seq1 = pF1KB6356.tfa, 885 bp
seq2 = pF1KB6356/gi568815581r_7290388.tfa (gi568815581r:7290388_7493769), 203382 bp

>pF1KB6356 885
>gi568815581r:7290388_7493769 (Chr17)

(complement)

1-243  (99927-100169)   98% ->
244-286  (100261-100303)   100% ->
287-507  (100406-100626)   100% ->
508-669  (100818-100979)   100% ->
670-831  (102975-103136)   100% ->
832-885  (103329-103382)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGGCTACTTGCCCCCCAAAGGCTACGCCCCTTCGCCCCCACCTCC
         |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99927 TTTACAGGCTACTTGCCCCCCAAAGGCTACGCCCCTTCGCCCCCACCTCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTACCCTGTCACCCCTGGGTACCCGGAGCCGGCGCTACATCCTGGGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99977 CTACCCTGTCACCCCTGGGTACCCGGAGCCGGCGCTACATCCTGGGCCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGCAGGCGCCAGTGCCCGCCCAGGTACCTGCCCCAGCTCCCGGCTTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100027 GGCAGGCGCCAGTGCCCGCCCAGGTACCTGCCCCAGCTCCCGGCTTCGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCTTCCCCTCGCCTGGCCCCGTGGCCTTGGGGTCTGCTGCCCCCTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100077 CTCTTCCCCTCGCCTGGCCCCGTGGCCTTGGGGTCTGCTGCCCCCTTCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCCACTGCCAGGGGTGCCTTCTGGCCTCGAATTCCTGGTGCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100127 GCCACTGCCAGGGGTGCCTTCTGGCCTCGAATTCCTGGTGCAGGTG...C

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    244   ATTGATCAGATTTTGATTCACCAGAAGGCTGAGCGAGTGGAAA     
        >>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100259 AGATTGATCAGATTTTGATTCACCAGAAGGCTGAGCGAGTGGAAAGTA..

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    287     CGTTCCTAGGCTGGGAGACCTGTAATCGGTATGAACTGCGCTCTGG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100309 .CAGCGTTCCTAGGCTGGGAGACCTGTAATCGGTATGAACTGCGCTCTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGCCGGGCAGCCCCTGGGTCAGGCGGCCGAGGAGAGCAACTGCTGCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100452 GGCCGGGCAGCCCCTGGGTCAGGCGGCCGAGGAGAGCAACTGCTGCGCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GTCTGTGCTGTGGCGCCCGCCGGCCGCTGCGTGTCCGCCTGGCCGACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100502 GTCTGTGCTGTGGCGCCCGCCGGCCGCTGCGTGTCCGCCTGGCCGACCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGGGACCGTGAGGTGCTGCGTTTGCTCCGCCCGCTGCACTGTGGCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100552 GGGGACCGTGAGGTGCTGCGTTTGCTCCGCCCGCTGCACTGTGGCTGCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTGCTGCCCCTGTGGCCTCCAGGAG         ATGGAAGTACAGGCTC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100602 CTGCTGCCCCTGTGGCCTCCAGGAGGTG...CAGATGGAAGTACAGGCTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CACCAGGCACCACCATTGGCCACGTGCTACAGACCTGGCATCCCTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100834 CACCAGGCACCACCATTGGCCACGTGCTACAGACCTGGCATCCCTTCCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CCCAAGTTCTCCATCCAGGATGCCGATCGCCAGACAGTCTTGCGAGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100884 CCCAAGTTCTCCATCCAGGATGCCGATCGCCAGACAGTCTTGCGAGTGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GGGGCCCTGCTGGACCTGTGGCTGTGGCACAGACACCAACTTTGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100934 GGGGCCCTGCTGGACCTGTGGCTGTGGCACAGACACCAACTTTGAGGTA.

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    670      GTGAAGACTCGGGATGAATCCCGCAGTGTGGGCCGCATCAGCAAG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100984 ..CAGGTGAAGACTCGGGATGAATCCCGCAGTGTGGGCCGCATCAGCAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CAGTGGGGGGGCCTGGTCCGAGAAGCCCTCACAGATGCAGATGACTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103020 CAGTGGGGGGGCCTGGTCCGAGAAGCCCTCACAGATGCAGATGACTTTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CCTACAGTTCCCGCTGGACCTGGATGTGAGGGTGAAGGCTGTGCTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103070 CCTACAGTTCCCGCTGGACCTGGATGTGAGGGTGAAGGCTGTGCTGCTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 GAGCCACATTCCTCATT         GACTACATGTTCTTTGAGAAGCGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 103120 GAGCCACATTCCTCATTGTG...TAGGACTACATGTTCTTTGAGAAGCGA

    900     .    :    .    :    .    :
    856 GGAGGCGCTGGGCCCTCTGCCGTCACCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 103353 GGAGGCGCTGGGCCCTCTGCCGTCACCAGT