seq1 = pF1KB6478.tfa, 1065 bp
seq2 = pF1KB6478/gi568815579r_4074706.tfa (gi568815579r:4074706_4282539), 207834 bp

>pF1KB6478 1065
>gi568815579r:4074706_4282539 (Chr19)

(complement)

1-66  (100001-100066)   100% ->
67-194  (101631-101758)   99% ->
195-377  (103254-103436)   100% ->
378-437  (105402-105461)   100% ->
438-533  (106603-106698)   100% ->
534-614  (106780-106860)   100% ->
615-738  (107389-107512)   100% ->
739-1065  (107594-107920)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGGTGAATTACGCGGCGGGGCTGTCGCCGTACGCGGACAAGGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGGTGAATTACGCGGCGGGGCTGTCGCCGTACGCGGACAAGGGCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTGCGGCCTCCCGGAG         ATCTTCGACCCCCCGGAGGAGCTGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100051 GTGCGGCCTCCCGGAGGTG...CAGATCTTCGACCCCCCGGAGGAGCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGCGGAAGGTGTGGGAACTGGCGAGGCTGGTCTGGCAGTCTTCCAATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
 101656 AGCGGAAGGTGTGGGAACTGGCGAGGCTGGTCTGGCAGTCTTCCAGTGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTGTTCCACACGGGTGCCGGCATCAGCACTGCCTCTGGCATCCCCGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101706 GTGTTCCACACGGGTGCCGGCATCAGCACTGCCTCTGGCATCCCCGACTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAG         GGGTCCCCACGGAGTCTGGACCATGGAGGAGCGAGGTC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101756 CAGGTC...CAGGGGTCCCCACGGAGTCTGGACCATGGAGGAGCGAGGTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGGCCCCCAAGTTCGACACCACCTTTGAGAGCGCGCGGCCCACGCAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103292 TGGCCCCCAAGTTCGACACCACCTTTGAGAGCGCGCGGCCCACGCAGACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CACATGGCGCTGGTGCAGCTGGAGCGCGTGGGCCTCCTCCGCTTCCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103342 CACATGGCGCTGGTGCAGCTGGAGCGCGTGGGCCTCCTCCGCTTCCTGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAGCCAGAACGTGGACGGGCTCCATGTGCGCTCAGGCTTCCCCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 103392 CAGCCAGAACGTGGACGGGCTCCATGTGCGCTCAGGCTTCCCCAGGTA..

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    378     GGACAAACTGGCAGAGCTCCACGGGAACATGTTTGTGGAAGAATGT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103442 .CAGGGACAAACTGGCAGAGCTCCACGGGAACATGTTTGTGGAAGAATGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCCAAGTGTAAGAC         GCAGTACGTCCGAGACACAGTCGTGGG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 105448 GCCAAGTGTAAGACGTG...CAGGCAGTACGTCCGAGACACAGTCGTGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CACCATGGGCCTGAAGGCCACGGGCCGGCTCTGCACCGTGGCTAAGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106630 CACCATGGGCCTGAAGGCCACGGGCCGGCTCTGCACCGTGGCTAAGGCAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GGGGGCTGCGAGCCTGCAG         GGGAGAGCTGAGGGACACCATC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 106680 GGGGGCTGCGAGCCTGCAGGTG...CAGGGGAGAGCTGAGGGACACCATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CTAGACTGGGAGGACTCCCTGCCCGACCGGGACCTGGCACTCGCCGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106802 CTAGACTGGGAGGACTCCCTGCCCGACCGGGACCTGGCACTCGCCGATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GGCCAGCAG         GAACGCCGACCTGTCCATCACGCTGGGTACAT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 106852 GGCCAGCAGGTC...CAGGAACGCCGACCTGTCCATCACGCTGGGTACAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CGCTGCAGATCCGGCCCAGCGGGAACCTGCCGCTGGCTACCAAGCGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107421 CGCTGCAGATCCGGCCCAGCGGGAACCTGCCGCTGGCTACCAAGCGCCGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GGAGGCCGCCTGGTCATCGTCAACCTGCAGCCCACCAAGCAC        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 107471 GGAGGCCGCCTGGTCATCGTCAACCTGCAGCCCACCAAGCACGTA...CA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    739  GACCGCCATGCTGACCTCCGCATCCATGGCTACGTTGACGAGGTCATGA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107593 GGACCGCCATGCTGACCTCCGCATCCATGGCTACGTTGACGAGGTCATGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CCCGGCTCATGAAGCACCTGGGGCTGGAGATCCCCGCCTGGGACGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107643 CCCGGCTCATGAAGCACCTGGGGCTGGAGATCCCCGCCTGGGACGGCCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CGTGTGCTGGAGAGGGCGCTGCCACCCCTGCCCCGCCCGCCCACCCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107693 CGTGTGCTGGAGAGGGCGCTGCCACCCCTGCCCCGCCCGCCCACCCCCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GCTGGAGCCCAAGGAGGAATCTCCCACCCGGATCAACGGCTCTATCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107743 GCTGGAGCCCAAGGAGGAATCTCCCACCCGGATCAACGGCTCTATCCCCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CCGGCCCCAAGCAGGAGCCCTGCGCCCAGCACAACGGCTCAGAGCCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107793 CCGGCCCCAAGCAGGAGCCCTGCGCCCAGCACAACGGCTCAGAGCCCGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 AGCCCCAAACGGGAGCGGCCCACCAGCCCTGCCCCCCACAGACCCCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107843 AGCCCCAAACGGGAGCGGCCCACCAGCCCTGCCCCCCACAGACCCCCCAA

   1100     .    :    .    :    .
   1038 AAGGGTGAAGGCCAAGGCGGTCCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||
 107893 AAGGGTGAAGGCCAAGGCGGTCCCCAGC