seq1 = pF1KB6427.tfa, 918 bp
seq2 = pF1KB6427/gi568815581r_7001578.tfa (gi568815581r:7001578_7214240), 212663 bp

>pF1KB6427 918
>gi568815581r:7001578_7214240 (Chr17)

(complement)

1-124  (100001-100124)   100% ->
125-241  (105353-105469)   100% ->
242-337  (105684-105779)   100% ->
338-409  (106334-106405)   100% ->
410-496  (106924-107010)   100% ->
497-648  (107090-107241)   100% ->
649-755  (112045-112151)   100% ->
756-918  (112501-112663)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAAGGACTTTCAAGATATCCAGCAGCTGAGCTCGGAGGAAAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAAGGACTTTCAAGATATCCAGCAGCTGAGCTCGGAGGAAAATGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCATCCTTTCCATCAAGGTGAGGGGCCAGGCACTCGCAGGCTGAATCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCATCCTTTCCATCAAGGTGAGGGGCCAGGCACTCGCAGGCTGAATCCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGAGAGGAAATCCATTTTTGAAAG         GGCCACCTCCTGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100101 GGAGAGGAAATCCATTTTTGAAAGGCA...CAGGGCCACCTCCTGCCCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCCCTGGCACAGCGTCTCTGCTCCATGGTCTGCTTCAGTCTGCTTGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105370 CCCCTGGCACAGCGTCTCTGCTCCATGGTCTGCTTCAGTCTGCTTGCCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAGCTTCAACATCCTGCTGCTGGTGGTCATCTGTGTGACTGGGTCCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105420 GAGCTTCAACATCCTGCTGCTGGTGGTCATCTGTGTGACTGGGTCCCAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242          GTGCACAGCTGCAAGCCGAGCTGCGGAGCCTGAAGGAAGCT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105470 GTG...AAGGTGCACAGCTGCAAGCCGAGCTGCGGAGCCTGAAGGAAGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTCAGCAACTTCTCCTCGAGCACCCTGACGGAGGTCCAGGCAATCAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105725 TTCAGCAACTTCTCCTCGAGCACCCTGACGGAGGTCCAGGCAATCAGCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCACG         GAGGCAGCGTGGGTGACAAGATCACATCCCTAGGAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105775 CCACGGTG...CAGGAGGCAGCGTGGGTGACAAGATCACATCCCTAGGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCAAGCTGGAGAAACAGCAGCAGGACCTGAAAGCAG         ATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 106370 CCAAGCTGGAGAAACAGCAGCAGGACCTGAAAGCAGGTC...TAGATCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GATGCCCTGCTCTTCCATCTGAAGCACTTCCCCGTGGACCTGCGCTTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106929 GATGCCCTGCTCTTCCATCTGAAGCACTTCCCCGTGGACCTGCGCTTCGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GGCCTGCCAGATGGAGCTCCTCCACAGCAACG         GCTCCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 106979 GGCCTGCCAGATGGAGCTCCTCCACAGCAACGGTA...CAGGCTCCCAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 GGACCTGCTGCCCCGTCAACTGGGTGGAGCACCAAGGCAGCTGCTACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107099 GGACCTGCTGCCCCGTCAACTGGGTGGAGCACCAAGGCAGCTGCTACTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TTCTCTCACTCCGGGAAGGCCTGGGCTGAGGCGGAGAAGTACTGCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107149 TTCTCTCACTCCGGGAAGGCCTGGGCTGAGGCGGAGAAGTACTGCCAGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GGAGAACGCACACCTGGTGGTCATCAACTCCTGGGAGGAGCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 107199 GGAGAACGCACACCTGGTGGTCATCAACTCCTGGGAGGAGCAGGTG...C

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    649   AAATTCATTGTACAACACACGAACCCCTTCAATACCTGGATAGGTCTC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112043 AGAAATTCATTGTACAACACACGAACCCCTTCAATACCTGGATAGGTCTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ACGGACAGTGATGGCTCTTGGAAATGGGTGGATGGCACAGACTATAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112093 ACGGACAGTGATGGCTCTTGGAAATGGGTGGATGGCACAGACTATAGGCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CAACTACAA         GAACTGGGCTGTCACTCAGCCAGATAATTGGC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 112143 CAACTACAAGTA...TAGGAACTGGGCTGTCACTCAGCCAGATAATTGGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 ACGGGCACGAGCTGGGTGGAAGTGAAGACTGTGTTGAAGTCCAGCCGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112533 ACGGGCACGAGCTGGGTGGAAGTGAAGACTGTGTTGAAGTCCAGCCGGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GGCCGCTGGAACGATGACTTCTGCCTGCAGGTGTACCGCTGGGTGTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112583 GGCCGCTGGAACGATGACTTCTGCCTGCAGGTGTACCGCTGGGTGTGTGA

    950     .    :    .    :    .    :
    888 GAAAAGGCGGAATGCCACCGGCGAGGTGGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 112633 GAAAAGGCGGAATGCCACCGGCGAGGTGGCC