seq1 = pF1KB6437.tfa, 939 bp
seq2 = pF1KB6437/gi568815593r_73452800.tfa (gi568815593r:73452800_73662881), 210082 bp

>pF1KB6437 939
>gi568815593r:73452800_73662881 (Chr5)

(complement)

1-289  (100001-100289)   100% ->
290-448  (101594-101752)   100% ->
449-514  (105242-105307)   100% ->
515-612  (107297-107394)   100% ->
613-738  (107896-108021)   100% ->
739-805  (108494-108560)   100% ->
806-886  (109396-109476)   100% ->
887-939  (110030-110082)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATACATCAACAAATCTGGATATTGGAGCCCAGCTTATCGTGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATACATCAACAAATCTGGATATTGGAGCCCAGCTTATCGTGGAAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTGTCCCAGCACTTATAGCCTAACTGGCATGCCAGACATTAAAATAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTGTCCCAGCACTTATAGCCTAACTGGCATGCCAGACATTAAAATAGAAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATCCACTGGACCCAAATTCAGAAGAAGGGTCAGCTCAGGGTGTTGCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATCCACTGGACCCAAATTCAGAAGAAGGGTCAGCTCAGGGTGTTGCCATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGAATGAAATTCATATTGCCTAACCGATTTGATATGAATGTGTGTTCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGAATGAAATTCATATTGCCTAACCGATTTGATATGAATGTGTGTTCTCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ATTTGTGAAGTCCTTAAATGAAGAAGATAGTAAAAATATTCAAGATCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ATTTGTGAAGTCCTTAAATGAAGAAGATAGTAAAAATATTCAAGATCAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTAACTCTGACCTGGAGGTGGCATCTGTCCTATTTAAAG         CT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100251 TTAACTCTGACCTGGAGGTGGCATCTGTCCTATTTAAAGGTT...TAGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAATGCAATATCCATACATCTCCTTCTCCGGGAATTCAAGTAAGGCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101596 GAATGCAATATCCATACATCTCCTTCTCCGGGAATTCAAGTAAGGCATGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTACACCCCCTCTACAACAAAGCATTTCTCACCCATAAAACAGTCAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101646 CTACACCCCCTCTACAACAAAGCATTTCTCACCCATAAAACAGTCAACCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CTTTAACCAACAAACACAGAGGAAATGAGGTCTCTACCACACCTCTGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101696 CTTTAACCAACAAACACAGAGGAAATGAGGTCTCTACCACACCTCTGTTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GCAAATT         CTTTGTCTGTTCACCAGTTGGCTGCTCAGGGAGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101746 GCAAATTGTA...CAGCTTTGTCTGTTCACCAGTTGGCTGCTCAGGGAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GATGCTCTATCTGGCTACTCGTATCGAACAAG         AAAATGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 105276 GATGCTCTATCTGGCTACTCGTATCGAACAAGGTA...TAGAAAATGTTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCAATCACACGGATGAAGAAGGATTTACTCCTCTGATGTGGGCTGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107306 TCAATCACACGGATGAAGAAGGATTTACTCCTCTGATGTGGGCTGCAGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CACGGGCAAATAGCTGTGGTAGAGTTCCTACTTCAGAAT         GG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 107356 CACGGGCAAATAGCTGTGGTAGAGTTCCTACTTCAGAATGTA...CAGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGCTGATCCCCAACTTTTAGGAAAAGGTCGAGAAAGTGCACTGTCGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107898 TGCTGATCCCCAACTTTTAGGAAAAGGTCGAGAAAGTGCACTGTCGTTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CCTGTAGTAAAGGCTACACAGATATTGTCAAAATGCTGCTTGATTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107948 CCTGTAGTAAAGGCTACACAGATATTGTCAAAATGCTGCTTGATTGTGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GTTGATGTAAATGAATATGATTGG         AATGGAGGAACACCTCT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 107998 GTTGATGTAAATGAATATGATTGGGTA...CAGAATGGAGGAACACCTCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GCTTTATGCTGTACATGGAAATCATGTGAAATGTGTAAAGATGCTCTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108511 GCTTTATGCTGTACATGGAAATCATGTGAAATGTGTAAAGATGCTCTTAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806          AAAGTGGGGCTGATCCAACAATTGAAACTGACTCTGGATAT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108561 GTA...TAGAAAGTGGGGCTGATCCAACAATTGAAACTGACTCTGGATAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AATTCTATGGATCTAGCTGTAGCCCTAGGCTATAGAAGTG         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 109437 AATTCTATGGATCTAGCTGTAGCCCTAGGCTATAGAAGTGGTA...TAGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TCAACAGGTTATTGAGTCACATTTGTTGAAGCTGCTTCAAAATATCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110031 TCAACAGGTTATTGAGTCACATTTGTTGAAGCTGCTTCAAAATATCAAGG

   1000 
    938 AG
        ||
 110081 AG