seq1 = pF1KB6461.tfa, 963 bp
seq2 = pF1KB6461/gi568815579r_7589196.tfa (gi568815579r:7589196_7798857), 209662 bp

>pF1KB6461 963
>gi568815579r:7589196_7798857 (Chr19)

(complement)

1-22  (99098-99119)   100% ->
23-136  (100004-100117)   100% ->
137-190  (100449-100502)   100% ->
191-253  (101269-101331)   100% ->
254-316  (101560-101622)   100% ->
317-379  (101783-101845)   100% ->
380-469  (101944-102033)   100% ->
470-621  (108301-108452)   100% ->
622-728  (108593-108699)   100% ->
729-963  (109428-109662)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGAAGGTCAATATTCAG         AGATCGAGGAGCTTCCCAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
  99098 ATGGAGGAAGGTCAATATTCAGGTA...CAGAGATCGAGGAGCTTCCCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GAGGCGGTGTTGCAGGCGTGGGACTCAGATCGTGCTGCTGGGGCTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100023 GAGGCGGTGTTGCAGGCGTGGGACTCAGATCGTGCTGCTGGGGCTGGTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCGCCGCTCTGTGGGCTGGGCTGCTGACTCTGCTTCTCCTGTGGC     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100073 CCGCCGCTCTGTGGGCTGGGCTGCTGACTCTGCTTCTCCTGTGGCGTG..

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    137     ACTGGGACACCACACAGAGTCTAAAACAGCTGGAAGAGAGGGCTGC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100123 .CAGACTGGGACACCACACAGAGTCTAAAACAGCTGGAAGAGAGGGCTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCGGAACG         TCTCTCAAGTTTCCAAGAACTTGGAAAGCCACC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100495 CCGGAACGGTA...CAGTCTCTCAAGTTTCCAAGAACTTGGAAAGCCACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 ACGGTGACCAGATGGCGCAGAAATCCCAGT         CCACGCAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 101302 ACGGTGACCAGATGGCGCAGAAATCCCAGTGTG...CAGCCACGCAGATT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    265 TCACAGGAACTGGAGGAACTTCGAGCTGAACAGCAGAGATTGAAATCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101571 TCACAGGAACTGGAGGAACTTCGAGCTGAACAGCAGAGATTGAAATCTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GG         ACTTGGAGCTGTCCTGGAACCTGAACGGGCTTCAAGCAG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101621 GGGTG...CAGACTTGGAGCTGTCCTGGAACCTGAACGGGCTTCAAGCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    356 ATCTGAGCAGCTTCAAGTCCCAGG         AATTGAACGAGAGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 101822 ATCTGAGCAGCTTCAAGTCCCAGGGTG...AAGAATTGAACGAGAGGAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    397 GAAGCTTCAGATTTGCTGGAAAGACTCCGGGAGGAGGTGACAAAGCTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101961 GAAGCTTCAGATTTGCTGGAAAGACTCCGGGAGGAGGTGACAAAGCTAAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    447 GATGGAGTTGCAGGTGTCCAGCG         GCTTTGTGTGCAACACGT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 102011 GATGGAGTTGCAGGTGTCCAGCGGTG...CAGGCTTTGTGTGCAACACGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    488 GCCCTGAAAAGTGGATCAATTTCCAACGGAAGTGCTACTACTTCGGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108319 GCCCTGAAAAGTGGATCAATTTCCAACGGAAGTGCTACTACTTCGGCAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 GGCACCAAGCAGTGGGTCCACGCCCGGTATGCCTGTGACGACATGGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108369 GGCACCAAGCAGTGGGTCCACGCCCGGTATGCCTGTGACGACATGGAAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 GCAGCTGGTCAGCATCCACAGCCCGGAGGAGCAG         GACTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 108419 GCAGCTGGTCAGCATCCACAGCCCGGAGGAGCAGGTG...CAGGACTTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    629 TGACCAAGCATGCCAGCCACACCGGCTCCTGGATTGGCCTTCGGAACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108600 TGACCAAGCATGCCAGCCACACCGGCTCCTGGATTGGCCTTCGGAACTTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 GACCTGAAGGGGGAGTTTATCTGGGTGGATGGGAGCCACGTGGACTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108650 GACCTGAAGGGGGAGTTTATCTGGGTGGATGGGAGCCACGTGGACTACAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729          CAACTGGGCTCCAGGGGAGCCCACCAGCCGGAGCCAGGGCG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108700 GTG...CAGCAACTGGGCTCCAGGGGAGCCCACCAGCCGGAGCCAGGGCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 AGGACTGCGTGATGATGCGGGGCTCCGGTCGCTGGAACGACGCCTTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109469 AGGACTGCGTGATGATGCGGGGCTCCGGTCGCTGGAACGACGCCTTCTGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 GACCGTAAGCTGGGCGCCTGGGTGTGCGACCAGCTGGCCACATGCACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 109519 GACCGTAAGCTGGGCGCCTGGGTGTGCGACCGGCTGGCCACATGCACGCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 GCCAGCCAGCGAAGGTTCCGCGGAGTCCATGGGACCTGATTCAAGACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109569 GCCAGCCAGCGAAGGTTCCGCGGAGTCCATGGGACCTGATTCAAGACCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :
    920 ACCCTGACGGCCGCCTGCCCACCCCCTCTGCCCCTCTCCACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109619 ACCCTGACGGCCGCCTGCCCACCCCCTCTGCCCCTCTCCACTCT