seq1 = pF1KB6453.tfa, 954 bp
seq2 = pF1KB6453/gi568815584f_20355646.tfa (gi568815584f:20355646_20557505), 201860 bp

>pF1KB6453 954
>gi568815584f:20355646_20557505 (Chr14)

1-58  (100001-100058)   100% ->
59-246  (100269-100456)   100% ->
247-439  (101023-101215)   100% ->
440-954  (101346-101860)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGAAGCGTGGGAAAAAGGGAGCGGTGGCGGAAGACGGGGATGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGAAGCGTGGGAAAAAGGGAGCGGTGGCGGAAGACGGGGATGAGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGGACAG         AGCCAGAGGCCAAGAAGAGTAAGACGGCCGCAA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGGACAGGTA...TAGAGCCAGAGGCCAAGAAGAGTAAGACGGCCGCAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGAAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100302 AGAAAAATGACAAAGAGGCAGCAGGAGAGGGCCCAGCCCTGTATGAGGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCCCCAGATCAGAAAACCTCACCCAGTGGCAAACCTGCCACACTCAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100352 CCCCCAGATCAGAAAACCTCACCCAGTGGCAAACCTGCCACACTCAAGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTGCTCTTGGAATGTGGATGGGCTTCGAGCCTGGATTAAGAAGAAAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100402 CTGCTCTTGGAATGTGGATGGGCTTCGAGCCTGGATTAAGAAGAAAGGAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TAGAT         TGGGTAAAGGAAGAAGCCCCAGATATACTGTGCCTT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100452 TAGATGTG...CAGTGGGTAAAGGAAGAAGCCCCAGATATACTGTGCCTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAAGAGACCAAATGTTCAGAGAACAAACTACCAGCTGAACTTCAGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101059 CAAGAGACCAAATGTTCAGAGAACAAACTACCAGCTGAACTTCAGGAGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCCTGGACTCTCTCATCAATACTGGTCAGCTCCTTCGGACAAGGAAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101109 GCCTGGACTCTCTCATCAATACTGGTCAGCTCCTTCGGACAAGGAAGGGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACAGTGGCGTGGGCCTGCTTTCCCGCCAGTGCCCACTCAAAGTTTCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101159 ACAGTGGCGTGGGCCTGCTTTCCCGCCAGTGCCCACTCAAAGTTTCTTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGCATAG         GCGAGGAGGAGCATGATCAGGAAGGCCGGGTGAT
        |||||||>>>...>>>|||| |||||||||||||||||||||||||||||
 101209 GGCATAGGTG...TAGGCGATGAGGAGCATGATCAGGAAGGCCGGGTGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGTGGCTGAATTTGACTCGTTTGTGCTGGTAACAGCATATGTACCTAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101380 TGTGGCTGAATTTGACTCGTTTGTGCTGGTAACAGCATATGTACCTAATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CAGGCCGAGGTCTGGTACGACTGGAGTACCGGCAGCGCTGGGATGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101430 CAGGCCGAGGTCTGGTACGACTGGAGTACCGGCAGCGCTGGGATGAAGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TTTCGCAAGTTCCTGAAGGGCCTGGCTTCCCGAAAGCCCCTTGTGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101480 TTTCGCAAGTTCCTGAAGGGCCTGGCTTCCCGAAAGCCCCTTGTGCTGTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TGGAGACCTCAATGTGGCACATGAAGAAATTGACCTTCGCAACCCCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101530 TGGAGACCTCAATGTGGCACATGAAGAAATTGACCTTCGCAACCCCAAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GGAACAAAAAGAATGCTGGCTTCACGCCACAAGAGCGCCAAGGCTTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101580 GGAACAAAAAGAATGCTGGCTTCACGCCACAAGAGCGCCAAGGCTTCGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GAATTACTGCAGGCTGTGCCACTGGCTGACAGCTTTAGGCACCTCTACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101630 GAATTACTGCAGGCTGTGCCACTGGCTGACAGCTTTAGGCACCTCTACCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CAACACACCCTATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101680 CAACACACCCTATGCCTACACCTTTTGGACTTATATGATGAATGCTCGAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CCAAGAATGTTGGTTGGCGCCTTGATTACTTTTTGTTGTCCCACTCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101730 CCAAGAATGTTGGTTGGCGCCTTGATTACTTTTTGTTGTCCCACTCTCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 TTACCTGCATTGTGTGACAGCAAGATCCGTTCCAAGGCCCTCGGCAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101780 TTACCTGCATTGTGTGACAGCAAGATCCGTTCCAAGGCCCTCGGCAGTGA

    950     .    :    .    :    .    :
    924 TCACTGTCCTATCACCCTATACCTAGCACTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 101830 TCACTGTCCTATCACCCTATACCTAGCACTG