seq1 = pF1KB6412.tfa, 1005 bp
seq2 = pF1KB6412/gi568815579r_43548893.tfa (gi568815579r:43548893_43767696), 218804 bp

>pF1KB6412 1005
>gi568815579r:43548893_43767696 (Chr19)

(complement)

1-55  (97577-97631)   100% ->
56-166  (100006-100116)   100% ->
167-310  (102238-102381)   100% ->
311-472  (111057-111218)   100% ->
473-607  (112124-112258)   100% ->
608-754  (115326-115472)   100% ->
755-1005  (118554-118804)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGTCACCCGCCGCTGCTGCCGCTGCTGCTGCTGCTCCACACCTGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  97577 ATGGGTCACCCGCCGCTGCTGCCGCTGCTGCTGCTGCTCCACACCTGCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCAG         CCTCTTGGGGCCTGCGGTGCATGCAGTGTAAGACCA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  97627 CCCAGGTA...CAGCCTCTTGGGGCCTGCGGTGCATGCAGTGTAAGACCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACGGGGATTGCCGTGTGGAAGAGTGCGCCCTGGGACAGGACCTCTGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100042 ACGGGGATTGCCGTGTGGAAGAGTGCGCCCTGGGACAGGACCTCTGCAGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCACGATCGTGCGCTTGTGGGAAG         AAGGAGAAGAGCTGGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100092 ACCACGATCGTGCGCTTGTGGGAAGGTG...CAGAAGGAGAAGAGCTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCTGGTGGAGAAAAGCTGTACCCACTCAGAGAAGACCAACAGGACCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102254 GCTGGTGGAGAAAAGCTGTACCCACTCAGAGAAGACCAACAGGACCCTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCTATCGGACTGGCTTGAAGATCACCAGCCTTACCGAGGTTGTGTGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102304 GCTATCGGACTGGCTTGAAGATCACCAGCCTTACCGAGGTTGTGTGTGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTAGACTTGTGCAACCAGGGCAACTCTG         GCCGGGCTGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 102354 TTAGACTTGTGCAACCAGGGCAACTCTGGTG...CAGGCCGGGCTGTCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CTATTCCCGAAGCCGTTACCTCGAATGCATTTCCTGTGGCTCATCAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111070 CTATTCCCGAAGCCGTTACCTCGAATGCATTTCCTGTGGCTCATCAGACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGAGCTGTGAGAGGGGCCGGCACCAGAGCCTGCAGTGCCGCAGCCCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111120 TGAGCTGTGAGAGGGGCCGGCACCAGAGCCTGCAGTGCCGCAGCCCTGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAACAGTGCCTGGATGTGGTGACCCACTGGATCCAGGAAGGTGAAGAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 111170 GAACAGTGCCTGGATGTGGTGACCCACTGGATCCAGGAAGGTGAAGAAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    473         GGCGTCCAAAGGATGACCGCCACCTCCGTGGCTGTGGCTACC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111220 TG...TAGGGCGTCCAAAGGATGACCGCCACCTCCGTGGCTGTGGCTACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TTCCCGGCTGCCCGGGCTCCAATGGTTTCCACAACAACGACACCTTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112166 TTCCCGGCTGCCCGGGCTCCAATGGTTTCCACAACAACGACACCTTCCAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TTCCTGAAATGCTGCAACACCACCAAATGCAACGAGGGCCCAA       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 112216 TTCCTGAAATGCTGCAACACCACCAAATGCAACGAGGGCCCAAGTA...A

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    608   TCCTGGAGCTTGAAAATCTGCCGCAGAATGGCCGCCAGTGTTACAGCT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115324 AGTCCTGGAGCTTGAAAATCTGCCGCAGAATGGCCGCCAGTGTTACAGCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GCAAGGGGAACAGCACCCATGGATGCTCCTCTGAAGAGACTTTCCTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115374 GCAAGGGGAACAGCACCCATGGATGCTCCTCTGAAGAGACTTTCCTCATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GACTGCCGAGGCCCCATGAATCAATGTCTGGTAGCCACCGGCACTCACG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 115424 GACTGCCGAGGCCCCATGAATCAATGTCTGGTAGCCACCGGCACTCACGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    755         AACCGAAAAACCAAAGCTATATGGTAAGAGGCTGTGCAACCG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115474 TG...CAGAACCGAAAAACCAAAGCTATATGGTAAGAGGCTGTGCAACCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CCTCAATGTGCCAACATGCCCACCTGGGTGACGCCTTCAGCATGAACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118596 CCTCAATGTGCCAACATGCCCACCTGGGTGACGCCTTCAGCATGAACCAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 ATTGATGTCTCCTGCTGTACTAAAAGTGGCTGTAACCACCCAGACCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118646 ATTGATGTCTCCTGCTGTACTAAAAGTGGCTGTAACCACCCAGACCTGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TGTCCAGTACCGCAGTGGGGCTGCTCCTCAGCCTGGCCCTGCCCATCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118696 TGTCCAGTACCGCAGTGGGGCTGCTCCTCAGCCTGGCCCTGCCCATCTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GCCTCACCATCACCCTGCTAATGACTGCCAGACTGTGGGGAGGCACTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118746 GCCTCACCATCACCCTGCTAATGACTGCCAGACTGTGGGGAGGCACTCTC

   1050     .
    997 CTCTGGACC
        |||||||||
 118796 CTCTGGACC