1KB6487 987
>gi568815582r:29806875_30026033 (Chr16)

(complement)

1-244  (100001-100244)   100% ->
245-414  (102675-102844)   100% ->
415-504  (113985-114074)   98% ->
505-557  (114167-114219)   100% ->
558-753  (114861-115056)   100% ->
754-987  (118926-119159)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGGCGGAGGCCTCGGGCCCGGCTGCCGCCGCGGCCCCGTCCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGGCGGAGGCCTCGGGCCCGGCTGCCGCCGCGGCCCCGTCCCTGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGCCCCCAAGCCCTCGGGTCTCGAGCCTGGCCCCGCCGCCTACGGTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGCCCCCAAGCCCTCGGGTCTCGAGCCTGGCCCCGCCGCCTACGGTCTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCCGCTGACCCCGAACAGCAAATACGTGAAGCTGAACGTGGGCGGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCCGCTGACCCCGAACAGCAAATACGTGAAGCTGAACGTGGGCGGCTCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGCACTACACCACGCTGCGCACCCTCACGGGACAGGACACCATGCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTGCACTACACCACGCTGCGCACCCTCACGGGACAGGACACCATGCTCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGCCATGTTCAGCGGCCGCGTGGAGGTGCTGACCGATGCCGGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100201 AGCCATGTTCAGCGGCCGCGTGGAGGTGCTGACCGATGCCGGAGGTA...

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    245    GTTGGGTGCTGATTGACCGGAGCGGCCGTCACTTTGGTACAATCCTC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102672 TAGGTTGGGTGCTGATTGACCGGAGCGGCCGTCACTTTGGTACAATCCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AATTACCTGCGGGATGGGTCTGTGCCACTGCCGGAGAGTACGAGAGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102722 AATTACCTGCGGGATGGGTCTGTGCCACTGCCGGAGAGTACGAGAGAACT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGGGGAGCTGCTGGGCGAAGCACGCTACTACCTGGTGCAGGGCCTGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102772 GGGGGAGCTGCTGGGCGAAGCACGCTACTACCTGGTGCAGGGCCTGATTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AGGACTGCCAGCTGGCGCTGCAG         CAAAAAAGGGAGACTCTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||| |||
 102822 AGGACTGCCAGCTGGCGCTGCAGGTG...CAGCAAAAAAGGGAGACGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TCCCCGCTGTGCCTCATCCCCATGGTGACATCTCCCCGGGAGGAGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114003 TCCCCGCTGTGCCTCATCCCCATGGTGACATCTCCCCGGGAGGAGCAGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GCTCCTGGCCAGCACCTCCAAG         CCCGTGGTGAAGCTCCTGC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 114053 GCTCCTGGCCAGCACCTCCAAGGTG...CAGCCCGTGGTGAAGCTCCTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACAACCGCAGTAACAACAAGTACTCCTACACCAG         CACTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 114186 ACAACCGCAGTAACAACAAGTACTCCTACACCAGGTG...CAGCACTTCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GATGACAACCTACTTAAGAACATCGAGCTGTTCGACAAGCTGGCCCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114868 GATGACAACCTACTTAAGAACATCGAGCTGTTCGACAAGCTGGCCCTGCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CTTCCACGGGCGGCTACTCTTCCTCAAGGATGTCCTGGGGGACGAGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114918 CTTCCACGGGCGGCTACTCTTCCTCAAGGATGTCCTGGGGGACGAGATCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GCTGCTGGTCTTTCTACGGGCAGGGCCGCAAAATCGCCGAGGTGTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114968 GCTGCTGGTCTTTCTACGGGCAGGGCCGCAAAATCGCCGAGGTGTGCTGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ACCTCCATTGTCTATGCTACGGAGAAGAAGCAGACCAAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 115018 ACCTCCATTGTCTATGCTACGGAGAAGAAGCAGACCAAGGTC...CAGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GGAATTTCCAGAGGCCCGGATCTTCGAGGAGACCCTGAACATCCTCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118928 GGAATTTCCAGAGGCCCGGATCTTCGAGGAGACCCTGAACATCCTCATCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ACGAGACTCCCCGGGGCCCAGACCCAGCCCTCCTGGAGGCCACAGGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118978 ACGAGACTCCCCGGGGCCCAGACCCAGCCCTCCTGGAGGCCACAGGGGGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GCAGCTGGAGCTGGTGGGGCTGGCCGCGGGGAGGATGAAGAGAACCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119028 GCAGCTGGAGCTGGTGGGGCTGGCCGCGGGGAGGATGAAGAGAACCGAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GCACCGTGTCCGCAGGATCCATGTCCGGCGCCATATCACCCACGACGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119078 GCACCGTGTCCGCAGGATCCATGTCCGGCGCCATATCACCCACGACGAGC

   1000     .    :    .    :    .    :
    956 GTCCTCATGGCCAACAAATTGTCTTCAAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 119128 GTCCTCATGGCCAACAAATTGTCTTCAAGGAC