seq1 = pF1KB6474.tfa, 1065 bp
seq2 = pF1KB6474/gi568815591r_95198947.tfa (gi568815591r:95198947_95424475), 225529 bp

>pF1KB6474 1065
>gi568815591r:95198947_95424475 (Chr7)

(complement)

1-74  (100001-100074)   100% ->
75-145  (106083-106153)   100% ->
146-201  (107687-107742)   100% ->
202-370  (108986-109154)   100% ->
371-497  (112899-113025)   100% ->
498-698  (116265-116465)   100% ->
699-780  (118110-118191)   100% ->
781-909  (122143-122271)   100% ->
910-1065  (125374-125529)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGAAGCTGATTGCGCTCACCCTCTTGGGGATGGGACTGGCACTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGAAGCTGATTGCGCTCACCCTCTTGGGGATGGGACTGGCACTCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGGAACCACCAGTCTTCTTACCA         AACACGACTTAATGCTC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100051 CAGGAACCACCAGTCTTCTTACCAGTA...CAGAACACGACTTAATGCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCCGAGAGGTACAACCCGTAGAACTTCCTAACTGTAATTTAGTTAAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106100 TCCGAGAGGTACAACCCGTAGAACTTCCTAACTGTAATTTAGTTAAAGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATCG         AAACTGGCTCTGAAGACTTGGAGATACTGCCTAATGG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106150 ATCGGTA...CAGAAACTGGCTCTGAAGACTTGGAGATACTGCCTAATGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 ACTGGCTTTCATTAGCTCT         GGATTAAAGTATCCTGGAATAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 107724 ACTGGCTTTCATTAGCTCTGTG...AAGGGATTAAAGTATCCTGGAATAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AGAGCTTCAACCCCAACAGTCCTGGAAAAATACTTCTGATGGACCTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109008 AGAGCTTCAACCCCAACAGTCCTGGAAAAATACTTCTGATGGACCTGAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GAAGAAGATCCAACAGTGTTGGAATTGGGGATCACTGGAAGTAAATTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109058 GAAGAAGATCCAACAGTGTTGGAATTGGGGATCACTGGAAGTAAATTTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGTATCTTCATTTAACCCTCATGGGATTAGCACATTCACAGATGAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 109108 TGTATCTTCATTTAACCCTCATGGGATTAGCACATTCACAGATGAAGGTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    371       ATAATGCCATGTACCTCCTGGTGGTGAACCATCCAGATGCCAAG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109158 ...CAGATAATGCCATGTACCTCCTGGTGGTGAACCATCCAGATGCCAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TCCACAGTGGAGTTGTTTAAATTTCAAGAAGAAGAAAAATCGCTTTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112943 TCCACAGTGGAGTTGTTTAAATTTCAAGAAGAAGAAAAATCGCTTTTGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TCTAAAAACCATCAGACATAAACTTCTGCCTAA         TTTGAATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 112993 TCTAAAAACCATCAGACATAAACTTCTGCCTAAGTA...CAGTTTGAATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 ATATTGTTGCTGTGGGACCTGAGCACTTTTATGGCACAAATGATCACTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116273 ATATTGTTGCTGTGGGACCTGAGCACTTTTATGGCACAAATGATCACTAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TTTCTTGACCCCTACTTACAATCCTGGGAGATGTATTTGGGTTTAGCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116323 TTTCTTGACCCCTACTTACAATCCTGGGAGATGTATTTGGGTTTAGCGTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GTCGTATGTTGTCTACTATAGTCCAAGTGAAGTTCGAGTGGTGGCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116373 GTCGTATGTTGTCTACTATAGTCCAAGTGAAGTTCGAGTGGTGGCAGAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GATTTGATTTTGCTAATGGAATCAACATTTCACCCGATGGCAA       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 116423 GATTTGATTTTGCTAATGGAATCAACATTTCACCCGATGGCAAGTA...A

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    699   GTATGTCTATATAGCTGAGTTGCTGGCTCATAAGATTCATGTGTATGA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118108 AGGTATGTCTATATAGCTGAGTTGCTGGCTCATAAGATTCATGTGTATGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AAAGCATGCTAATTGGACTTTAACTCCATTGAAG         TCCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 118158 AAAGCATGCTAATTGGACTTTAACTCCATTGAAGGTA...AAGTCCCTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 ACTTTAATACCCTCGTGGATAACATATCTGTGGATCCTGAGACAGGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122150 ACTTTAATACCCTCGTGGATAACATATCTGTGGATCCTGAGACAGGAGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CTTTGGGTTGGATGCCATCCCAATGGCATGAAAATCTTCTTCTATGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122200 CTTTGGGTTGGATGCCATCCCAATGGCATGAAAATCTTCTTCTATGACTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 AGAGAATCCTCCTGCATCAGAG         GTGCTTCGAATCCAGAACA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 122250 AGAGAATCCTCCTGCATCAGAGGTA...CAGGTGCTTCGAATCCAGAACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TTCTAACAGAAGAACCTAAAGTGACACAGGTTTATGCAGAAAATGGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125393 TTCTAACAGAAGAACCTAAAGTGACACAGGTTTATGCAGAAAATGGCACA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GTGTTGCAAGGCAGTACAGTTGCCTCTGTGTACAAAGGGAAACTGCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125443 GTGTTGCAAGGCAGTACAGTTGCCTCTGTGTACAAAGGGAAACTGCTGAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .
   1029 TGGCACAGTGTTTCACAAAGCTCTTTACTGTGAGCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125493 TGGCACAGTGTTTCACAAAGCTCTTTACTGTGAGCTC