seq1 = pF1KB6455.tfa, 954 bp
seq2 = pF1KB6455/gi568815575f_107528629.tfa (gi568815575f:107528629_107750029), 221401 bp

>pF1KB6455 954
>gi568815575f:107528629_107750029 (ChrX)

1-122  (100001-100122)   100% ->
123-306  (110667-110850)   100% ->
307-405  (112274-112372)   100% ->
406-530  (113738-113862)   100% ->
531-704  (116549-116722)   100% ->
705-864  (118978-119137)   100% ->
865-954  (121312-121401)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGAATATCAAAATCTTCAGCGGCAGCTCCCACCAGGACTTATCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGAATATCAAAATCTTCAGCGGCAGCTCCCACCAGGACTTATCTCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAAATTGCTGACCGCCTGGGCCTGGAGCTAGGCAAGGTGGTGACTAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAAAATTGCTGACCGCCTGGGCCTGGAGCTAGGCAAGGTGGTGACTAAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AATTCAGCAACCAGGAGACCTG         TGTGGAAATTGGTGAAAGT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100101 AATTCAGCAACCAGGAGACCTGGTA...TAGTGTGGAAATTGGTGAAAGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTACGTGGAGAGGATGTCTACATTGTTCAGAGTGGTTGTGGCGAAATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110686 GTACGTGGAGAGGATGTCTACATTGTTCAGAGTGGTTGTGGCGAAATCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGACAATTTAATGGAGCTTTTGATCATGATTAATGCCTGCAAGATTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110736 TGACAATTTAATGGAGCTTTTGATCATGATTAATGCCTGCAAGATTGCTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAGCCAGCCGGGTTACTGCAGTCATCCCATGCTTCCCTTATGCCCGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110786 CAGCCAGCCGGGTTACTGCAGTCATCCCATGCTTCCCTTATGCCCGGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GATAAGAAAGATAAG         AGCCGGGCGCCAATCTCAGCCAAGCT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 110836 GATAAGAAAGATAAGGTA...TAGAGCCGGGCGCCAATCTCAGCCAAGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGTTGCAAATATGCTATCTGTAGCAGGTGCAGATCATATTATCACCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112300 TGTTGCAAATATGCTATCTGTAGCAGGTGCAGATCATATTATCACCATGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACCTACATGCTTCTCAAATTCAG         GGCTTTTTTGATATCCCA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 112350 ACCTACATGCTTCTCAAATTCAGGTA...CAGGGCTTTTTTGATATCCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTAGACAATTTGTATGCAGAGCCGGCTGTCCTAAAGTGGATAAGGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113756 GTAGACAATTTGTATGCAGAGCCGGCTGTCCTAAAGTGGATAAGGGAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TATCTCTGAGTGGAGGAACTGCACTATTGTCTCACCTGATGCTGGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113806 TATCTCTGAGTGGAGGAACTGCACTATTGTCTCACCTGATGCTGGTGGAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTAAGAG         AGTGACCTCCATTGCAGACAGGCTGAATGTGGAC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113856 CTAAGAGGTA...CAGAGTGACCTCCATTGCAGACAGGCTGAATGTGGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TTTGCCTTGATTCACAAAGAACGGAAGAAGGCCAATGAAGTGGACCGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116583 TTTGCCTTGATTCACAAAGAACGGAAGAAGGCCAATGAAGTGGACCGCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GGTGCTTGTGGGAGATGTGAAGGATCGGGTGGCCATCCTTGTGGATGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116633 GGTGCTTGTGGGAGATGTGAAGGATCGGGTGGCCATCCTTGTGGATGACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TGGCTGACACTTGTGGCACAATCTGCCATGCAGCTGACAA         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 116683 TGGCTGACACTTGTGGCACAATCTGCCATGCAGCTGACAAGTA...TAGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CTTCTCTCAGCTGGCGCCACCAGAGTTTATGCCATCTTGACTCATGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118979 CTTCTCTCAGCTGGCGCCACCAGAGTTTATGCCATCTTGACTCATGGAAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CTTCTCCGGTCCTGCTATTTCTCGCATCAACAACGCATGCTTTGAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119029 CTTCTCCGGTCCTGCTATTTCTCGCATCAACAACGCATGCTTTGAGGCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TAGTAGTCACCAATACCATACCTCAGGAGGACAAGATGAAGCATTGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119079 TAGTAGTCACCAATACCATACCTCAGGAGGACAAGATGAAGCATTGCTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AAAATACAG         GTGATTGACATCTCTATGATCCTTGCAGAAGC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 119129 AAAATACAGGTG...TAGGTGATTGACATCTCTATGATCCTTGCAGAAGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CATCAGGAGAACTCACAATGGAGAATCCGTTTCTTACCTATTCAGCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121344 CATCAGGAGAACTCACAATGGAGAATCCGTTTCTTACCTATTCAGCCATG

   1000     .
    947 TCCCTTTA
        ||||||||
 121394 TCCCTTTA