seq1 = pF1KB6376.tfa, 897 bp
seq2 = pF1KB6376/gi568815597r_160179554.tfa (gi568815597r:160179554_160385124), 205571 bp

>pF1KB6376 897
>gi568815597r:160179554_160385124 (Chr1)

(complement)

1-70  (100001-100070)   100% ->
71-180  (101486-101595)   100% ->
181-346  (102016-102181)   100% ->
347-432  (102623-102708)   100% ->
433-594  (102925-103086)   100% ->
595-771  (104879-105055)   100% ->
772-816  (105280-105324)   100% ->
817-897  (105491-105571)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGCCGCTGAGGAAGGCTGTAGTGTCGGGGCCGAAGCGGACAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGCCGCTGAGGAAGGCTGTAGTGTCGGGGCCGAAGCGGACAGGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATTGGAGGAGCTTCTGGAAA         GTGCTCTTGATGATTTCGATA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100051 ATTGGAGGAGCTTCTGGAAAGTA...AAGGTGCTCTTGATGATTTCGATA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAGCCAAACCCTCCCCAGCACCCCCTTCTACCACCACGGCCCCTGATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101507 AAGCCAAACCCTCCCCAGCACCCCCTTCTACCACCACGGCCCCTGATGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCGGGGCCCCAGAAGAGATCGCCAGGAGACACTGCCAAA         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 101557 TCGGGGCCCCAGAAGAGATCGCCAGGAGACACTGCCAAAGTA...CAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGCCCTCTTCGCTTCCCAAGAGAAGTTTTTCCAGGAACTATTCGACAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102018 TGCCCTCTTCGCTTCCCAAGAGAAGTTTTTCCAGGAACTATTCGACAGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AACTGGCTTCCCAAGCCACTGCGGAGTTCGAGAAGGCAATGAAGGAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102068 AACTGGCTTCCCAAGCCACTGCGGAGTTCGAGAAGGCAATGAAGGAGTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCTGAGGAAGAACCCCACCTGGTGGAGCAGTTCCAAAAGCTCTCAGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102118 GCTGAGGAAGAACCCCACCTGGTGGAGCAGTTCCAAAAGCTCTCAGAGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGCAGGGAGAGTGG         GCAGTGATATGACCTCCCAACAAGAAT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 102168 TGCAGGGAGAGTGGGTG...TAGGCAGTGATATGACCTCCCAACAAGAAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCACTTCTTGCCTAAAGGAAACACTAAGTGGATTAGCCAAAAATGCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102650 TCACTTCTTGCCTAAAGGAAACACTAAGTGGATTAGCCAAAAATGCCACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GACCTTCAG         AACTCCAGCATGTCGGAAGAAGAGCTGACCAA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 102700 GACCTTCAGGTG...TAGAACTCCAGCATGTCGGAAGAAGAGCTGACCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GGCCATGGAGGGGCTAGGCATGGACGAAGGGGATGGGGAAGGGAACATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102957 GGCCATGGAGGGGCTAGGCATGGACGAAGGGGATGGGGAAGGGAACATCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TCCCCATCATGCAGAGTATTATGCAGAACCTACTCTCCAAGGATGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103007 TCCCCATCATGCAGAGTATTATGCAGAACCTACTCTCCAAGGATGTGCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TACCCATCACTGAAGGAGATCACAGAAAAG         TATCCAGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 103057 TACCCATCACTGAAGGAGATCACAGAAAAGGTT...TAGTATCCAGAATG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GTTGCAGAGTCATCGGGAATCTCTACCTCCAGAGCAGTTTGAAAAATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104890 GTTGCAGAGTCATCGGGAATCTCTACCTCCAGAGCAGTTTGAAAAATATC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGGAGCAGCACAGCGTCATGTGCAAAATATGTGAGCAGTTTGAGGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104940 AGGAGCAGCACAGCGTCATGTGCAAAATATGTGAGCAGTTTGAGGCAGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ACCCCCACAGACAGTGAAACCACTCAAAAGGCTCGTTTTGAGATGGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104990 ACCCCCACAGACAGTGAAACCACTCAAAAGGCTCGTTTTGAGATGGTGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GGATCTTATGCAGCAG         CTACAAGATTTAGGCCATCCTCCAA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 105040 GGATCTTATGCAGCAGGTA...TAGCTACAAGATTTAGGCCATCCTCCAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AAGAGCTGGCTGGAGAGATG         CCTCCTGGCCTCAACTTTGAC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 105305 AAGAGCTGGCTGGAGAGATGGTG...CAGCCTCCTGGCCTCAACTTTGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CTGGATGCCCTCAATCTTTCGGGCCCACCAGGTGCCAGTGGTGAACAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105512 CTGGATGCCCTCAATCTTTCGGGCCCACCAGGTGCCAGTGGTGAACAGTG

    950     .    :
    888 TCTGATCATG
        ||||||||||
 105562 TCTGATCATG