seq1 = pF1KB6394.tfa, 909 bp
seq2 = pF1KB6394/gi568815596r_215939278.tfa (gi568815596r:215939278_216181741), 242464 bp

>pF1KB6394 909
>gi568815596r:215939278_216181741 (Chr2)

(complement)

1-124  (100001-100124)   100% ->
125-258  (115224-115357)   100% ->
259-424  (116265-116430)   100% ->
425-506  (122766-122847)   100% ->
507-603  (130197-130293)   100% ->
604-714  (132369-132479)   100% ->
715-826  (137727-137838)   100% ->
827-909  (142382-142464)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTCCTGGGCTAAGGGCAGGAGCTACCTGGCGCCTGGTTTGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTCCTGGGCTAAGGGCAGGAGCTACCTGGCGCCTGGTTTGCTGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCCAAGTGGCCATCGTCACCGGCGGGGCCACGGGCATCGGAAAAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGCCAAGTGGCCATCGTCACCGGCGGGGCCACGGGCATCGGAAAAGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCGTGAAGGAGCTCCTGGAGCTGG         GGAGTAATGTGGTCATT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100101 TCGTGAAGGAGCTCCTGGAGCTGGGTA...CAGGGAGTAATGTGGTCATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCATCCCGTAAGTTGGAGAGATTGAAGTCTGCGGCAGATGAACTGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115241 GCATCCCGTAAGTTGGAGAGATTGAAGTCTGCGGCAGATGAACTGCAGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAACCTACCTCCCACAAAGCAGGCACGAGTCATTCCCATACAATGCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115291 CAACCTACCTCCCACAAAGCAGGCACGAGTCATTCCCATACAATGCAACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCCGGAATGAGGAGGAG         GTGAATAATTTGGTCAAATCTACC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 115341 TCCGGAATGAGGAGGAGGTA...TAGGTGAATAATTTGGTCAAATCTACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTAGATACTTTTGGTAAGATCAATTTCTTGGTGAACAATGGAGGAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116289 TTAGATACTTTTGGTAAGATCAATTTCTTGGTGAACAATGGAGGAGGCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GTTTCTTTCCCCTGCTGAACACATCAGTTCTAAGGGATGGCACGCTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116339 GTTTCTTTCCCCTGCTGAACACATCAGTTCTAAGGGATGGCACGCTGTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTGAGACCAACCTGACGGGTACCTTCTACATGTGCAAAGCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 116389 TTGAGACCAACCTGACGGGTACCTTCTACATGTGCAAAGCAGGCA...CA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    425  TTTACAGCTCCTGGATGAAAGAGCATGGAGGATCTATCGTCAATATCAT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122765 GTTTACAGCTCCTGGATGAAAGAGCATGGAGGATCTATCGTCAATATCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGTCCCTACTAAAGCTGGATTTCCATTAGCTGT         GCATTCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 122815 TGTCCCTACTAAAGCTGGATTTCCATTAGCTGTGTA...AAGGCATTCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GAGCTGCAAGAGCAGGTGTTTACAACCTCACCAAATCTTTAGCTTTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130205 GAGCTGCAAGAGCAGGTGTTTACAACCTCACCAAATCTTTAGCTTTGGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TGGGCCTGCAGTGGAATACGGATCAATTGTGTTGCCCCT         GG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 130255 TGGGCCTGCAGTGGAATACGGATCAATTGTGTTGCCCCTGTA...CAGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AGTTATTTATTCCCAGACTGCTGTGGAGAACTATGGTTCCTGGGGACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132371 AGTTATTTATTCCCAGACTGCTGTGGAGAACTATGGTTCCTGGGGACAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GCTTCTTTGAAGGGTCTTTTCAGAAAATCCCCGCTAAACGAATTGGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132421 GCTTCTTTGAAGGGTCTTTTCAGAAAATCCCCGCTAAACGAATTGGTGTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CCTGAGGAG         GTCTCCTCTGTGGTCTGCTTCCTACTGTCTCC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 132471 CCTGAGGAGGTA...CAGGTCTCCTCTGTGGTCTGCTTCCTACTGTCTCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGCAGCTTCCTTCATCACTGGACAGTCGGTGGATGTGGATGGGGGCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137759 TGCAGCTTCCTTCATCACTGGACAGTCGGTGGATGTGGATGGGGGCCGGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GTCTCTATACTCACTCGTATGAGGTACCAG         ATCATGACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 137809 GTCTCTATACTCACTCGTATGAGGTACCAGGTG...CAGATCATGACAAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 TGGCCCAAGGGAGCAGGGGACCTTTCTGTTGTCAAAAAGATGAAGGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142393 TGGCCCAAGGGAGCAGGGGACCTTTCTGTTGTCAAAAAGATGAAGGAGAC

    950     .    :    .    :
    888 CTTTAAGGAGAAAGCTAAGCTC
        ||||||||||||||||||||||
 142443 CTTTAAGGAGAAAGCTAAGCTC