seq1 = pF1KB6448.tfa, 1047 bp
seq2 = pF1KB6448/gi568815588f_100435959.tfa (gi568815588f:100435959_100648134), 212176 bp

>pF1KB6448 1047
>gi568815588f:100435959_100648134 (Chr10)

1-177  (100001-100177)   100% ->
178-428  (100453-100703)   100% ->
429-577  (104676-104824)   100% ->
578-723  (108993-109138)   100% ->
724-830  (109985-110091)   100% ->
831-894  (110560-110623)   100% ->
895-1005  (111182-111292)   100% ->
1006-1047  (112135-112176)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGACAGCGGCGGAGGCTGTGGCCTCTGGCTCTGGAGAGCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCGACAGCGGCGGAGGCTGTGGCCTCTGGCTCTGGAGAGCCCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGGAGGCTGGAGCCCTCGGCCCCGCCTGGGATGAATCCCAGTTGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGGAGGCTGGAGCCCTCGGCCCCGCCTGGGATGAATCCCAGTTGCGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTTATAGCTTCCCGACTAGGCCCATTCCGCGTCTGAGTCAGAGCGACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTTATAGCTTCCCGACTAGGCCCATTCCGCGTCTGAGTCAGAGCGACCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGGGCAGAGGAGCTTATTGAGAATGAG         GAGCCTGTGGTGCT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100151 CGGGCAGAGGAGCTTATTGAGAATGAGGTG...TAGGAGCCTGTGGTGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GACCGACACAAATCTTGTGTATCCTGCCCTGAAATGGGACCTTGAATACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100467 GACCGACACAAATCTTGTGTATCCTGCCCTGAAATGGGACCTTGAATACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGCAAGAGAATATTGGCAATGGAGACTTCTCTGTGTACAGTGCCAGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100517 TGCAAGAGAATATTGGCAATGGAGACTTCTCTGTGTACAGTGCCAGCACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CACAAGTTCTTGTACTATGATGAGAAGAAGATGGCCAATTTCCAGAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100567 CACAAGTTCTTGTACTATGATGAGAAGAAGATGGCCAATTTCCAGAACTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TAAGCCGAGGTCCAACAGGGAAGAAATGAAATTTCATGAGTTCGTTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100617 TAAGCCGAGGTCCAACAGGGAAGAAATGAAATTTCATGAGTTCGTTGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AACTGCAGGATATACAGCAGCGAGGAGGGGAAGAGAG         GTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100667 AACTGCAGGATATACAGCAGCGAGGAGGGGAAGAGAGGTA...TAGGTTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TATCTGCAGCAAACGCTCAATGACACTGTGGGCAGGAAGATTGTCATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104680 TATCTGCAGCAAACGCTCAATGACACTGTGGGCAGGAAGATTGTCATGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTTCTTAGGTTTTAACTGGAACTGGATTAATAAGCAACAGGGAAAGCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104730 CTTCTTAGGTTTTAACTGGAACTGGATTAATAAGCAACAGGGAAAGCGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GCTGGGGGCAGCTTACCTCTAACCTGCTGCTCATTGGCATGGAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 104780 GCTGGGGGCAGCTTACCTCTAACCTGCTGCTCATTGGCATGGAAGGTA..

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    578     GAAATGTGACACCTGCTCACTATGATGAGCAGCAGAACTTTTTTGC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104830 .CAGGAAATGTGACACCTGCTCACTATGATGAGCAGCAGAACTTTTTTGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TCAGATAAAAGGTTACAAACGATGCATCTTATTCCCTCCGGATCAGTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109039 TCAGATAAAAGGTTACAAACGATGCATCTTATTCCCTCCGGATCAGTTCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AGTGCCTCTACCCATACCCTGTTCATCACCCATGTGACAGACAGAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109089 AGTGCCTCTACCCATACCCTGTTCATCACCCATGTGACAGACAGAGCCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724          GTGGACTTTGACAATCCCGACTACGAGAGGTTCCCTAATTT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109139 GTG...TAGGTGGACTTTGACAATCCCGACTACGAGAGGTTCCCTAATTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CCAAAATGTGGTTGGTTACGAAACAGTGGTTGGCCCTGGTGATGTTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110026 CCAAAATGTGGTTGGTTACGAAACAGTGGTTGGCCCTGGTGATGTTCTTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ACATCCCAATGTACTG         GTGGCATCACATAGAGTCATTACTA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 110076 ACATCCCAATGTACTGGTG...CAGGTGGCATCACATAGAGTCATTACTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AATGGGGGGATTACCATCACTGTGAACTTCTGGTATAAG         GG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 110585 AATGGGGGGATTACCATCACTGTGAACTTCTGGTATAAGGTG...TAGGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GGCTCCCACCCCTAAGAGAATTGAATATCCTCTCAAAGCTCATCAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111184 GGCTCCCACCCCTAAGAGAATTGAATATCCTCTCAAAGCTCATCAGAAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TGGCCATAATGAGAAACATTGAGAAGATGCTTGGAGAGGCCTTGGGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111234 TGGCCATAATGAGAAACATTGAGAAGATGCTTGGAGAGGCCTTGGGGAAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CCACAAGAG         GTGGGGCCCTTGTTGAACACAATGATCAAGGG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 111284 CCACAAGAGGTA...CAGGTGGGGCCCTTGTTGAACACAATGATCAAGGG

   1100     .    :
   1038 CCGATACAAC
        ||||||||||
 112167 CCGATACAAC