seq1 = pF1KB6420.tfa, 1017 bp
seq2 = pF1KB6420/gi568815575f_70033948.tfa (gi568815575f:70033948_70265978), 232031 bp

>pF1KB6420 1017
>gi568815575f:70033948_70265978 (ChrX)

1-188  (100001-100188)   100% ->
189-482  (100576-100869)   100% ->
483-678  (112686-112881)   100% ->
679-758  (114814-114893)   100% ->
759-871  (116263-116375)   100% ->
872-1017  (131886-132031)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCTGAGGACGAGTTACAGCTGCCGCGGCTCCCCGAGCTGTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGCTGAGGACGAGTTACAGCTGCCGCGGCTCCCCGAGCTGTTCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AACTGGTAGACAGTTACTGGACGAAGTAGAAGTGGCGACTGAACCCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AACTGGTAGACAGTTACTGGACGAAGTAGAAGTGGCGACTGAACCCGCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTTCCCGGATAGTCCAGGAGAAGGTGTTCAAGGGCTTGGACCTCCTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTTCCCGGATAGTCCAGGAGAAGGTGTTCAAGGGCTTGGACCTCCTTGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGGCTGCCGAAATGTTATCGCAGCTCGACTTGTTCAG         CCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100151 AAGGCTGCCGAAATGTTATCGCAGCTCGACTTGTTCAGGTA...CAGCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AAATGAAGATTTGGAAGAGATTGCTTCCACCGACCTGAAGTACCTTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100579 AAATGAAGATTTGGAAGAGATTGCTTCCACCGACCTGAAGTACCTTTTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGCCAGCGTTTCAAGGAGCCCTCACCATGAAACAAGTCAACCCCAGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100629 TGCCAGCGTTTCAAGGAGCCCTCACCATGAAACAAGTCAACCCCAGCAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CGTCTAGATCATTTGCAGCGGGCTCGAGAACACTTTATAAACTACTTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100679 CGTCTAGATCATTTGCAGCGGGCTCGAGAACACTTTATAAACTACTTAAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TCAGTGCCATTGCTATCATGTGGCAGAGTTTGAGCTGCCCAAAACCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100729 TCAGTGCCATTGCTATCATGTGGCAGAGTTTGAGCTGCCCAAAACCATGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACAACTCTGCTGAAAATCACACTGCCAATTCCTCCATGGCTTATCCTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100779 ACAACTCTGCTGAAAATCACACTGCCAATTCCTCCATGGCTTATCCTAGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CTCGTTGCTATGGCATCTCAAAGACAGGCTAAAATACAGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100829 CTCGTTGCTATGGCATCTCAAAGACAGGCTAAAATACAGAGGTG...CAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 ATACAAGCAGAAGAAGGAGTTGGAGCATAGGTTGTCTGCAATGAAATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112686 ATACAAGCAGAAGAAGGAGTTGGAGCATAGGTTGTCTGCAATGAAATCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CTGTGGAAAGTGGTCAAGCAGATGATGAGCGTGTTCGTGAATATTATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112736 CTGTGGAAAGTGGTCAAGCAGATGATGAGCGTGTTCGTGAATATTATCTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTTCACCTTCAGAGGTGGATTGATATCAGCTTAGAAGAGATTGAGAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112786 CTTCACCTTCAGAGGTGGATTGATATCAGCTTAGAAGAGATTGAGAGCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TGACCAGGAAATAAAGATCCTGAGAGAAAGAGACTCTTCAAGAGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 112836 TGACCAGGAAATAAAGATCCTGAGAGAAAGAGACTCTTCAAGAGAGGTA.

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679      GCATCAACTTCTAACTCATCTCGCCAGGAGAGGCCTCCAGTGAAA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112886 ..TAGGCATCAACTTCTAACTCATCTCGCCAGGAGAGGCCTCCAGTGAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CCCTTCATTCTCACTCGGAACATGGCTCAAGCCAA         AGTATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 114859 CCCTTCATTCTCACTCGGAACATGGCTCAAGCCAAGTA...CAGAGTATT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TGGAGCTGGTTATCCAAGTCTGCCAACTATGACGGTGAGTGACTGGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116269 TGGAGCTGGTTATCCAAGTCTGCCAACTATGACGGTGAGTGACTGGTATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AGCAACATCGGAAATATGGAGCATTACCGGATCAGGGAATAGCCAAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116319 AGCAACATCGGAAATATGGAGCATTACCGGATCAGGGAATAGCCAAGGCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GCACCAG         AGGAATTCAGAAAAGCAGCTCAGCAACAGGAAGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116369 GCACCAGGTA...TAGAGGAATTCAGAAAAGCAGCTCAGCAACAGGAAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 ACAAGAAGAAAAGGAGGAAGAGGATGATGAACAAACACTCCACAGAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131920 ACAAGAAGAAAAGGAGGAAGAGGATGATGAACAAACACTCCACAGAGCCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 GGGAGTGGGATGACTGGAAGGACACCCATCCTAGGGGCTATGGGAACCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131970 GGGAGTGGGATGACTGGAAGGACACCCATCCTAGGGGCTATGGGAACCGA

   1050     .    :
   1006 CAGAACATGGGC
        ||||||||||||
 132020 CAGAACATGGGC