seq1 = pF1KB6470.tfa, 1062 bp
seq2 = pF1KB6470/gi568815591r_74132109.tfa (gi568815591r:74132109_74354383), 222275 bp

>pF1KB6470 1062
>gi568815591r:74132109_74354383 (Chr7)

(complement)

1-113  (100001-100113)   100% ->
114-183  (101886-101955)   100% ->
184-225  (104604-104645)   100% ->
226-332  (105266-105372)   100% ->
333-434  (107621-107722)   100% ->
435-535  (111138-111238)   100% ->
536-693  (114289-114446)   100% ->
694-759  (115396-115461)   100% ->
760-840  (116942-117022)   100% ->
841-954  (118739-118852)   100% ->
955-1062  (122168-122275)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGTGGAGGCCGTCTGTGGTGGCGCGGGCGAGGTGGAGGCCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGTGGAGGCCGTCTGTGGTGGCGCGGGCGAGGTGGAGGCCCAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCTGACCCTGCCCCTGCCTTCAGCAAGGCCCCCGGCAGCGCCGGCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCTGACCCTGCCCCTGCCTTCAGCAAGGCCCCCGGCAGCGCCGGCCACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACGAACTGCCGTG         GGTTGAAAAATATAGGCCAGTAAAGCTG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACGAACTGCCGTGGTG...CAGGGTTGAAAAATATAGGCCAGTAAAGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AATGAAATTGTCGGGAATGAAGACACCGTGAGCAGGCTAGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 101914 AATGAAATTGTCGGGAATGAAGACACCGTGAGCAGGCTAGAGGTG...TA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    184  GTCTTTGCAAGGGAAGGAAATGTGCCCAACATCATCATTGCG       
        >||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 104603 GGTCTTTGCAAGGGAAGGAAATGTGCCCAACATCATCATTGCGGTG...C

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    226   GGCCCTCCAGGAACCGGCAAGACCACAAGCATTCTGTGCTTGGCCCGG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105264 AGGGCCCTCCAGGAACCGGCAAGACCACAAGCATTCTGTGCTTGGCCCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GCCCTGCTGGGCCCAGCACTCAAAGATGCCATGTTGGAACTCAATGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105314 GCCCTGCTGGGCCCAGCACTCAAAGATGCCATGTTGGAACTCAATGCTTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AAATGACAG         GGGCATTGACGTTGTGAGGAATAAAATTAAAA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 105364 AAATGACAGGTA...CAGGGGCATTGACGTTGTGAGGAATAAAATTAAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TGTTTGCTCAACAAAAAGTCACTCTTCCCAAAGGCCGACATAAGATCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107653 TGTTTGCTCAACAAAAAGTCACTCTTCCCAAAGGCCGACATAAGATCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ATTCTGGATGAAGCAGACAG         CATGACCGACGGAGCCCAGCA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 107703 ATTCTGGATGAAGCAGACAGGTA...CAGCATGACCGACGGAGCCCAGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 AGCCTTGAGGAGAACCATGGAAATCTACTCTAAAACCACTCGCTTCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111159 AGCCTTGAGGAGAACCATGGAAATCTACTCTAAAACCACTCGCTTCGCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TTGCTTGTAATGCTTCGGATAAGATCATCG         AGCCCATTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 111209 TTGCTTGTAATGCTTCGGATAAGATCATCGGTG...CAGAGCCCATTCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 TCCCGCTGTGCAGTCCTCCGGTACACAAAGCTGACCGACGCCCAGATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114300 TCCCGCTGTGCAGTCCTCCGGTACACAAAGCTGACCGACGCCCAGATCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CACCAGGCTGATGAATGTTATCGAGAAGGAGAGGGTACCCTACACTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114350 CACCAGGCTGATGAATGTTATCGAGAAGGAGAGGGTACCCTACACTGATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 ACGGCCTAGAAGCCATCATCTTCACGGCCCAGGGAGACATGAGGCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 114400 ACGGCCTAGAAGCCATCATCTTCACGGCCCAGGGAGACATGAGGCAGGTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    694       GCGCTGAACAACCTGCAGTCCACCTTCTCAGGATTTGGCTTCAT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114450 ...CAGGCGCTGAACAACCTGCAGTCCACCTTCTCAGGATTTGGCTTCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 TAACAGTGAGAACGTGTTCAAG         GTCTGTGACGAGCCCCACC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 115440 TAACAGTGAGAACGTGTTCAAGGTA...CAGGTCTGTGACGAGCCCCACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 CACTGCTGGTAAAGGAGATGATCCAGCACTGTGTGAATGCCAACATTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116961 CACTGCTGGTAAAGGAGATGATCCAGCACTGTGTGAATGCCAACATTGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 GAAGCCTACAAG         ATTCTTGCTCACTTGTGGCATCTGGGCTA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 117011 GAAGCCTACAAGGTT...TAGATTCTTGCTCACTTGTGGCATCTGGGCTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 CTCACCAGAAGATATCATTGGCAACATCTTTCGAGTGTGTAAAACTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118768 CTCACCAGAAGATATCATTGGCAACATCTTTCGAGTGTGTAAAACTTTCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 AAATGGCAGAATACCTGAAACTGGAGTTTATCAAG         GAAATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 118818 AAATGGCAGAATACCTGAAACTGGAGTTTATCAAGGTC...CAGGAAATT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 GGATACACTCACATGAAAATAGCGGAAGGAGTGAACTCTCTTTTGCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122174 GGATACACTCACATGAAAATAGCGGAAGGAGTGAACTCTCTTTTGCAGAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 GGCAGGCCTCCTGGCAAGGCTGTGTCAGAAGACAATGGCCCCGGTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122224 GGCAGGCCTCCTGGCAAGGCTGTGTCAGAAGACAATGGCCCCGGTGGCCA

   1150 
   1061 GT
        ||
 122274 GT