seq1 = pF1KB6386.tfa, 903 bp
seq2 = pF1KB6386/gi568815586r_57668999.tfa (gi568815586r:57668999_57872158), 203160 bp

>pF1KB6386 903
>gi568815586r:57668999_57872158 (Chr12)

(complement)

1-185  (100001-100185)   100% ->
186-349  (100902-101065)   100% ->
350-534  (102203-102387)   100% ->
535-648  (102481-102594)   100% ->
649-750  (102755-102856)   100% ->
751-903  (103008-103160)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCGTCATTAACTTGCGCCTCTGGCCTGCGCCTCCACGTGGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGCGTCATTAACTTGCGCCTCTGGCCTGCGCCTCCACGTGGATTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTAGAGAAACCCCGGACTGGGATCATGGCAGCCGAGACTCGGAACGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTAGAGAAACCCCGGACTGGGATCATGGCAGCCGAGACTCGGAACGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGGAGCAGAGGCCCCACCGCCCCAGAAGCGCTACTACCGGCAACGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCGGAGCAGAGGCCCCACCGCCCCAGAAGCGCTACTACCGGCAACGTGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CACTCCAACCCCATGGCGGACCACACGCTGCGCTA         CCCTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100151 CACTCCAACCCCATGGCGGACCACACGCTGCGCTAGTG...TAGCCCTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAAGCCAGAGGAGATGGACTGGTCTGAGCTATACCCAGAGTTCTTCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100908 GAAGCCAGAGGAGATGGACTGGTCTGAGCTATACCCAGAGTTCTTCGCTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CACTCACTCAAAATCAGAGCCACGATGACCCAAAGGATAAGAAAGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100958 CACTCACTCAAAATCAGAGCCACGATGACCCAAAGGATAAGAAAGAAAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AGAGCTCAGGCCCAAGTGGAGTTTGCAGACATAGGCTGTGGCTATGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101008 AGAGCTCAGGCCCAAGTGGAGTTTGCAGACATAGGCTGTGGCTATGGTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCTGTTAG         TGGAACTGTCACCGCTGTTCCCAGACACACTTA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 101058 CCTGTTAGGTA...CAGTGGAACTGTCACCGCTGTTCCCAGACACACTTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTCTGGGTCTGGAGATCCGGGTGAAGGTCTCAGACTATGTACAAGACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102236 TTCTGGGTCTGGAGATCCGGGTGAAGGTCTCAGACTATGTACAAGACCGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ATTCGGGCCCTACGCGCAGCTCCTGCAGGTGGCTTCCAGAACATCGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102286 ATTCGGGCCCTACGCGCAGCTCCTGCAGGTGGCTTCCAGAACATCGCCTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TCTCCGTAGCAATGCCATGAAGCACCTTCCTAACTTCTTCTACAAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102336 TCTCCGTAGCAATGCCATGAAGCACCTTCCTAACTTCTTCTACAAGGGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AG         CTGACAAAGATGTTCTTCCTCTTCCCCGACCCACATTTC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102386 AGGTG...CAGCTGACAAAGATGTTCTTCCTCTTCCCCGACCCACATTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AAGCGGACAAAGCACAAGTGGCGAATCATCAGTCCCACCCTGCTAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102520 AAGCGGACAAAGCACAAGTGGCGAATCATCAGTCCCACCCTGCTAGCAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 ATATGCCTACGTGCTAAGAGTTGGG         GGGCTGGTGTATACCA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 102570 ATATGCCTACGTGCTAAGAGTTGGGGTG...CAGGGGCTGGTGTATACCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TAACCGATGTGCTGGAGCTACACGACTGGATGTGCACTCATTTCGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102771 TAACCGATGTGCTGGAGCTACACGACTGGATGTGCACTCATTTCGAAGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CACCCACTGTTTGAGCGTGTGCCTCTGGAGGACCTG         AGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 102821 CACCCACTGTTTGAGCGTGTGCCTCTGGAGGACCTGGTG...CAGAGTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AGACCCCGTTGTGGGACATCTAGGCACCTCAACTGAGGAGGGGAAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103013 AGACCCCGTTGTGGGACATCTAGGCACCTCAACTGAGGAGGGGAAGAAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TTCTACGTAATGGAGGGAAGAATTTCCCAGCCATCTTCCGAAGAATACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103063 TTCTACGTAATGGAGGGAAGAATTTCCCAGCCATCTTCCGAAGAATACAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    856 GATCCCGTCCTCCAGGCAGTGACCTCCCAAACCAGCCTGCCTGGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103113 GATCCCGTCCTCCAGGCAGTGACCTCCCAAACCAGCCTGCCTGGTCAC