seq1 = pF1KB6436.tfa, 933 bp
seq2 = pF1KB6436/gi568815592r_170477562.tfa (gi568815592r:170477562_170684581), 207020 bp

>pF1KB6436 933
>gi568815592r:170477562_170684581 (Chr6)

(complement)

1-90  (100001-100090)   100% ->
91-184  (100190-100283)   100% ->
185-427  (100835-101077)   100% ->
428-559  (101394-101525)   100% ->
560-663  (104477-104580)   100% ->
664-777  (105612-105725)   100% ->
778-933  (106865-107020)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCCGCCGGGGCCAGGCCTGTGGAGCTGGGCTTCGCCGAGTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGCCGCCGGGGCCAGGCCTGTGGAGCTGGGCTTCGCCGAGTCGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCGGCGTGGCGACTGCGCAGCGAGCAGTTCCCCAGCAAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100051 GCCGGCGTGGCGACTGCGCAGCGAGCAGTTCCCCAGCAAGGTG...CAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGTATGCGCCGCTGCCTGGCCGCCCGGACGCCTTCCACCGCTGCATCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100191 TGTATGCGCCGCTGCCTGGCCGCCCGGACGCCTTCCACCGCTGCATCTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTCTTCTGCTGCCGCGAGCAGCCGTGCTGTGCCGGCCTGCGAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100241 CTCTTCTGCTGCCGCGAGCAGCCGTGCTGTGCCGGCCTGCGAGGTG...T

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    185   TTTTTAGGAATCAACTACCCAGGAAAAACGATTTTTACTCATATGAGC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100833 AGTTTTTAGGAATCAACTACCCAGGAAAAACGATTTTTACTCATATGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CACCTTCTGAGAATCCTCCCCCAGAAACAGGAGAATCAGTGTGTCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100883 CACCTTCTGAGAATCCTCCCCCAGAAACAGGAGAATCAGTGTGTCTCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTTAAGTCTGGTGCTCATCTCTGCAGGGTTTGTGGCTGTTTAGGCCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100933 CTTAAGTCTGGTGCTCATCTCTGCAGGGTTTGTGGCTGTTTAGGCCCCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AACGTGCTCCAGATGCCACAAAGCATATTACTGCAGCAAGGAGCATCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100983 AACGTGCTCCAGATGCCACAAAGCATATTACTGCAGCAAGGAGCATCAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCCTAGACTGGAGATTGGGACATAAGCAGGCTTGTGCACAACCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 101033 CCCTAGACTGGAGATTGGGACATAAGCAGGCTTGTGCACAACCAGGTG..

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    428     ATCATCTGGACCATATAATTCCAGACCACAACTTCCTTTTTCCAGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101083 .CAGATCATCTGGACCATATAATTCCAGACCACAACTTCCTTTTTCCAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ATTTGAAATTGTAATAGAAACAGAAGATGAGATTATGCCTGAGGTTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101440 ATTTGAAATTGTAATAGAAACAGAAGATGAGATTATGCCTGAGGTTGTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AAAAGGAAGATTACTCAGAGATTATAGGGAGCATGG         GTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 101490 AAAAGGAAGATTACTCAGAGATTATAGGGAGCATGGGTA...CAGGTGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GCACTTGAGGAAGAACTGGATTCCATGGCAAAACATGAATCCAGGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104482 GCACTTGAGGAAGAACTGGATTCCATGGCAAAACATGAATCCAGGGAAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TAAAATTTTTCAGAAGTTTAAAACTCAGATAGCCCTTGAACCAGAACAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 104532 TAAAATTTTTCAGAAGTTTAAAACTCAGATAGCCCTTGAACCAGAACAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    664         ATTCTTAGATATGGCAGAGGTATTGCCCCCATCTGGATTTCT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104582 TA...TAGATTCTTAGATATGGCAGAGGTATTGCCCCCATCTGGATTTCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GGTGAAAATATTCCTCAAGAAAAGGATATTCCAGATTGCCCCTGTGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105654 GGTGAAAATATTCCTCAAGAAAAGGATATTCCAGATTGCCCCTGTGGTGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CAAGAGAATATTGGAATTCCAG         GTCATGCCTCAGCTCCTAA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 105704 CAAGAGAATATTGGAATTCCAGGTA...CAGGTCATGCCTCAGCTCCTAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ACTACCTGAAGGCTGACAGACTGGGCAAGAGCATTGACTGGGGCATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106884 ACTACCTGAAGGCTGACAGACTGGGCAAGAGCATTGACTGGGGCATCCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GCTGTCTTCACCTGTGCTGAGAGCTGCAGCTTGGGTACTGGCTATACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106934 GCTGTCTTCACCTGTGCTGAGAGCTGCAGCTTGGGTACTGGCTATACAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .
    897 AGAATTTGTGTGGAAGCAGGATGTAACAGATACACCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106984 AGAATTTGTGTGGAAGCAGGATGTAACAGATACACCG