seq1 = pF1KB6360.tfa, 891 bp
seq2 = pF1KB6360/gi568815577r_17693418.tfa (gi568815577r:17693418_17918318), 224901 bp

>pF1KB6360 891
>gi568815577r:17693418_17918318 (Chr21)

(complement)

1-127  (100001-100127)   100% ->
128-664  (121201-121737)   100% ->
665-727  (123049-123111)   100% ->
728-891  (124738-124901)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACGAAGAGGAGCAGTTTGTAAACATTGATTTGAATGATGACAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACGAAGAGGAGCAGTTTGTAAACATTGATTTGAATGATGACAACAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTGCAGTGTTTGTAAACTGGGAACAGACAAAGAAACACTCTCCTTCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTGCAGTGTTTGTAAACTGGGAACAGACAAAGAAACACTCTCCTTCTGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACATTTGTTTTGAGCTAAATATTGAGG         GGGTACCAAAGTCT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100101 ACATTTGTTTTGAGCTAAATATTGAGGGTA...TAGGGGTACCAAAGTCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GATCTCTTGCACACCAAATCATTAAGGGGCCATAAAGACTGCTTTGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121215 GATCTCTTGCACACCAAATCATTAAGGGGCCATAAAGACTGCTTTGAAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ATACCATTTAATTGCAAACCAGGGTTGTCCTCGATCTAAGCTTTCAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121265 ATACCATTTAATTGCAAACCAGGGTTGTCCTCGATCTAAGCTTTCAAAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GTACTTATGAAGAAGTTAAAACCATTTTGAGTAAGAAGATAAACTGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121315 GTACTTATGAAGAAGTTAAAACCATTTTGAGTAAGAAGATAAACTGGATT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GTGCAGTATGCACAAAATAAGGATCTGGATTCAGATTCTGAATGTTCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121365 GTGCAGTATGCACAAAATAAGGATCTGGATTCAGATTCTGAATGTTCTAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AAACCCCCAGCATCATCTGTTTAATTTCAGGCATAAGCCAGAAGAAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121415 AAACCCCCAGCATCATCTGTTTAATTTCAGGCATAAGCCAGAAGAAAAAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TACTCCCACAGTTTGACTCCCAAGTACCAAAATATTCTGCAAAATGGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121465 TACTCCCACAGTTTGACTCCCAAGTACCAAAATATTCTGCAAAATGGATA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GATGGAAGTGCAGGTGGCATCTCTAACTGTACACAAAGAATTTTGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121515 GATGGAAGTGCAGGTGGCATCTCTAACTGTACACAAAGAATTTTGGAGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GAGGGAAAATACAGACTTTGGACTTTCTATGTTACAAGATTCAGGTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121565 GAGGGAAAATACAGACTTTGGACTTTCTATGTTACAAGATTCAGGTGCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CTTTATGTCGTAACAGTGTATTGTGGCCTCATAGTCACAACCAGGCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121615 CTTTATGTCGTAACAGTGTATTGTGGCCTCATAGTCACAACCAGGCACAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AAAAAAGAAGAGACAATCTCTAGTCCAGAGGCTAATGTCCAGACCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121665 AAAAAAGAAGAGACAATCTCTAGTCCAGAGGCTAATGTCCAGACCCAGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TCCACATTACAGCAGAGAGGAAT         TGAATTCGATGACTCTTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 121715 TCCACATTACAGCAGAGAGGAATGTA...CAGTGAATTCGATGACTCTTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GTGAGGTAGAGCAACTGAATGCAAAGCTCCTACAGCAAATCCAGG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 123067 GTGAGGTAGAGCAACTGAATGCAAAGCTCCTACAGCAAATCCAGGGTA..

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    728     AAGTTTTTGAAGAGTTAACTCACCAAGTGCAAGAAAAAGATTCTTT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123117 .CAGAAGTTTTTGAAGAGTTAACTCACCAAGTGCAAGAAAAAGATTCTTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GGCCTCACAGCTCCATGTCCGCCACGTTGCCATCGAACAGCTTCTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124784 GGCCTCACAGCTCCATGTCCGCCACGTTGCCATCGAACAGCTTCTGAAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 ACTGTTCTAAGTTACCATGTCTGCAAGTAGGGCGAACAGGAATGAAGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124834 ACTGTTCTAAGTTACCATGTCTGCAAGTAGGGCGAACAGGAATGAAGTCG

    900     .    :    .
    874 CACCTACCCATAAACAAC
        ||||||||||||||||||
 124884 CACCTACCCATAAACAAC