seq1 = pF1KB6432.tfa, 1032 bp
seq2 = pF1KB6432/gi568815584r_36199086.tfa (gi568815584r:36199086_36420588), 221503 bp

>pF1KB6432 1032
>gi568815584r:36199086_36420588 (Chr14)

(complement)

1-129  (100001-100129)   98% ->
130-249  (103777-103896)   100% ->
250-474  (105674-105898)   100% ->
475-571  (105981-106077)   100% ->
572-637  (108565-108630)   100% ->
638-790  (108864-109016)   100% ->
791-888  (112400-112497)   100% ->
889-927  (119766-119804)   100% ->
928-1032  (121399-121503)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCTGCCACGGAGCATAATCGCCCGAGCAGCGGTGACAGGAACCT
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGCTGCCACGGAGCTTAATCGCCCGAGCAGCGGTGACAGGAACCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGCGAAGATGCAGCCCCAACCTCTCCCGAGAGGTGCTCTACGAAATCT
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGCGAAGATGCAGACCCAACCTCTCCCGAGAGGTGCTCTACGAAATCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTCGCTCCCTACACACCCTGGTTGGACAG         CTTGACCTCAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100101 TTCGCTCCCTACACACCCTGGTTGGACAGGTG...AAGCTTGACCTCAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GATGATGTGGTGAAAATTACAATCGATTGGAACAAGCTCCAGAGCCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103789 GATGATGTGGTGAAAATTACAATCGATTGGAACAAGCTCCAGAGCCTCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGCATTCCAGCCTGCATTGCTCTTTAGTGCACTTGAACAACACATTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103839 GGCATTCCAGCCTGCATTGCTCTTTAGTGCACTTGAACAACACATTTTAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATTTACAG         CCTTTTTTAGCAAAACTTCAGTCTCCGATTAAA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 103889 ATTTACAGGTA...CAGCCTTTTTTAGCAAAACTTCAGTCTCCGATTAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGGAGAATACAACTGCTGTTGAAGAGATAGGAAGAACAGAAATGGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105707 GAGGAGAATACAACTGCTGTTGAAGAGATAGGAAGAACAGAAATGGGGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAAAAATGAAGTAAATGACAAATTTTCCATTGGCGACCTACAAGAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105757 CAAAAATGAAGTAAATGACAAATTTTCCATTGGCGACCTACAAGAGGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAAAGCACAAAGAAAGTGATTTAAGAGATGTGAAAAAGACACAGATCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105807 AAAAGCACAAAGAAAGTGATTTAAGAGATGTGAAAAAGACACAGATCCAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TTTGATCCAGAAGTAGTTCAGATAAAGGCTGGAAAAGCAGAA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 105857 TTTGATCCAGAAGTAGTTCAGATAAAGGCTGGAAAAGCAGAAGTA...TA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    475  ATTGACAGACGAATATCTGCATTTATTGAAAGAAAGCAAGCTGAAATCA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105980 GATTGACAGACGAATATCTGCATTTATTGAAAGAAAGCAAGCTGAAATCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATGAAAACAACGTCAGGGAATTTTGCAATGTTATTGATTGTAATCAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 106030 ATGAAAACAACGTCAGGGAATTTTGCAATGTTATTGATTGTAATCAAGGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    572        AAAATAGTTGTGCAAGAACTGATGCGATTTTTACCCCTTACCC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106080 A...TAGAAAATAGTTGTGCAAGAACTGATGCGATTTTTACCCCTTACCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CGGATTTAAAAGTCACGTAAAAG         TTTCTAGAGTTGTGAATA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 108608 CGGATTTAAAAGTCACGTAAAAGGTA...TAGTTTCTAGAGTTGTGAATA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CATACGGACCACAGACTAGACCTGAAGGAATTCCAGGGTCAGGTCATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108882 CATACGGACCACAGACTAGACCTGAAGGAATTCCAGGGTCAGGTCATAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CCTAACAGCATGCTTCGAGACTGTGGTAATCAGGCTGTAGAAGAACGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108932 CCTAACAGCATGCTTCGAGACTGTGGTAATCAGGCTGTAGAAGAACGACT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 ACAAAATATTGAGGCCCACTTGCGGTTACAGACAG         GTGGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 108982 ACAAAATATTGAGGCCCACTTGCGGTTACAGACAGGTA...TAGGTGGTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CAGTGCCAAGAGACATTTATCAGAGAATTAAAAAACTTGAGGATAAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112406 CAGTGCCAAGAGACATTTATCAGAGAATTAAAAAACTTGAGGATAAAATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CTTGAATTGGAAGGCATCTCTCCTGAATATTTTCAGTCTGTA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 112456 CTTGAATTGGAAGGCATCTCTCCTGAATATTTTCAGTCTGTAGTG...TA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    889  AGCTTTTCTGGAAAAAGAAGAAAAGTTCAACCACCTCAA         C
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 119765 GAGCTTTTCTGGAAAAAGAAGAAAAGTTCAACCACCTCAAGTA...CAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 AGAACTATTCACTGGCTGAACTTGATGAGAAAATTAGTGCCCTCAAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121400 AGAACTATTCACTGGCTGAACTTGATGAGAAAATTAGTGCCCTCAAACAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GCCCTCCTCAGAAAATCAAGAGAAGCAGAATCCATGGCAACCCACCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121450 GCCCTCCTCAGAAAATCAAGAGAAGCAGAATCCATGGCAACCCACCACCT

   1100 
   1029 TCCA
        ||||
 121500 TCCA