seq1 = pF1KB6460.tfa, 1053 bp
seq2 = pF1KB6460/gi568815579r_13993115.tfa (gi568815579r:13993115_14217547), 224433 bp

>pF1KB6460 1053
>gi568815579r:13993115_14217547 (Chr19)

(complement)

1-46  (100001-100046)   100% ->
47-108  (110139-110200)   100% ->
109-237  (110660-110788)   100% ->
238-336  (114634-114732)   100% ->
337-419  (116640-116722)   100% ->
420-546  (119658-119784)   100% ->
547-642  (119874-119969)   100% ->
643-765  (120065-120187)   100% ->
766-930  (123756-123920)   100% ->
931-1053  (124311-124433)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCAACGCCGCCGCCGCCAAGAAGGGCAGCGAGCAGGAGAGCG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100001 ATGGGCAACGCCGCCGCCGCCAAGAAGGGCAGCGAGCAGGAGAGCGGTG.

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     47      TGAAAGAATTCTTAGCCAAAGCCAAAGAAGATTTTCTTAAAAAAT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ..CAGTGAAAGAATTCTTAGCCAAAGCCAAAGAAGATTTTCTTAAAAAAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGGAAAGTCCCGCTCAG         AACACAGCCCACTTGGATCAGTTT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 110184 GGGAAAGTCCCGCTCAGGTA...CAGAACACAGCCCACTTGGATCAGTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GAACGAATCAAGACCCTCGGCACGGGCTCCTTCGGGCGGGTGATGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110684 GAACGAATCAAGACCCTCGGCACGGGCTCCTTCGGGCGGGTGATGCTGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GAAACACAAGGAGACCGGGAACCACTATGCCATGAAGATCCTCGACAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110734 GAAACACAAGGAGACCGGGAACCACTATGCCATGAAGATCCTCGACAAAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGAAG         GTGGTGAAACTGAAACAGATCGAACACACCCTGAAT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110784 AGAAGGTG...CAGGTGGTGAAACTGAAACAGATCGAACACACCCTGAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GAAAAGCGCATCCTGCAAGCTGTCAACTTTCCGTTCCTCGTCAAACTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114670 GAAAAGCGCATCCTGCAAGCTGTCAACTTTCCGTTCCTCGTCAAACTCGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GTTCTCCTTCAAG         GACAACTCAAACTTATACATGGTCATGG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 114720 GTTCTCCTTCAAGGTG...CAGGACAACTCAAACTTATACATGGTCATGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AGTACGTGCCCGGCGGGGAGATGTTCTCACACCTACGGCGGATCGGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116668 AGTACGTGCCCGGCGGGGAGATGTTCTCACACCTACGGCGGATCGGAAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TTCAG         TGAGCCCCATGCCCGTTTCTACGCGGCCCAGATCGT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116718 TTCAGGTA...CAGTGAGCCCCATGCCCGTTTCTACGCGGCCCAGATCGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CCTGACCTTTGAGTATCTGCACTCGCTGGATCTCATCTACAGGGACCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119694 CCTGACCTTTGAGTATCTGCACTCGCTGGATCTCATCTACAGGGACCTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AGCCGGAGAATCTGCTCATTGACCAGCAGGGCTACATTCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 119744 AGCCGGAGAATCTGCTCATTGACCAGCAGGGCTACATTCAGGTG...CAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 GTGACAGACTTCGGTTTCGCCAAGCGCGTGAAGGGCCGCACTTGGACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119874 GTGACAGACTTCGGTTTCGCCAAGCGCGTGAAGGGCCGCACTTGGACCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GTGCGGCACCCCTGAGTACCTGGCCCCTGAGATTATCCTGAGCAAA    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 119924 GTGCGGCACCCCTGAGTACCTGGCCCCTGAGATTATCCTGAGCAAAGTA.

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    643      GGCTACAACAAGGCCGTGGACTGGTGGGCCCTGGGGGTTCTTATC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119974 ..CAGGGCTACAACAAGGCCGTGGACTGGTGGGCCCTGGGGGTTCTTATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 TATGAAATGGCCGCTGGCTACCCGCCCTTCTTCGCAGACCAGCCCATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120110 TATGAAATGGCCGCTGGCTACCCGCCCTTCTTCGCAGACCAGCCCATCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GATCTATGAGAAGATCGTCTCTGGGAAG         GTGCGCTTCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 120160 GATCTATGAGAAGATCGTCTCTGGGAAGGTG...CAGGTGCGCTTCCCTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 CCCACTTCAGCTCTGACTTGAAGGACCTGCTGCGGAACCTCCTGCAGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123769 CCCACTTCAGCTCTGACTTGAAGGACCTGCTGCGGAACCTCCTGCAGGTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 GATCTCACCAAGCGCTTTGGGAACCTCAAGAATGGGGTCAACGATATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123819 GATCTCACCAAGCGCTTTGGGAACCTCAAGAATGGGGTCAACGATATCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GAACCACAAGTGGTTTGCCACAACTGACTGGATTGCCATCTACCAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123869 GAACCACAAGTGGTTTGCCACAACTGACTGGATTGCCATCTACCAGAGGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 AG         GTGGAAGCTCCCTTCATACCAAAGTTTAAAGGCCCTGGG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123919 AGGTG...CAGGTGGAAGCTCCCTTCATACCAAAGTTTAAAGGCCCTGGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GATACGAGTAACTTTGACGACTATGAGGAAGAAGAAATCCGGGTCTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124350 GATACGAGTAACTTTGACGACTATGAGGAAGAAGAAATCCGGGTCTCCAT

   1100     .    :    .    :    .    :
   1020 CAATGAGAAGTGTGGCAAGGAGTTTTCTGAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124400 CAATGAGAAGTGTGGCAAGGAGTTTTCTGAGTTT