seq1 = pF1KB6395.tfa, 828 bp
seq2 = pF1KB6395/gi568815592r_32740962.tfa (gi568815592r:32740962_32943996), 203035 bp

>pF1KB6395 828
>gi568815592r:32740962_32943996 (Chr6)

(complement)

1-147  (100001-100147)   100% ->
148-295  (100908-101055)   100% ->
296-407  (101214-101325)   100% ->
408-537  (101734-101863)   100% ->
538-742  (102262-102466)   100% ->
743-828  (102950-103035)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGCTACTAGATGTATGCGGAGCCCCCCGAGGGCAGCGGCCGGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGCTACTAGATGTATGCGGAGCCCCCCGAGGGCAGCGGCCGGAATC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCTCTCCCGGTTGCGGGAAGCGGGCGTCGCTCGGACCCAGGACACTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCTCTCCCGGTTGCGGGAAGCGGGCGTCGCTCGGACCCAGGACACTACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTTTCTCTATGCGATCTCCAGAGCTCGCTTTACCCCGGGGAATGCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100101 GTTTCTCTATGCGATCTCCAGAGCTCGCTTTACCCCGGGGAATGCAGGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    148       CCCACAGAATTCTTCCAGTCCCTGGGTGGGGACGGAGAAAGGAA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ...CAGCCCACAGAATTCTTCCAGTCCCTGGGTGGGGACGGAGAAAGGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGTTCAGATTGAGATGGCCCATGGCACCACCACGCTCGCCTTCAAGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100952 CGTTCAGATTGAGATGGCCCATGGCACCACCACGCTCGCCTTCAAGTTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGCATGGAGTGATTGCAGCAGTGGATTCTCGGGCCTCAGCTGGGTCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101002 AGCATGGAGTGATTGCAGCAGTGGATTCTCGGGCCTCAGCTGGGTCCTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATTA         GTGCCTTACGGGTGAACAAGGTGATTGAGATTAACCC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101052 ATTAGTG...CAGGTGCCTTACGGGTGAACAAGGTGATTGAGATTAACCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTACCTGCTTGGCACCATGTCTGGCTGTGCAGCAGACTGTCAGTACTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TTACCTGCTTGGCACCATGTCTGGCTGTGCAGCAGACTGTCAGTACTGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGCGCCTGCTGGCCAAGGAATGCAG         GCTGTACTATCTGCGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 101301 AGCGCCTGCTGGCCAAGGAATGCAGGTA...CAGGCTGTACTATCTGCGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AATGGAGAACGTATTTCAGTGTCGGCAGCCTCCAAGCTGCTGTCCAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101750 AATGGAGAACGTATTTCAGTGTCGGCAGCCTCCAAGCTGCTGTCCAACAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GATGTGCCAGTACCGGGGCATGGGCCTCTCTATGGGCAGTATGATCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101800 GATGTGCCAGTACCGGGGCATGGGCCTCTCTATGGGCAGTATGATCTGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCTGGGATAAGAAG         GGTCCTGGACTCTACTACGTGGATGAA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 101850 GCTGGGATAAGAAGGTG...TAGGGTCCTGGACTCTACTACGTGGATGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CATGGGACTCGGCTCTCAGGAAATATGTTCTCCACGGGTAGTGGGAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102289 CATGGGACTCGGCTCTCAGGAAATATGTTCTCCACGGGTAGTGGGAACAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TTATGCCTACGGGGTCATGGACAGTGGCTATCGGCCTAATCTTAGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102339 TTATGCCTACGGGGTCATGGACAGTGGCTATCGGCCTAATCTTAGCCCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AAGAGGCCTATGACCTTGGCCGCAGGGCTATTGCTTATGCCACTCACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102389 AAGAGGCCTATGACCTTGGCCGCAGGGCTATTGCTTATGCCACTCACAGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GACAGCTATTCTGGAGGCGTTGTCAATA         TGTACCACATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 102439 GACAGCTATTCTGGAGGCGTTGTCAATAGTA...CAGTGTACCACATGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GGAAGATGGTTGGGTGAAAGTAGAAAGTACAGATGTCAGTGACCTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102963 GGAAGATGGTTGGGTGAAAGTAGAAAGTACAGATGTCAGTGACCTGCTGC

    850     .    :    .    :
    806 ACCAGTACCGGGAAGCCAATCAA
        |||||||||||||||||||||||
 103013 ACCAGTACCGGGAAGCCAATCAA