seq1 = pF1KB6431.tfa, 936 bp
seq2 = pF1KB6431/gi568815582r_1939927.tfa (gi568815582r:1939927_2147847), 207921 bp

>pF1KB6431 936
>gi568815582r:1939927_2147847 (Chr16)

(complement)

1-139  (100001-100139)   100% ->
140-378  (101482-101720)   100% ->
379-549  (103048-103218)   100% ->
550-709  (104122-104281)   100% ->
710-815  (107610-107715)   100% ->
816-936  (107801-107921)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGTAGTCCGCAGGAGTCCGGCATGACCGCCTTGAGCGCGAGGATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGTAGTCCGCAGGAGTCCGGCATGACCGCCTTGAGCGCGAGGATGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACCCGGAGCCGGAGCCTGGGACCCGGGGCTGGGCCGCGGGGGTGTAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACCCGGAGCCGGAGCCTGGGACCCGGGGCTGGGCCGCGGGGGTGTAGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGAGCCCGGGCCTCTCCGGAGAAGAGAGGCTGCAGCAG         AA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100101 AGGAGCCCGGGCCTCTCCGGAGAAGAGAGGCTGCAGCAGGTA...CAGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCGAGGAAAAGCCACAGCCCCGTGAAGCGTCCGCGGAAAGCACAGAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101484 GCGAGGAAAAGCCACAGCCCCGTGAAGCGTCCGCGGAAAGCACAGAGACT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCGTGTGGCCTATGAGGGCTCGGACAGTGAGAAAGGTGAGGGGGCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101534 GCGTGTGGCCTATGAGGGCTCGGACAGTGAGAAAGGTGAGGGGGCTGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCCTCAAGGTGCCAGTCTGGGAGCCCCAGGACTGGCAGCAACAGCTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101584 CCCTCAAGGTGCCAGTCTGGGAGCCCCAGGACTGGCAGCAACAGCTGGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AACATCCGTGCCATGAGGAACAAAAAGGATGCACCTGTGGACCATCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101634 AACATCCGTGCCATGAGGAACAAAAAGGATGCACCTGTGGACCATCTGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GACTGAGCACTGCTATGACTCCAGTGCCCCCCCAAAG         GTAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 101684 GACTGAGCACTGCTATGACTCCAGTGCCCCCCCAAAGGTA...CAGGTAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCAGGTACCAGGTGCTGCTGTCACTGATGCTCTCCAGCCAAACCAAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103052 GCAGGTACCAGGTGCTGCTGTCACTGATGCTCTCCAGCCAAACCAAAGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CAGGTGACGGCGGGCGCCATGCAGCGACTGCGGGCGCGGGGCCTGACGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103102 CAGGTGACGGCGGGCGCCATGCAGCGACTGCGGGCGCGGGGCCTGACGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGACAGCATCCTGCAGACAGATGATGCCACGCTGGGCAAGCTCATCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103152 GGACAGCATCCTGCAGACAGATGATGCCACGCTGGGCAAGCTCATCTACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCGTCGGTTTCTGGAGG         AGCAAGGTGAAATACATCAAGCAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 103202 CCGTCGGTTTCTGGAGGGTG...CAGAGCAAGGTGAAATACATCAAGCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ACCAGCGCCATCCTGCAGCAGCACTACGGTGGGGACATCCCAGCCTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104146 ACCAGCGCCATCCTGCAGCAGCACTACGGTGGGGACATCCCAGCCTCTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GGCCGAGCTGGTGGCGCTGCCGGGTGTTGGGCCCAAGATGGCACACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104196 GGCCGAGCTGGTGGCGCTGCCGGGTGTTGGGCCCAAGATGGCACACCTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CTATGGCTGTGGCCTGGGGCACTGTGTCAGGCATTG         CAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 104246 CTATGGCTGTGGCCTGGGGCACTGTGTCAGGCATTGGTG...CAGCAGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GACACGCATGTGCACAGAATCGCCAACAGGCTGAGGTGGACCAAGAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107615 GACACGCATGTGCACAGAATCGCCAACAGGCTGAGGTGGACCAAGAAGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AACCAAGTCCCCAGAGGAGACCCGCGCCGCCCTGGAGGAGTGGCTGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107665 AACCAAGTCCCCAGAGGAGACCCGCGCCGCCCTGGAGGAGTGGCTGCCTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 G         GGAGCTGTGGCACGAGATCAATGGACTCTTGGTGGGCTTC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107715 GGTA...CAGGGAGCTGTGGCACGAGATCAATGGACTCTTGGTGGGCTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GGCCAGCAGACCTGTCTGCCTGTGCACCCTCGCTGCCACGCCTGCCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107841 GGCCAGCAGACCTGTCTGCCTGTGCACCCTCGCTGCCACGCCTGCCTCAA

    950     .    :    .    :    .    :
    906 CCAAGCCCTCTGCCCGGCCGCCCAGGGTCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 107891 CCAAGCCCTCTGCCCGGCCGCCCAGGGTCTC