seq1 = pF1KB6348.tfa, 879 bp
seq2 = pF1KB6348/gi568815582r_53392415.tfa (gi568815582r:53392415_53600259), 207845 bp

>pF1KB6348 879
>gi568815582r:53392415_53600259 (Chr16)

(complement)

1-42  (100001-100042)   100% ->
43-248  (101664-101869)   100% ->
249-313  (104934-104998)   100% ->
314-414  (105087-105187)   100% ->
415-503  (105655-105743)   100% ->
504-602  (105823-105921)   100% ->
603-710  (106015-106122)   100% ->
711-771  (107507-107567)   100% ->
772-879  (107738-107845)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACCCTTTCTGGAGCATGTCTACAAGCTCTGTACGCAAA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100001 ATGAACCCTTTCTGGAGCATGTCTACAAGCTCTGTACGCAAAGTA...TA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     43  CGATCTGAAGGTGAAGAGAAGACATTAACAGGGGACGTGAAAACCAGTC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101663 GCGATCTGAAGGTGAAGAGAAGACATTAACAGGGGACGTGAAAACCAGTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTCCACGAACTGCACCAAAGAAACAGCTGCCTTCTATTCCCAAAAATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101713 CTCCACGAACTGCACCAAAGAAACAGCTGCCTTCTATTCCCAAAAATGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTGCCCATAACTAAGCCTACATCTCCTGCCCCAGCAGCACAGTCAACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101763 TTGCCCATAACTAAGCCTACATCTCCTGCCCCAGCAGCACAGTCAACAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGGCACGCATGCGTCCTATGGACCCTTCTACCTGGAATACTCTCTTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101813 TGGCACGCATGCGTCCTATGGACCCTTCTACCTGGAATACTCTCTTCTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAGAATT         TACCTTGGTTGTGAAGCAGAAGCTACCAGGCGTC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101863 CAGAATTGTA...TAGTACCTTGGTTGTGAAGCAGAAGCTACCAGGCGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TATGTGCAGCCATCTTATCGCTCTGCATTAA         TGTGGTTTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 104968 TATGTGCAGCCATCTTATCGCTCTGCATTAAGTA...CAGTGTGGTTTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGTAATATTCATACGGCATGGACTTTACCAAGATGGCGTATTTAAGTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105097 AGTAATATTCATACGGCATGGACTTTACCAAGATGGCGTATTTAAGTTTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CAGTTTACATCCCTGATAACTATCCAGATGGTGACTGTCCA         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 105147 CAGTTTACATCCCTGATAACTATCCAGATGGTGACTGTCCAGTA...CAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CGCTTGGTGTTCGATATTCCTGTCTTTCACCCGCTAGTTGATCCCACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105655 CGCTTGGTGTTCGATATTCCTGTCTTTCACCCGCTAGTTGATCCCACCTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AGGTGAGCTGGATGTGAAGAGAGCATTTGCAAAATGGAG         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 105705 AGGTGAGCTGGATGTGAAGAGAGCATTTGCAAAATGGAGGTA...TAGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 GGAACCATAATCATATTTGGCAGGTATTAATGTATGCAAGGAGAGTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105825 GGAACCATAATCATATTTGGCAGGTATTAATGTATGCAAGGAGAGTTTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TACAAGATTGATACAGCAAGCCCCCTGAACCCAGAGGCTGCAGTACT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 105875 TACAAGATTGATACAGCAAGCCCCCTGAACCCAGAGGCTGCAGTACTGTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    603       GTATGAAAAAGATATTCAGCTTTTTAAAAGTAAAGTTGTTGACA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105925 ...CAGGTATGAAAAAGATATTCAGCTTTTTAAAAGTAAAGTTGTTGACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GTGTTAAGGTGTGCACTGCTCGTTTGTTTGACCAACCTAAAATAGAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106059 GTGTTAAGGTGTGCACTGCTCGTTTGTTTGACCAACCTAAAATAGAAGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CCCTATGCAATTAG         CTTTTCTCCATGGAATCCTTCTGTACA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 106109 CCCTATGCAATTAGGTA...AAGCTTTTCTCCATGGAATCCTTCTGTACA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 TGATGAAGCCAGAGAAAAGATGCTGACTCAGAAA         AAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 107534 TGATGAAGCCAGAGAAAAGATGCTGACTCAGAAAGTA...TAGAAGAAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 CTGAAGAACAGCACAATAAAAGTGTTCATGTTGCTGGCCTGTCATGGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107745 CTGAAGAACAGCACAATAAAAGTGTTCATGTTGCTGGCCTGTCATGGGTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 AAGCCTGGCTCAGTACAGCCTTTCAGTAAAGAAGAGAAAACAGTGGCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107795 AAGCCTGGCTCAGTACAGCCTTTCAGTAAAGAAGAGAAAACAGTGGCGAC

    950 
    879 T
        |
 107845 T