seq1 = pF1KB6419.tfa, 927 bp
seq2 = pF1KB6419/gi568815584f_60634863.tfa (gi568815584f:60634863_61068346), 433484 bp

>pF1KB6419 927
>gi568815584f:60634863_61068346 (Chr14)

1-89  (100001-100089)   100% ->
90-242  (161355-161507)   100% ->
243-316  (163225-163298)   100% ->
317-420  (173463-173566)   100% ->
421-561  (177125-177265)   100% ->
562-687  (183860-183985)   100% ->
688-814  (244852-244977)   99% ->
815-927  (333372-333484)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACGATCAGGGTTGCCCTCGGTGTAAGACCACCAAATATCGGAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACGATCAGGGTTGCCCTCGGTGTAAGACCACCAAATATCGGAACCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCCTTGAAGCTGATGGTGAATGTGTGCGGACACACTCT         CT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100051 CTCCTTGAAGCTGATGGTGAATGTGTGCGGACACACTCTGTG...CAGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTGAAAGTTGTGTAGATTTACTGTTTGTGAGAGGAGCTGGAAACTGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161357 GTGAAAGTTGTGTAGATTTACTGTTTGTGAGAGGAGCTGGAAACTGCCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGTGTGGTACTCCACTCAGAAAGAGCAACTTCAGGGTACAACTCTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161407 GAGTGTGGTACTCCACTCAGAAAGAGCAACTTCAGGGTACAACTCTTTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGATCCCACTGTTGACAAGGAGGTTGAGATCAGGAAAAAAGTGCTAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161457 AGATCCCACTGTTGACAAGGAGGTTGAGATCAGGAAAAAAGTGCTAAAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 T         ATACAATAAAAGGGAAGAAGATTTTCCTAGTCTAAGAGAA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161507 TGTA...AAGATACAATAAAAGGGAAGAAGATTTTCCTAGTCTAAGAGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TACAATGATTTCTTGGAAGAAGTGGAAGAAATTG         TTTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 163265 TACAATGATTTCTTGGAAGAAGTGGAAGAAATTGGTA...CAGTTTTCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CTTGACCAACAATGTGGATTTGGACAACACCAAAAAGAAAATGGAGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173470 CTTGACCAACAATGTGGATTTGGACAACACCAAAAAGAAAATGGAGATAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACCAAAAGGAAAACAAAGATGTTATTCAGAAAAATAAATTAAAGCTG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 173520 ACCAAAAGGAAAACAAAGATGTTATTCAGAAAAATAAATTAAAGCTGGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    421       ACTCGAGAACAGGAAGAACTGGAAGAAGCTTTAGAAGTGGAACG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173570 ...TAGACTCGAGAACAGGAAGAACTGGAAGAAGCTTTAGAAGTGGAACG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 ACAGGAAAATGAACAAAGAAGATTATTTATACAAAAAGAAGAACAACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177169 ACAGGAAAATGAACAAAGAAGATTATTTATACAAAAAGAAGAACAACTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGCAGATTCTAAAAAGGAAGAATAAGCAGGCTTTTTTAGATGAGCTG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 177219 AGCAGATTCTAAAAAGGAAGAATAAGCAGGCTTTTTTAGATGAGCTGGTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    562       GAGAGTTCTGATCTCCCTGTTGCTCTGCTTTTGGCTCAGCATAA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177269 ...CAGGAGAGTTCTGATCTCCCTGTTGCTCTGCTTTTGGCTCAGCATAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AGATAGATCTACCCAATTAGAAATGCAACTTGAGAAACCCAAACCTGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183904 AGATAGATCTACCCAATTAGAAATGCAACTTGAGAAACCCAAACCTGTAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AACCAGTGACGTTTTCCACAGGCATCAAAATG         GGTCAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 183954 AACCAGTGACGTTTTCCACAGGCATCAAAATGGTA...CAGGGTCAACAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ATTTCACTGGCACCTATTCACAAGCTTGAAGAAGCTCTGTATGAATACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244861 ATTTCACTGGCACCTATTCACAAGCTTGAAGAAGCTCTGTATGAATACCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GCCACTGCAGATAGAGACATATGGACCACATGTTCCTGAGCTTGAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244911 GCCACTGCAGATAGAGACATATGGACCACATGTTCCTGAGCTTGAGATGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TAGGAAGACTTGGGTATT         TAAACCATGTCAGAGCTGCCTCA
        |||||||||||||||||->>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 244961 TAGGAAGACTTGGGTAT GTG...ATTTAAACCATGTCAGAGCTGCCTCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CCACAGGACCTTGCTGGAGGCTATACTTCTTCTCTTGCTTGTCACAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 333395 CCACAGGACCTTGCTGGAGGCTATACTTCTTCTCTTGCTTGTCACAGAGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :
    888 ACTACAGGATGCATTCAGTGGGCTTTTCTGGCAGCCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 333445 ACTACAGGATGCATTCAGTGGGCTTTTCTGGCAGCCCAGT