seq1 = pF1KB6410.tfa, 1005 bp
seq2 = pF1KB6410/gi568815584r_20347243.tfa (gi568815584r:20347243_20554683), 207441 bp

>pF1KB6410 1005
>gi568815584r:20347243_20554683 (Chr14)

(complement)

1-115  (100001-100115)   100% ->
116-235  (102236-102355)   100% ->
236-411  (102535-102710)   99% ->
412-507  (105418-105513)   100% ->
508-557  (105671-105720)   100% ->
558-636  (105873-105951)   98% ->
637-702  (106513-106578)   100% ->
703-793  (106690-106780)   100% ->
794-869  (106994-107069)   100% ->
870-968  (107164-107262)   100% ->
969-1005  (107405-107441)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGGCGGTGCTGGGTTTTGAAGGCAGCGCCAATAAGATTGGCGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGGCGGTGCTGGGTTTTGAAGGCAGCGCCAATAAGATTGGCGTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGTGGTGCGGGATGGCAAGGTGCTGGCGAACCCGCGGCGGACTTACGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGTGGTGCGGGATGGCAAGGTGCTGGCGAACCCGCGGCGGACTTACGTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCCTCCTGGCACAG         GATTCCTTCCAGGTGATACAGCCAGG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGCCTCCTGGCACAGGTT...TAGGATTCCTTCCAGGTGATACAGCCAGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CATCACCGAGCTGTTATCCTAGACCTGCTGCAGGAGGCACTAACAGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102262 CATCACCGAGCTGTTATCCTAGACCTGCTGCAGGAGGCACTAACAGAGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGGATTAACCTCCCAGGATATCGACTGCATTGCATACACCAAGG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 102312 TGGATTAACCTCCCAGGATATCGACTGCATTGCATACACCAAGGGTA...

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    236    GCCCTGGCATGGGTGCCCCACTGGTTTCTGTGGCTGTTGTGGCCCGT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102532 TAGGCCCTGGCATGGGTGCCCCACTGGTTTCTGTGGCTGTTGTGGCCCGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACTGTGGCCCAGCTGTGGAATAAGCCATTGGTGGGTGTGAACCACTGTAT
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102582 ACTGTGGCCCAACTGTGGAATAAGCCATTGGTGGGTGTGAACCACTGTAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGGCCACATTGAGATGGGCCGCCTCATCACTGGAGCCACCAGCCCAACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102632 AGGCCACATTGAGATGGGCCGCCTCATCACTGGAGCCACCAGCCCAACCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGTTGTATGTGAGTGGAGGAAATACGCAG         GTGATTGCATAC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 102682 TGTTGTATGTGAGTGGAGGAAATACGCAGGTA...TAGGTGATTGCATAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCGGAACATCGTTACCGTATCTTTGGGGAAACCATCGATATTGCAGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105430 TCGGAACATCGTTACCGTATCTTTGGGGAAACCATCGATATTGCAGTGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TAATTGTCTGGATCGTTTTGCTCGAGTGCTGAAG         ATTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 105480 TAATTGTCTGGATCGTTTTGCTCGAGTGCTGAAGGTA...TAGATTTCTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACGACCCAAGTCCAGGATACAACATTGAACAGATGGCAAAGCG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 105678 ACGACCCAAGTCCAGGATACAACATTGAACAGATGGCAAAGCGGTA...T

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    558   AGGCAAGAAGCTGGTTGAGCTGCCATACACTGTAAAGGGGATGGACGT
        >>|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105871 AGAGGCAAGAAGCTAGTTGAGCTGCCATACACTGTAAAGGGGATGGACGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CTCATTCTCAGGGATCCTGTCTTTCATTGAG         GATGTAGCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 105921 CTCATTCTCAGGGATCCTGTCTTTCATTGAGGTG...TAGGATGTAGCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 ATCGGATGCTGGCCACAGGCGAGTGTACTCCTGAGGATCTGTGTTTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106523 ATCGGATGCTGGCCACAGGCGAGTGTACTCCTGAGGATCTGTGTTTCTCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CTGCAG         GAAACTGTGTTTGCAATGCTGGTAGAGATCACAGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106573 CTGCAGGTA...CAGGAAACTGTGTTTGCAATGCTGGTAGAGATCACAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GCGAGCCATGGCACATTGTGGCTCCCAGGAGGCCCTCATTGTGGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106725 GCGAGCCATGGCACATTGTGGCTCCCAGGAGGCCCTCATTGTGGGAGGAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TGGGGT         GTAATGTGAGGCTACAGGAGATGATGGCAACAATG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106775 TGGGGTGTA...TAGGTAATGTGAGGCTACAGGAGATGATGGCAACAATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 TGCCAGGAACGTGGAGCCCGGCTTTTTGCTACAGATGAGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 107029 TGCCAGGAACGTGGAGCCCGGCTTTTTGCTACAGATGAGAGGTA...CAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 ATTCTGTATTGACAATGGAGCGATGATAGCCCAGGCTGGCTGGGAGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107164 ATTCTGTATTGACAATGGAGCGATGATAGCCCAGGCTGGCTGGGAGATGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TTCGGGCTGGACACAGGACCCCACTCAGTGATTCTGGGGTTACACAGAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 107214 TTCGGGCTGGACACAGGACCCCACTCAGTGATTCTGGGGTTACACAGAGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    969         GTATCGGACAGATGAAGTAGAGGTGACCTGGAGGGAC
        >>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107264 TG...CAGGTATCGGACAGATGAAGTAGAGGTGACCTGGAGGGAC